《三体》讲了个什么故事？——三体全集大纲(完全剧透版)
为了逻辑通顺，本文主要按照时间顺序，同时兼顾三部曲的写作顺序。
一，宇宙起源以及三体的宇宙观
宇宙在大爆炸后产生，此时的宇宙空间上是十一维度的，光速为无限大，时间有可能有两个维度。此时宇宙的生存环境非常友好，也因此诞生了大量的宇宙文明。文明的生存与发展需要大量资源，各个文明为了争夺资源发生了冲突，爆发了激烈的宇宙战争。随着战争的发展，各个文明逐渐将物理学规律作为武器互相攻击。其中两种主要的物理规律武器就是降维打击以及降光速打击。降维打击将地方所在的空间维度进行降低，空间维度一旦降低，高维空间的结构就会毁灭，高维空间的资源也无法在低维空间使用，低维空间的物理规律也与高维空间完全不同，以此对敌方文明进行毁灭性的破坏。还有一种就是降光速打击，通过抹平空间曲率降低局部地区的光速，使得该区域内的敌方文明的航行速度，通信速度受到限制，当光速降低到星系内的逃逸速度的时候可以将敌方永远困在低光速区。
降维打击与降光速打击都有一个缺点，那就是不可控，一旦高维空间内出现低维空间，由于低维空间能量较低，会使得周围的高维空间主动变成低维空间，最终导致全宇宙都变成低纬空间，整个宇宙出现降维。同理低光速区也会扩散，最后导致宇宙光速越来越低。
到三体故事发生的时代，宇宙空间正在从4维向3维跃迁，大部分宇宙空间已经变成了3维，只有少部分4维时空碎片漂浮在3维空间中。宇宙中的光速也变为了每秒30万千米。
二，魔法时代
公元年，奥斯曼帝国正在大举进攻东罗马帝国的首都君士坦丁堡，君士坦丁堡城防告急。此时一块四维碎片恰好经过君士坦丁堡的一座教堂附近。机缘巧合之下，城内的一名妓女狄奥伦娜在教堂避难时通过四维空间碎片从三维空间进入了四维空间。
由于四维空间比三维空间多出一个坐标纬度，一个在三维空间中封闭的区域对于四维空间是开放的，可以利用四维空间中多出的一个坐标进出。这对于普通人类来说是魔法般的力量。狄奥伦娜发现四维空间的秘密后就去求见君士坦丁十一世，希望利用这种力量刺杀奥斯曼帝国苏丹，作为回报任务成功后君士坦丁十一世要将她封为圣女。
君士坦丁十一世并不相信魔法的存在，提出让狄奥伦娜杀死一个被层层保护的囚犯作为测试。狄奥伦娜进入四维时空，从四维时空内越过重重守卫直接活摘了囚犯的大脑，杀死了囚犯最终取得了君士坦丁十一世的信任。
然而就在狄奥伦娜准备去刺杀苏丹的时候，四维时空碎片离开地球，她再也无法进入四维时空，行动失败。负责监视狄奥伦娜行动的大臣怀疑她可能被敌人策反，最终下手将她杀死。随后君士坦丁堡城破，东罗马帝国灭亡。
三，寂静的春天
年，在一场批斗会中清华大学物理教授叶哲泰因为讲授量子力学理论而受到了批判。他的妻子邵琳虽然善于投机，但依旧因为出身问题不被接纳，为了表忠心，也站出来批斗叶哲泰。叶哲泰用科学理论和几个初中生辩论，最后反而被她们活活打死。而在几天前，他的二女儿叶文雪在武斗中被乱枪打死。不久后邵琳也因为不堪批斗被逼疯，一家人只剩下了大女儿叶文洁，最后被下放到了大兴安岭林场。
这一段里，连载版，小说版和外文版稍微有点区别。主要体现在写作顺序上，连载版和外文版中这一段故事出现在最开头的部分，而小说版中这段故事在汪淼去观察宇宙闪烁的时候借由叶文洁学生的回忆给出。另外还有一些重口味的描写，比如叶文雪死后被人插在铁门的叉子上，当靶子乱枪鞭尸的场景在小说版中也没有出现。
年在林场砍树的叶文洁遇到了前来下乡考察的记者白沐霖，白沐霖在下乡考察的时候发现了人类生产对自然环境的破坏问题，觉得如果把这个问题反应给高层领导可以受到他们的赏识，因此写了一篇内参，上书高层。由于白沐霖在林场劳动体验生活导致手臂酸痛无法提笔，这篇内参由叶文洁代笔誊写。
白沐霖的上书与当时的社会环境不符，很快受到了批判。由于该文是叶文洁代笔，白沐霖为了自保借机推说此文由叶文洁撰写，自己只负责传递，实际上让叶文洁背了黑锅。上级因此派遣了一个特派员程丽华前来调查此事。程丽华借口调查叶文洁，实际上希望挖掘一些与叶哲泰有关的科研人员的“黑料“希望以此整垮一些人，获得升职的资本。她暗示可以帮助叶文洁脱罪，但要求叶文洁指控一些参与两弹一星研究的科研人员。叶文洁不愿意陷害他人拒绝了她的要求，因此受到报复，全身上下被用水淋湿，由于实际值寒冬腊月，很快就患上感冒，高烧不退。
四红岸计划
叶文洁高烧昏迷，醒来的时候发现自己在一架直升飞机上，飞机上还有两个人雷志成和杨卫宁。雷志成是红岸基地的政委，杨卫宁是红岸基地的总工程师。
原来在冷战期间，美苏争霸，中国与二者之间的关系非常紧张，在各个领域都展开了对抗和竞争。当时美苏双方都投入了一部分精力在寻找地外文明。根据接触符号理论，如果哪一方与地外文明取得接触就有很大可能获得竞争优势。我国也不能落后，因此在百忙之中下了一部闲棋，建立的红岸基地开始寻找外星人。
关于接触外星人可以竞争优势这一点，我们展开来说一下。首先，一个国家如果接触到外星人很有可能获得外星人的高等科技技术取得发展优势。其次，先接触到外星人的国家有可能成为外星人在地球上的代言人，在政治上拥有极高地位。第三，即使没有获得任何外星技术和外星人的武力背书，只要接触到了外星人，都可以打着外星人的名义坑蒙拐骗，这一点可以参考太平天国的洪秀全。
当时寻找外星人的主流方案就是利用无线电发送信息。但是这个过程有一个难点，那就是太阳发出的信号会对无线电信号产生强烈的干扰，导致我们无法受收到外星文明向地球发出的信号。因此有必要对太阳的结构进行研究来找到办法排除这种干扰。而叶文洁在读书期间在这个领域的研究很有建树，因此被破例接纳进了红岸基地，过去的事情既往不咎，戴罪立功。
这里再补充一下这三个人的关系与想法。红岸基地按照保密级别大概分为两批人，一批人是普通的技术人员，另一批人是知道红岸基地核心机密的人员。由于后者涉密水平较高，因此一旦进入基地很难再调离，而且基地生活比较艰苦，因此大部分人都不愿意涉足深层机密，而是希望早日调离。杨卫宁开始是力主将叶文洁调入基地的，希望借此保护她免受牢狱之苦，暂时保护她，以后在寻找机会把她调离。相反地，雷志成因为阶级立场问题相当排斥叶文洁。开始时叶文洁并不知道计划的具体内容，雷志成对她谎称红岸基地的目的是反卫星试验，即利用高功率的无线电波摧毁敌方的卫星。随后叶文洁表现了极高的业务水平，雷志成决定利用叶文洁，霸占她的研究成果，自然希望叶文洁永远留在红岸基地。因此到了年，也就是叶文洁在红岸基地工作两年后，雷至成告诉了她红岸的核心机密，让她成为高级涉密人员。但是杨卫宁此时却并不希望叶文洁涉入过深，这样她有可能终生留在红岸基地，因此这个时候杨卫宁对叶文洁的态度并不好。后来雷志成对叶文洁挑明了红岸基地的真实目的，木已成舟，杨卫宁对叶文洁的态度又好了起来。而叶文洁对于红岸基地又是另外一种态度，因为当时的社会环境，作为科研工作者的她很难在外界得到稳定的工作环境。再加上已经家破人亡，无牵无挂，叶文洁也就索性留在基地，好歹有个好的研究环境，尽管知道雷至成实际上利用她也甘心接受。
五恒星际通话
年后，叶文洁了解了红岸基地的核心秘密。上级给她的任务是了解太阳结构同时找出一种方法过滤掉太阳杂波对监听信号的干扰。但是实际上叶文洁对基地任务兴趣不大，她只不过是为了利用这个机会继续自己对太阳结构的研究罢了。雷志成对此心知肚明，但是因为叶文洁的研究成果都会落入他手里，因此也就睁一只眼闭一只眼。
年秋季，叶文洁在阅读资料的时候发现了一篇关于木星发射电磁辐射的观测报告。她对比了红岸基地在当天的信号情况，发现当木星发射电磁辐射的时候，红岸基地的接收系统收到了一小一大两个信号，这两个信号间隔恰好是16min左右，也就是无线电波在地球和太阳间走一个来回需要的时间。叶文洁推断小信号是木星辐射到达地球的接收信号，大信号是太阳反射小信号形成的。关键大信号强度比小信号强度大了上亿倍，因此太阳有放大无线电波信号的功能。而为了利用太阳的信号放大功能要求发射向太阳的无线电波信号功率达到一个最低值，而红岸基地的发射功率恰好能达到这个条件。
叶文洁曾经的太阳结构研究中有一部分模型可以解释这个现象，因此她希望对这个猜想做一个验证。验证的方法有两个，首先联系外国专家搞到木星电磁辐射观测报告，将其中木星辐射的频谱与红岸基地接收的太阳辐射频谱进行对比，这在当时是非常困难的。另一个手段是由红岸基地直接向太阳发射一个信号，然后看看有没有放大的信号回传就可以确定这个猜想。
叶文洁将这个想法向雷至成进行了报告，却遭到他的反对。首先雷至成只希望叶文洁水论文不希望她占用过多资源。其次当时的形势，向太阳发射电池信号是大不敬行为。叶文洁为了验证自己的想法只能偷偷进行发射。由于发生偷偷进行，因此没有时间和人力对基地天线进行调整，只能依靠普通电台在特定频率进行接收。但是太阳在对接收信号进行放大的时候会同时叠加一个正弦波，这是叶文洁没有考虑过的，因此实际的信号没有落入叶文洁指定的接收范围，导致什么也没有收听到。叶文洁因此认为实验失败，自己的理论有错误，也就没有继续进行下去。而实际上实验是成功的，红岸基地发出的信号经过太阳放大上亿倍以后在宇宙中以光速传播。
六三体远征
在距离地球4.3光年外的三体星系，由于生存环境非常恶劣，三体人迫切希望寻找地外文明，开展星际移民。由于三体星系的恒星特点无法使用无线电波放大功能，因此只能被动的接收其他文明的发射信号，因此设立了几千个监听站。在这些监听站中三体号监听员首先接收到了叶文洁发出的信息，这些信息里有详细的关于地球环境的描述，从这些描述中，号了解了地球的环境，与三体星系截然不同。
按照正常逻辑，号监听员应该发出信息引诱对方回复，确定对方位置并且向上级汇报。这样的话三体星系就能派出太空舰队占领殖民对方星系，然后进行星系移民摆脱恶劣的环境。但是号监听员并没有如此操作，主要的原因如下：第一，由于生活环境恶劣，三体人有一套严苛的价值观和社会体系，号监听元如果将信息上报，并不会被视为功臣，相反由于监听系统任务完成，监听站会被撤销，他会失去作用，最后被处死。因此无论他怎么做都无法获得星际移民的机会。第二，号监听员反感三体星系的集权统治，向往地球人美好的生活状态，如果三体星系进攻地球，对地球人进行灭绝，最终会把三体那一套制度在地球上施行，对此他于心不忍。因此号监听员在艰难的抉择后最终回复信息并警告叶文洁，不要回答。
号监听员的行为实际上背叛了三体星系，因为单纯接收到地球信号并不足以判断地球的位置，只能知道大概方向，不能判断距离。但如果他回复的话地球人可以通过信号来回的时间，精确判断三体星系的位置，地球人有可能反过来入侵三体星系。
三体最高元首在得知号监听员的行为的之后，立刻组织太空舰队向信号来源方向进发。这个决定可以说是殊死一搏，因为舰队只有前进方向，根本不知道要走多久，终点在那里。同时他却破天荒的赦免了号监听员的罪行，而是准许他脱水，他要让号活着看到地球文明被毁灭。
从号监听员以及三体领导层的表现来看，这个时期三体星系并没有悟出黑暗森林法则。首先，如果他们领悟到黑暗森林法则的话就会直到部署监听站意义很小，因为大部分文明是倾向于隐藏自己，不会随便对外发射信息。其次，按照三体的策略，接收到信号后会发出引诱信息诱导对方回复。这个行为本身也会暴露三体信息位置，是宇宙文明的大忌。而正是因为与人类接触的契机，三体人推演出了黑暗森林法则，这个过程应当与后来叶文洁的思考是同步的。
七雷至成杨卫宁之死
叶文洁发送信息后继续在红岸基地工作生活，年和杨卫宁结婚。在信息发送之后的第八年也就是年，三体号监听员的信息到达地球。恰好那一天又是叶文洁在值班，通过翻译系统，叶文洁收到了三体号监听员的警告。
在收到信息的时候叶文洁回想起了过往的经历，父亲因为坚持真理被打死，亲人相互陷害，人与人之间相互勾心斗角。这一切都使得叶文洁对人性以及人类社会感到失望。在得知存在一个科技远超过人类的三体文明后，叶文洁认为，三体文明既然科技远超地球，那么思想觉悟与文明的道德水平也远比地救人高。既然这样那就让三体人占领地球管理人类，人类在三体人的教化之下文明水平就会提高，人类间的勾心斗角将不会存在，许多人类悲剧就可以避免，这最终也是三体组织最初的思想基础。在这种思想下，叶文洁向三体人发送了信息，也暴露了地球的位置。
三体号发送的信息很快就被雷至成知道了，原来雷至成一直在红岸基地的计算机中有后门程序。他之所以这么做实际上就是为了监视手下的研究成果，以便第一时间霸占。雷至成找到叶文洁谈话，对她进行了严厉批评，却要叶文洁不要声张。实际上雷至成是在要挟叶文洁，他会替叶文洁保守她通敌的秘密，但是首次和外星人接触的荣誉要归自己。
在与雷至成的交谈中，叶文洁发现，雷至成的后门系统收集信息是间断性的，有一定滞后性。此时雷至成知道三体号监听员发来了信息，但还不知道叶文洁对这个信息进行了回复。而雷至成下一次查看后门系统的时候就会发现叶文洁进行了回复。此时叶文洁唯一的选择就是在此之前杀死雷至成。
叶文洁计划偷偷拧松一个接地螺丝，造成设备故障的假象。出现这种情况，一般要把维修人员用绳子吊到半山腰去检修。由于任务有一定危险性，以她对雷至成的了解，雷至成一定会起带头作用，亲历亲为。这时叶文洁只要将绳索锯断就可以造成意外跌落的假象。
计划原本一切顺利，偏偏好巧不巧，杨卫宁也和雷至成一起下山检修。为了保证自己的秘密不泄漏，叶文洁只好把雷至成连同自己的丈夫一起杀死。也就在这一年叶文洁与杨卫宁的遗腹子杨冬出生，由于杨冬和罗辑是同学，因此可以基本判断罗辑也是年的。
八伊文斯与第二红岸基地
年，叶哲泰得到平反，叶文洁因此回到母校任教，半年以后在一次为射电天文台选址的任务中，叶文洁认识了在西北某山村种树的伊文斯。
伊文斯是一个环保主义者，他的父亲是一个亿万富翁从事石油行业，一次他父亲的油轮沉没，导致了所在海域严重的生态灾难。伊文斯看到当地野生动物的惨状就走上了环保和动物保护的道路。伊文斯之所以在西北种树就是为了保护一种珍稀鸟类。
三年后也就是年，叶文洁再一次应伊文斯的邀请来到那个小山村。这时她才知道，当地政府看到伊文斯种的树已经长大了，竟然以那片森林没有法律保护为由强行对其进行砍伐。这种行为让伊文斯非常失望。其实伊文斯当时已经继承了父亲的巨额遗产，完全有能力保护那片森林，但此时的伊文斯已经对人类非常失望了，他认为即使能够保护这片森林，地球上的其他物种他也没有能力保护，终究是人类的劣根性过于强大了。
伊文斯向叶文洁诉苦，认为已经没有力量来改变人类了。恰好叶文洁也对人类的劣根性有深刻的认识，就这样面对三观相近的友人，叶文洁将三体人存在的秘密告诉了伊文斯。
伊文斯得到三体人存在的信息后立即利用父亲留下的遗产进行活动，招募人员，利用三年的时间终于在年，完成了第二红岸基地的建造。第二红岸基地的发射单元与接收单元建在一艘名叫审判日号的邮轮上。完成第二红岸基地的建造后，伊文斯邀请叶文洁作为地球三体运动的统帅，实际上叶文洁是精神领袖，活动的具体运营主要把控在伊文斯手里。
九智子计划
在说智子计划之前，首先我来统一一下时间线和人物年龄。由于剧情涉及到三体与人类两个文明的时间纪年，同时后期还会出现光速旅行，由于相对论效应的问题会更加导致了时间线混乱。所以以后本文中出现的时间都是太阳系标准纪年。就是假设太阳系内放置一个钟表记录时间和日期，以后宇宙各处无论发生什么事件都以同一时刻这个钟表记录的时间为准。举例来说，后期程心她们会以接近光速到达DX，那么这时候的纪年如何定义呢？我们就假设，程心在DX瞬间穿越回太阳系看一眼太阳系内的钟表，此时的时间就对应着太阳标准时间。此外由于冬眠技术的出现，人物年龄也会混乱，这里统一使用人物的生理年龄，也就是说冬眠过程不记入年龄。
年三体世界收到了叶文洁的回复，由于来回传递信息的时间在8年左右，三体星人终于定位了地球文明。叶文洁第一次发给三体人的信息实际上包含了17K左右的人类社会信息，8年来三体人对这些信息进行了分析，发现人类的技术是在加速发展的。等到年后三体舰队到达地球的时候，地球人的科技水平已经比三体人高了，舰队会覆灭不说，三体星系还有可能被地球反攻。因此必须要遏制地球的科技与生产力的发展。
为了遏制地球，三体利用原本用于建造第二舰队的资源启动了智子计划。这里要再提一个设定，在宇宙高等文明的战争中，降维打击并不是直接将一个维度消除，而是将这个维度压缩到围观层面。用四维空间的降维举例，降维过程中四维空间的一个维度被压缩进了四维空间的微观粒子中，此时这个粒子内部多了一个维度，就不再能够构成四维物体。按照第三部中的说法它会转变为我们三维空间中的质子和电子，构成我们的三维世界。
三体人技术非常发达，可以操作11个宇宙维度中的9个，他们可以把压缩进粒子内部的多维空间展开。即使是一个微观粒子，将内部展开以后也能获得非常大的空间。比如说质子，质子二维展开以后的面积能够覆盖整个三体星。还有后期提到的球状闪电，实际上就是电子的三维展开。
三体能够展开微观粒子并不意味着三体可以对抗降维打击，甚至恢复宇宙原有的维度。主要原因有以下几点：展开微观维度需要消耗大量能量，三体建造的巨型加速器也只能展开一个质子。有点像热力学第二定律，温度只能自发从高温区传递到低温区一样，现实生活中我们虽然能够用空调制冷但是实际上消耗了其他能源。其次，降维过程中的信息损失在维度展开以后不能恢复，就像我们用电脑把图片转化成一个压缩格式，图片的清晰度必然下降，即使我们再用软件把格式转换回去，图片清晰度也不会回到原来的水平而是损失掉了。
三体人将一个质子内部空间的两个维度展开，然后在上面蚀刻电路，蚀刻完成后，这个质子就有计算机的功能了。这个过程异常艰难，甚至有点危险。最终到了年，三体完成了一个智子。
三体的智子有以下几个功能：1.可以自由飞行，速度接近光速2，可以将内部的维度展开或收缩。3.内部可以装载大量资料4.单个智子在收缩成微观粒子后无法从宏观对它进行通信，多个智子可以利用量子纠缠进行超光速通信。
在之后的几年，三体又完成了4个智子，由于4个智子可以组成通信网络，才能保证微观状态下与三体人的通信。在4个智子完成后，所有智子才收缩回微观粒子的状态。年这些智子中的其中两个被发送到地球。
十地球叛军
年伊文斯建立了第二红岸基地，并重新向三体世界发送了信息，同时传送了大量人类社会的情报。三体世界和地球三体组织ETO开始合作，三体世界为ETO传递了大量先进的科技。而ETO的任务就只有一个，那就是阻碍地球科技的发展。他们采用的手段我们都很熟悉，通常有以下几种：
1.通过环保主义等运动引导地球人对科学产生厌恶，阻碍技术的进步；
2.破坏大型科技基础工程，暗杀重要科学家，抑制科学领域的新发现；
3.创造科学无法解释的现象，干扰科研工作者的心理与思想；
随着ETO组织演变，逐渐分化出了降临派，拯救派，幸存派。
降临派最初的思想和叶文洁一样，希望三体降临地球，统治人类，提高人类的道德文明水平，共同建设美好的地球。但是由于伊文斯本人具有强烈的反人类性格，极端憎恨人类，他实际上是希望三体人降临地球灭绝人类，然后在地球上和其他物种和平共存。当然伊文斯对叶文洁隐瞒了这个真实的想法。在伊文斯的影响下，降临派的思想最终也变成和他一样极端。
ETO中另外一个派系是拯救派，他们同情三体世界的悲惨遭遇，对三体人萌生出了类似宗教信仰的感情。他们希望能和三体世界共存，甚至希望通过解决三体问题，让三体世界免于入侵太阳系，让两个文明和平共处。一旦拯救派成功，降临派毁灭人类的目的就不可能实现，因此两派本质上是由尖锐矛盾的。
ETO最后的派系是幸存派，由低级成员组成，没有什么信仰，只是希望为三体人办事，在三体占领地球后受到优待。
一句话概括，最初的降临派就像公知，后来的降临派是恨国党，拯救派是圣母，幸存派是带路党。
由于早期三体组织是伊文斯建立的，第二红岸基地也在他的把控制下，因此降临派在ETO内势力最大。降临派与三体世界的联系原本依靠无限电进行，到了年智子到达地球后，双方的无线电联系中止，此后采用智子进行实时通信。而ETO与三体世界的大部分通信记录与资料被控制在降临派手中。后期拯救派做大，并利用三体游戏招募人员，与降临派开始爆发出矛盾。至于幸存派，随波逐流，没什么影响。
十一球状闪电相关
这里作为背景知识补充一下球状闪电相关内容。三体借助和丰富了一些球状闪电的设定，但这不意味着球状闪电所有的时间线都可以与三体整合。这二者可以理解为平行宇宙中的两条世界线，或者丁仪带着部分剧情穿越到三体里。以下仅就球状闪电剧情中与三体相关的部分进行解说。
年，气象学陈博士和军方的林云共同合作，希望将球状闪电开发成新概念武器。他们在两台直升机之间拉出电弧，然后在直升机的飞行过程中利用电弧扫过天空，成功产生了球状闪电。为了进一步研究球状闪电产生的机理，二人找到了物理学家丁仪。
丁仪通过分析发现球状闪电实际上是宏电子的激发态。这里做一个解释，按照三体的世界观，基本粒子中存在空间维度，这些空间维度是因为降维打击而被收缩进基本粒子中的。一些情况下这些基本维度可以重新展开，例如三体中的智子。而自然界中也存在一些内部维度被展开的基本粒子，比如电子的三维展开就有足球大小，无色透明漂浮在大气中，而且由于质量非常小人们根本感觉不到。但是在遇到雷电的情况下，这些三维展开的电子吸收能量变成激发态，这时候就会发光，也就是人们所看到的球状闪电。
许多关于球状闪电的奇特现象都可以以此解释。首先由于三维电子也具有波粒二相性，因此它们可以穿透墙壁。而当激发态的三维电子向基跃迁的时候会释放能量，这些能量可以杀伤人体，损坏建筑。此外三维电子回到激发态的时候放出的能量是量子和一种或者几种物质作用，这就导致了一些人被球状闪电攻击后身体完全烧毁但衣物安然无恙。
球状闪电对人的攻击实际是量子攻击，被球状闪电攻击后的人，会处于介于“活”与“死”之间的量子叠加状态，实际上和著名的薛定谔的猫是一个状态。而人物最终的状态取决于观测的结果，被球状闪电攻击后，周围的观测者都会对被袭击者做出“死亡”观测，因此被袭击者最终会无限趋向于死亡的状态。但是由于人本身具有意识可以对自己进行观测，因此在被球状闪电攻击后的初期，被袭击者会有一段时间接近与“存活”的状态。在通俗一点举例，人被球状闪电攻击后首先会变成一个幽灵状态，如果这个幽灵不断被正常人看见，就会逐渐消失。在球状闪电中，变成幽灵的人可以向正常人传递信息，他们活动的一些迹象会被正常人发现。但是这些人究竟能在多大程度上干涉现实始终没有定论，一般认为他们对现实的干涉能力极其有限。
丁仪发现球状闪电的秘密后与林云相恋，后来战争爆发，林云力主使用球状闪电武器，却因为敌人的干扰而没有成功。在作战失败后，丁仪发现原子核也有三维展开的宏原子状态，而且这个状态下只要把两个原子核加速到多米/s它们就会发生核聚变，放出比球状闪电更大的力量。林云希望把宏原子聚变作为武器，投入战争中，但遭到了反对。林云本人对武器有着狂热的热爱，为了验证自己心中的武器，她抗命引发了宏原子聚变，给我方和敌方都造成了巨大损失，双方最终握手言和，而林云本人在实验中化为量子幽灵灰飞烟灭。
十二杨冬之死
首先我们要来说一下三体里的危机元年。三体元年应当为7年。这里小说第三部的年表有重大错误，在这里我们统一一下。之所以这么说主要是第一部里明确提到，叶文洁在年之后的38年去世。在连载版中，汪淼出场于寂静的春天之后一章，出场时明确提到是38年后。
到了三体元年，此时丁仪与叶文洁的女儿杨冬成为情侣，并且接近买房订婚。此时的杨冬也成为了一名理论物理学家。二人共同参与了良乡加速器的建造与实验工作，加速器的其中一个任务就是验证杨冬提出的基础物理模型。
此时智子已经到达地球，它们进入各个加速器中，代替目标粒子进行碰撞，然后操纵实验进程，使得实验的结果完全混乱与随机。这样一来人类就无法利用加速器发展物理理论。当时杨冬并不知道这一点，只是因为实验结果不正确开始了对物理学的怀疑。
一个偶然的机会杨冬发现了叶文洁电脑里未删除的资料，发现原来除了地球之外还有其他文明，而自己的母亲实际上与三体人有联系并且是ETO组织的统帅。知道真相后心烦意乱的杨冬，在一个偶然的机会中认识了良乡加速器项目里的一个计算机工程师。计算机工程师向她展示了一个用于模拟地球演化的程序。在这个计算机模拟中，如果给地球演化加上生命这一影响因素，那么地球演化的结果将与不加完全不同。
杨冬意识到，生命对地球乃至宇宙环境有很大的作用，宇宙至今为止的状态，实际上是大量外星文明作用的结果。结合最近实验被干扰，她得出了一个推断，那就是宇宙中物理学的规律很有可能已经被外星文明改变过了。作为一个理论物理学家，她再怎么努力也无法还原宇宙原本的规律。巨大的失落感，再加上知道了朝夕相处的母亲的另一面，双重打击之下，杨冬选择了自杀。
十三汪淼与科学边界
ETO开始在世界各地活动，他们通过煽动环保主义，破坏科技设施建设，暗杀科学家等活动极力阻止人类科学技术的发展。年世界物理年之后，ETO又组织的科学边界组织，表面上是一个科学家探讨学术的松散组织。但是实际上这个组织的目的是在活动中，影响科学家的思想，搞乱他们的思维，让他们对科学丧失信心，在学术上把他们引向歧路。科学边界组织主要祸害的都是基础物理学家，但有一个人是例外，这就是第一部的主角汪淼。汪淼是一个搞纳米材料应用的科学家，但是他开发的纳米材料有可能后续被用于制造太空电梯，大大加速人类进入宇航时代的进程，对三体文明不利。因此汪淼也被盯上，受到了科学边界组织的邀请。
ETO在世界各地的活动越来越多，最终引起了各国政府的注意。各国政府经过互通情报发现他们面对的是一个同一个敌人，虽然对敌人的面貌一无所知，但敌人的目的似乎是搞垮人类科学。共同的敌人使得各国互相合作，组织起来共同应对。在我国也成立了作战中心，负责这项工作的是常伟思少将。常伟思随即将自己曾经的下属，北京公安局的警官史强调入作战中心。史强很有能力但也劣迹斑斑，因此再被调入作战中心的时候也受到了严格限制，简单来说只负责办事，情报之类的事情想都别想。
在科学边界的影响下一些加入科学边界组织的科学家自杀，最终引起了注意。军方发现汪淼也被邀请加入科学边界组织，因此派史强去邀请汪淼去参加作战会议。汪淼来到作战中心惊奇地发现，这场会议不仅邀请了科学家还有北约和美国的观察员，形势似乎非常紧张，但是世界表面上却是一片和平。
会议过程中，丁仪介绍了杨冬自杀的一些情况。常伟思希望汪淼接受邀请加入科学边界，去做军方的卧底。丁仪和汪淼作为科学家并不认为科学边界组织有问题，军方一上来的有罪推定让汪淼非常不高兴，因此，汪淼一开始是拒绝的。这时候史强出言讥讽，他故意对常伟思表示，如果让汪淼去调查，估计也会像其他科学家那样被忽悠的自杀。汪淼对史强印象本来就非常差，于是就中了他的激将法，同意加入科学边界，通过证明科学边界组织没有问题，来证明史强与军方的荒谬。
当天晚上汪淼去见了丁仪，了解了杨冬自杀的情况。丁仪借助台球游戏，告诉了汪淼目前高能粒子实验出现了问题，实验结果表明在微观层面，物理学没有规律可言，这是非常多物理学家自杀的原因。
而在成功忽悠汪淼参与调查后，史强就一直暗中跟踪汪淼，并负责保护他。
十四神迹
由于汪淼的研究非常重要，ETO也开始了对汪淼的干扰。汪淼是个摄影爱好者，ETO就利用智子快速穿过汪淼的照相机，在汪淼拍摄的照片中形成了一个倒计时的字样，这种倒计时非常精确，而且只在汪淼本人拍摄的照片中出现。按照汪淼的科学知识这是一种非正常的超自然现象，汪淼的精神被这种现象扰乱显得心烦意乱。
陷入精神危机的汪淼，思前想后只能去找科学边界的申玉菲交流。汪淼到达申玉菲家中的时候，她正在在楼上利用V装具在玩一种游戏。游戏结束后，申玉菲和汪淼进行了简单的交流，暗示汪淼要停止纳米材料的研究。拜访申玉菲后的第二天一早，汪淼起床后发现，那神秘的倒计时竟然出现在了自己的视野中，这实际上是由于智子高速穿过视网膜导致的。汪淼大惊失色，却无法解释这种现象，医院就医，而医生只认为这是汪淼精神压力过大，产生了幻觉。
从医院回到研究所，正好赶上设备故障，需要一定时间检修。汪淼想起了申玉菲的建议，因此决定暂停实验，检修设备，而就在这时候，汪淼眼前的倒计时停止了。这一下，汪淼确定是科学边界组织搞的鬼，因此打电话去质问申玉菲，汪淼认为这一切不过是一种魔术罢了。申玉菲却不以为然，她表示这是神迹，如果不停止实验，他还会在更大尺度上看到倒计时。申玉菲给了汪淼一个莫尔斯电码网站，同时暗示他在三天以后观测宇宙微波背景辐射。
十五三体游戏
在实验暂停期间，汪淼想起了申玉菲玩过的游戏，觉得可疑，因此自己也找机会登录了一次。这里我们介绍一下三体游戏，三体游戏是拯救派开发的一款VR游戏。游戏的沉浸式体验需要通过V装具进行，V装具就像宇航服一样，穿戴在身上以后可以模拟游戏内的温度变化以及物理打击。
三体游戏包含了至少两个部分，第一阶段是解谜，游戏模拟了三体内部的自然环境，玩家通过在游戏环境内的观察发现三体世界自然环境恶劣的原因。第二阶段是解决，即在发现三体世界秘密后，通过各种方式来解决问题。
三体游戏会根据玩家的文化背景，构件不同的环境场景，实际上是为了让玩家沉浸式的体验三体人的文明发展历程，通过这种方式让玩家对三体世界产生亲近与认同，游戏通关以后，组织就会根据人员的实际情况告诉他们三体世界的存在，邀请他们加入三体组织。
由于三体游戏中，玩家都会感受到三体文明的苦难，因此筛选出来的人都是认同三体文明，同时同情三体文明的人。这些人加入组织实际上冲击了降临派，因为降临派本身厌恶人类，因此他们希望组织成员都有反社会，反人类倾向。
此外三体游戏中还有一个被常常讨论的问题，那就是除了汪淼外的其他角色到底是NPC还是其他玩家。在文中借汪淼之口指出从这些角色的用语来看背后应该是真人。但是在前几场游戏中，许多人物如周文王等思想是极端愚昧的，又不像现代玩家。这里我个人的理解是在汪淼进入游戏后，其他的角色都是真人操控的NPC，其实就是个托儿，用来辅助玩家认识形势的。
十六周文王长夜
汪淼第一次进入三体游戏，游戏的场景是战国时期，他与周文王以及路人甲组队。在游戏过程中他发现这个游戏世界分为恒纪元和乱纪元，恒纪元一切如常与现实世界相同，乱纪元中太阳不像现实世界中这样规律的东升西落，昼夜周期也丝毫没有规律，甚至每次太阳出现大小都不相同。正因为如此这个世界时而非常炎热，时而极端寒冷，人们的生产建设几乎不可能照常进行。为了应对严酷的环境，这里的人们有一个脱水的技能，也就是将体内的水分排出，这样新陈代谢就会停止，身体组织也能长期保存，等待气候温暖之后再重新浸泡。
从周文王口中，汪淼知道了游戏的目的，那就是找到方法精确地预测恒纪元与乱纪元，最大限度地发展文明。同时他还观测到了飞星，一种大概乒乓球大小的白色天体，会在天空中高速运行。在这个世界中一般两颗飞星出现预示着恒纪元即将到来，三颗飞星出现则是回天灭地地寒冷。
汪淼与周文王来到朝歌见到纣王。在他们到来之前伏羲曾经试图让世界永远运行在恒纪元中，可惜遭到了失败。伏羲认为，太阳是一个神，清醒的时候脾气怪异就是乱纪元，反之沉睡的时候就是恒纪元。他建造了一座单摆试图催眠太阳神却惨遭失败。
周文王对此表示不屑，他认为乱纪元是不可避免的，但可以预测，他希望利用占卜的形式指定一份万年历出来，这样王国就可以在乱纪元时脱水休眠，恒纪元时浸泡发展。然而无情的现实，让周文王的妄想化为泡影，他的万年历没有能够预测未来。不久以后天空中出现了三颗飞星，整个星球极度寒冷，连大气中的氮与氧气都凝固化作雪花掉落下来，整个文明彻底毁灭。
十七宇宙闪烁
结束游戏后，汪淼着手观测宇宙微波背景辐射。在丁仪的介绍下，汪淼找到了叶文洁，叶文洁将汪淼介绍给了她的学生沙瑞山。沙瑞山在北京市郊的射电天文台工作，其实验室实时接收宇宙微波背景辐射的数据。宇宙微波背景辐射是大爆炸产生的热辐射在几百亿年的时间内被冷却后形成的，这种辐射是一种厘米波无线电信号，理论上在虽然在空间上会有一点微小的分布不均，但整体上不会随着时间有着特别巨大的变动。故事中汪淼向沙瑞山提出他说要观察的变化大概在1%以上，沙瑞山表示这种变化至少要一百万年以上才能达到。
到了半夜一点，宇宙微波背景辐射真的如申玉菲所预期，出现了1%以上的大浮动变动。而这种变动的信号通过莫尔斯电码进行翻译以后，竟然就是一直困扰汪淼的倒计时。沙瑞山大惑不解，在排除了接收系统故障，卫星被干扰的可能后，他表示，如此大规模的宇宙微波背景辐射变动，实际上可以通过他们开发的一种特制的黑框眼镜观测到。在沙瑞山的介绍下，汪淼回到了市区内的天文馆，取得了3K眼镜，结果直接用肉眼观测到了宇宙在闪烁。
十八三体解谜
汪淼看到了宇宙闪烁，以他的观念，无论是科学边界组织，还是他们背后的力量，能够控制宇宙微波背景辐射都是接近神的力量。那一刻，汪淼的心理彻底崩溃，坐在王府井教堂门口哭了起来。就在这时，史强来到了他的身边，原来这些天史强一直在暗中跟踪保护汪淼。
史强请汪淼吃早点，接着两个人痛饮一番，在安慰汪淼的同时，史强透露了他所知道的有限信息。有一股神秘的实力希望阻碍科技的发展，干扰科学家的思想。这也就是他们目前面对的敌人，为了和这些人对抗，唯一能做的就是好好研究，继续把科研工作做下去，同时三体游戏中应当隐藏了什么秘密。
在史强的鼓励下，汪淼重新振作起来，继续研究，同时再一次登录了三体游戏。这一次游戏场景来到了东汉，汪淼和墨子组队，墨子首先带汪淼回顾了孔子的失败经历，孔子认为世界遵照一定的礼法运行，结果有一天太阳升起到半空中竟然突然消失，那一轮文明也灭亡于严寒之中。墨子认为宇宙是一个精密的机械，了解了这个机械的运行规律就能准确的预测恒纪元与乱纪元。墨子还设计了一套机械，模拟宇宙的运行，用一个人在机器里面进行记录，编制万年历。墨子的努力依旧失败了，这一次太阳虽然照常升起，但是尺寸却比原来大了好几倍，整个文明最终灭亡与烈焰之中。
在这一次游戏中，汪淼与墨子一起观测天象，终于发现了三体世界的秘密。几天后汪淼再次登录，将自己的ID换成了哥白尼，这一次游戏的场景变成了罗马教廷。汪淼公布了自己的发现，这个世界实际上有三颗太阳，他们在引力作用下做着不规则的三体运动。从星系内的行星上观察太阳的升起与落下就完全没有规律。所谓的飞星就是从远处观看恒星时观测到的发光内核。两颗飞星出现预示着行星距离另两颗恒星较远，而被另一颗恒星捕获。三颗飞星出现则预示着行星距离三颗恒星都很远这就是极端的严寒。此外也有文明遇见过两颗太阳同时在天空中出现的情况，这种情况下文明瞬间被烧成灰烬。而就在汪淼道破三体世界的秘密的时候，这一轮文明遇到了3颗太阳同时出现在空中的情况，文明毁灭于烈焰之中。汪淼由于解开了三体世界自然现象的谜团，因此进入了游戏的下一个阶段。
十九关于三体问题的补充
这里我们再来说一下三体问题，三体问题是指三个质量相等或相近的物体，在只有引力的作用下如何定量描述它们的运动规律。三体问题的解大概可以分为两类：通解和特解，通解也就是说对于任意状态下的三体运动都成立的解，这种解按照数学理论是不存在的，因此可以说三体运动就是无规律的。特解，一些特殊情况下可以存在的解，在这种解的描述下，三个质量的球体可以以特殊的轨道稳定运动，比如说一个稳定的特解就是三个恒星绕圈圈。还有一种解，可以叫做拟二体解，算是一种特殊的特解，如果三个球体中有一个球体距离另两个球体非常远，可以看作这个球体对另两个球体没有影响，这样三体问题就会转化为二体问题。
目前宇宙中所有的三恒星星系都可以看作是在拟二体解下运行的，第三颗恒星要么距离其中两颗非常远，要么质量非常小对另外两颗基本没有影响。现实生活中的南门二三星系统就是这样。小说中描述的那种极端的情况在我们的宇宙中并不存在，即使存在也会在漫长的演化过程中把其中一颗恒星抛射出去形成实际意义上的二体运动。
当然作品中的三体运动是小说中的设定，大家没有必要去纠结这东西在现实中是否存在，毕竟科幻不是科学，更不是现实。
另外在这一部分还有一个虚构设定就是飞星，按小说的说法，飞星是恒星的内核，我们平时看到的太阳是恒星的内核+大气。但是从远处观察太阳的时候我们看不到太阳的大气，只能看到内核，这样一来远看太阳和近看太阳就有很大的差别。飞星的设定也与现实中的不同，之所以有这个设定就是为了增大三体人发现三体世界有三颗太阳的难度。要不然三体人发现远处天空中有两颗小太阳，甚至观测到太阳远离自己的过程，他们就会第一时间发现星系的秘密。
二十申玉菲之死
汪淼退出游戏以后接到了史强的电话，让他立刻前往警察局。在那里，汪淼遇见的申玉菲的丈夫魏成。魏成原本是一个落魄的数学天才，寄宿在一间庙里，在庙里闲来无事就开始研究三体问题。有一次申玉菲去庙里为三体文明祈祷，无意间在香炉内发现了魏成残留下来的演算记录。她立刻意识到有人在研究三体问题，而且数学水平非常高。申玉菲找到魏成许诺以优厚的研究条件，要带他下山。
魏成下山后申玉菲许诺的条件一一兑现，他也全力投入三体问题的研究，他采用了一种进化算法，并取得了相当大的成果，然而与彻底解决三体问题依旧相差甚远。在这期间，魏成与申玉菲结婚，但并没有加入科学边界与ETO。
最近魏成受到了不明人士的威胁，要求他停止三体问题的研究。这天半夜，魏成醒来发现申玉菲竟然用枪指着他，要求他不能停止三体问题的研究。魏成吓得赶忙逃到了警察局。由于申玉菲有非法持枪的嫌疑，史强终于找到机会，带队去搜查她家。一队人马到达的时候，申玉菲已经被枪杀。通过魏成的信息得知申玉菲此前和潘寒有过争吵，潘寒具有重大的作案嫌疑。一切结束后，汪淼向潘寒要了一份三体问题算法的介绍。
二十一解算与远征
汪淼再次进入游戏，此时已经进入了游戏的第二阶段。第二阶段的目的就是在知道三体星系有三颗恒星的状态下，通过科学手段求取三个恒星的运行规律，以此来服务生产。汪淼这次登入的场景在东方，他和牛顿和冯-诺依曼组队。在这个副本中，牛顿发现了牛顿定律，同时列出了三体问题的微分方程，由于缺乏边界条件这个方程无法求得解析解，因此只能取得数值解。
二人来到东方准备利用秦始皇的军队，制作一台人列计算机，求解三体运动。他们通过几个士兵，通过口令组成了门电路，再由门电路组成计算机的CPU，内存，总线等结构进行计算。计算在乱纪元进行，消耗了大量资源，但也得出了之后两年的恒星运行规律。然而由于忽略了相对论效应等一系列微扰状况，所得到的计算结果并不准确。这时三体星系出现了三星连珠，三颗太阳连成一条线，叠加的引力将行星的大气和地表物质吸引到太空，整个文明再度毁灭。
汪淼这次游戏之后，系统邀请汪淼参加了一场线下聚会，聚会的组织者是潘寒。这实际上是一次摊牌性质的聚会，聚会首先从三体游戏聊起，自然引述到三体游戏的真实性。潘寒直接摊牌告知众人三体世界的存在，同时考察每一个人言谈中对三体的态度。符合组织价值观的留下，与组织价值观不同的离开。为了卧底进入ETO汪淼也适当表露出了反社会特征，因此最终留在组织内部。
聚会结束后汪淼再次登录三体游戏，这一次他遇到了爱因斯坦。爱因斯坦在这轮文明中发现了相对论，三体人也开发出了计算机，但对于三体问题的求解依然失败了，这最终证明了人类无法预测三体运动的规律。汪淼试图展示魏成的计算方法，却被告知三体人早已有了更加高深的算法，但依然无法解决问题。汪淼发现，这个游戏场景中天空中出现了一个巨大的月亮，原来是在上一轮文明中，三体星以极近的距离擦过一颗恒星，整个星球被撕裂成了两半，变成了一个双星系统。文明也就此灭亡。认识到三体问题无解的三体人彻底放弃了编制万年历的努力，他们重新建起了愚昧时代的大单摆，绝望的对命运进行催眠。他们知道即使能将文明发展到高度发达的程度，三体人也无法摆脱灭亡的命运，因为说不定哪天他们的行星就会一头扎进太阳里。唯一能让三体文明延续下去的希望就是星际移民。
三体游戏最终进入了最终章，新一轮的三体文明发展到了宇航时代，他们的星际舰队开始起航，向着4.3光年外的另一个星系进发，而年后，他们将到达那个只有一颗恒星，永远处于恒纪元，天堂一般的太阳系。
二十二黑暗森林谈话
由于汪淼的卧底，军方知道了三体组织下一次聚会的时间与地点，同时拟定了袭击计划。叶文洁冥冥之中有一种不好的预感，参加聚会前，她散布来到了女儿的坟前面，遇到了也来这里散心的罗辑。罗辑是杨冬的同学，人很聪明，但生性散漫。罗辑原本是研究天文学的，后来为了名利改教社会学。叶文洁建议罗辑把天文学和社会学结合起来，搞一门宇宙社会学。实际上多年以来，叶文洁的内心是矛盾的，她对人类死亡因为人类的自私与贪婪害得她家破人亡，她对人类是非常失望的。同时她当年难产快死的时候，是周围的村民为她献血救了她，这些人性的温暖她也看在眼里。同时她虽然认为三体人的文明水平高于人类，但自己也知道这不是绝对的。在与三体接触后的这些年，她也对宇宙文明的形态有过思考，而这些思考表面三体人未必是什么善类。再加上女儿本质上是因为自己而自杀，这些愧疚最终让她向罗辑吐露了这些年的思考。
叶文洁给罗辑的启示有几个要点：1.宇宙社会学是一门演绎法，底层是纯粹的逻辑推理。2.宇宙文明的结构其实很简单，一个文明无论内部形态如何，在外面看来就是天上的一颗星星，一个点。在这个基础上，叶文洁给出了两个基本公理1，生存是文明的唯一需要2.文明会不断增长，但宇宙物质总量不变。此外还给了罗辑两个提示，猜疑链和技术爆炸。而他们这段谈话最终被智子监听到了。
关于叶文洁有没有悟出黑暗森林理论，文中始终没有实锤，加上这一段是第二部补充的，我们也很难从第一部里叶文洁的言行去判断。个人观点，叶文洁大概率悟出了黑暗森林理论，至少是十分接近黑暗森林理论了。原因就在于，她首先提出了宇宙社会学是纯粹的推理，而黑暗森林最精髓的地方就是宇宙文明间的无条件攻击，这是纯粹推理导致的。另外她给出的两个关键词非常浓缩和精准。
二十三伊文斯谈话
叶文洁与罗辑进行谈话的同时，伊文斯也在与三体对话。由于黑暗森林的秘密被罗辑知道，三体向伊文斯下达了命令要求他杀死罗辑。在这个过程中伊文斯也知道了黑暗森林的秘密，但是由于伊文斯极端的反人类性格，他最终选择了保守这个秘密，并指示在暗示罗辑的过程中尽量伪装成意外事故。
伊文斯与三体人的交流过程中竟然发现，它们将“想”和“说”认为是同义词。进一步沟通，这才知道，三体人通过脑波进行思考，由于脑波非常强大，可以直接被外人观测到，因此他们的思维是透明的，大脑在想什么，外人就会受到什么消息，无法隐瞒和欺骗。由于这种特征长期以来三体文明的谋略都处于低级阶段。即使是与地球交流的过程中，地球人明明看不见三体人的思维，但是他们还是把很多机密技术与情报一一传授。甚至让伊文斯知道了黑暗森林理论。
伊文斯点破了这一点，同时叮嘱三体人，一定要好好隐藏黑暗森林的相关信息。而三体人却对地球人，三体组织，甚至是伊文斯感到恐惧。因为知道地球人善于欺骗，三体人就开始猜疑，或许三体组织和伊文斯也在欺骗他们，再加上伊文斯已经知道不该知道的秘密。在这之后三体人就断绝了与ETO组织的通讯，同时在人类军方对ETO进行打击的时候也没有向他们传递情报。这间接导致了叶文洁被捕，与伊文斯的被杀，实际上也算是杀人灭口了。
二十四三体集会
汪淼受邀参加了三体集会，在集会上降临派的潘寒与拯救派成员发生了激烈冲突。由于ETO的活动已经被被各国注意到，潘寒就撺掇组织进行全球起义。这时候叶文洁出现，汪淼这才发现，她就是ETO的统帅。叶文洁到场后首先处理降临派的问题。此前申玉菲虽然是拯救派但曾经进入降临派的核心，在转投拯救派的时候将许多信息告诉了叶文洁。此时叶文洁已经知道了降临派的最终目的就是毁灭全人类，因此要在组织内部清洗降临派，勒令他们交出与三体通讯的信息。潘寒不从，反抗过程中被叶文洁的贴身护卫杀死。
此时军方包围冲入现场，意图控制局势，混乱中护卫叶文洁的小女孩，拿起了一个作为装饰品的小球。这实际上是一颗小型核弹，小女孩以此威胁军方，要求放走叶文洁。关键时刻史强出手，他凭借气质猜测到小女孩是个孤儿，谎称联系到了她的父母。趁着小女孩分心的时刻，利用手中的信封作为掩护，开枪击中了核弹，引爆了核弹外部的常规炸药。核弹女孩当场被炸身亡，由于炸药是非定向引爆，并没有引爆核弹，但是史强，叶文洁等靠近核弹的人员都受到了严重的辐射。随后会场被控制，叶文洁等人被捕。
二十五古筝行动
据被捕的叶文洁交代，ETO与三体星系的通信完全被控制在伊文斯手中，而此时他正乘坐着审判者号邮轮在海上游弋。为了夺取三体信息的宝贵情报，军方策划在审判者号通过巴拿马运河的时候进行袭击。为了确实的消灭对手，防止资料被销毁，就要求在一瞬间杀死审判者号上的所有人。会议讨论了几个方案，比如球状闪电武器，次声波武器等都不能达到目标。
众人一筹莫展之际，史强建议在巴拿马运河的水道两侧，架起两根柱子，柱子间每隔半米就布置上汪淼开发的纳米材料丝线。这些丝线非常细，肉眼很难发现，当油轮经过的时候就会连人带船被切割成碎片，根本来不及反应。作战中心同意了这个计划，定名为古筝行动。随后任务成功执行，伊文斯被当场杀死，三体的情报被人类完整截获。
二十六虫子
人类截获了三体的情报却得到令人绝望的现实。三体人正在入侵地球，将在年后到达。三体人的科技水平远远领先人类，而且他们已经利用智子锁死了人类的科技进步。科技的差距导致了人类在年后的战争中必然失败和灭亡。三体通过智子向人类传来的最后的讯息“你们是虫子”。汪淼和丁仪面对这种情况都显得非常消沉。史强把他们带到自己的故乡，那里蝗虫正在泛滥成灾。史强说道，人类与三体文明的差距远小于人类与虫子的差距，但是人类穷尽各种手段，依旧无法消灭虫子。只要人类坚持求生，也一定不会被三体人消灭。在史强的鼓励下，汪淼和丁仪重新振作，投入到科学事业中。
三体人将要入侵的消息给了地球人极大的冲击，人类进入危机纪元。为了应对这空前的危机，人类开始团结起来，联合国的地位得到加强。地球开始整军备战，同时人们的生活也因为进入战时状态而质量下滑。此时地球人的心态可以分为几类：
1.第一类人面对三体入侵，彻底绝望，放弃抵抗，只求在这年间，自己和自己的后人能够和平度过，迎接人类最后的灭亡。比如早期的罗辑，就属于这类人。
2.第二类人知道人类胜利无望，但依旧在履行自己的职责，比如程心和汪淼。
3.第三类人面对巨大的力量差距，依旧在想方设法取得胜利，比如维德和雷迪亚兹。
4.第四类人认为人类胜利不可能，只有进行星际逃亡才能延续人类文明，最突出的代表是希恩斯和章北海。
二十七危机初年的简略梳理
从本节开始我们要开始讲三体第二部以及第三部的内容。这两部分内容中剧情有着相当重合的地方，而且人物很多，五个面壁者的故事更像是一部群像剧，因此在梳理这个阶段故事的时候，我将危机纪元初年的一些内容进行一个初步的整理。这部分故事主要发生在危机20年也就是以前。
在这一时期，人类主要采取了以下备战行动：
1.改组联合国，提升联合国权利，组织行星防御理事会。
2.开展对三体世界的侦查，向三体舰队发射探测器。
3.开展面壁计划。
在这些剧情中主要主角活跃的年代为
1.程心，维德，云天明活跃于危机元年-危机5年，危机4年云天明28岁，也就是说程心与云天明大致都出生于年。这里程心冬眠的时间有BUG，首先，程心苏醒的时间应该是威慑61年，危机纪元一共年，那么威慑61年应该是年。文中有一次提到面壁计划始于程心冬眠前年也就是6年，这是错误的。还有一次提到程心冬眠了年被唤醒，我们采信这一个论据，推测程心冬眠时间在年也就是危机5年，这里与剧情可以对应上。同时程心冬眠的时候生理年龄是28-29岁也符合后期描述她小于30岁的设定。
2.罗辑，泰勒活跃于危机3年以及危机8年
3.章北海活跃于危机3年，危机8年，危机12年
4.雷迪亚兹与希恩斯活跃于危机3年，危机8年，危机16年，这里时间线又有一个BUG，书中这两位是危机8年冬眠，此后又过了8年，应该是危机16年，但是小说中明确提到是危机20年，这里相互矛盾。同时吴岳在回忆过程中提出这是16年前他在太空军中服役，又对应的是危机20年。这个年份对后续剧情影响不大，但考虑到冬眠时间的设定，影响到希恩斯与山杉惠子的年龄设定，这里我们还是以雷迪亚兹与希恩斯最后活跃的年代为危机16年为准。
为了对三体故事的情节进行更好的叙述在叙述第二部内容的过程中，我会在一个时间段，把主要任务的故事都讲完，再进入下一个时间段。
二十八危机3年-罗辑线-面壁计划
行星防御理事会从一些情报上分析出了三体人并不擅长谋略，因此考虑制定面壁计划，利用人类在智慧上的优势与三体对抗。这里有一个重要的设定，那就是由于智子的存在，地球上重要人物的沟通，所有的文献资料，都会被三体人掌握。但是唯独人类的思维无法被智子读取。面壁计划的思路就是选出几个谋略过人的人也就是面壁者，为他们提供非常丰富的物质资源，让他们制定对抗三体的计划。
这里再提一下面壁者的权利问题，首先面壁者的权利说大不大，说小不小。首先面壁者的权利是在联合国框架下的，在三体里，虽然联合国比我们显示社会中权利略大。但也是被各个大国制衡的。面壁者的权力又是联合国权力中的一部分，实际上能够调动的资源并不是特别多。世界各国也并非会完全配合面壁者的，特别是后期面壁计划出现挫折之后。
三体人由于畏惧人类的智谋此前一直中断了与ETO的联系。可是面壁计划让三体人稍微有点被动，为了与面壁计划对抗，他们重新开始联系ETO。这三年间由于与三体人失去联系，再加上各国的打击ETO举步维艰，只有少部分降临派人员坚持了下来，在与三体人重新联系之后，这些骨子里就反人类的人重新集结起来开始与面壁计划的对抗。
重组之后的ETO组织，接到的第一个任务就是杀死罗辑。这个任务本来是伊文斯下达的，但由于伊文斯仓促被杀，ETO的成员根本就没有接到这个命令。
这些年罗辑原本指望依靠宇宙社会学这个新颖的概念成为网红学者的，但是随着三体入侵，研究宇宙社会学的人都烂了大街了，他也就错过了机会。再加上罗辑怕受牵连并不敢透露他和叶文洁的谈话。这些年来他依旧过着颓废的花花公子生活。
ETO组织精心策划了一场暗杀，他们伪装了一起车祸希望撞死罗辑，但没有成功。反而这场暗杀行动的秘密还被联合国发现了。虽然不知道ETO为什么要杀罗辑，但是考虑到罗辑是ETO唯一要杀的人，联合国决定将罗辑保护起来，让他参加面壁计划。
罗辑的护送由史强负责，在此前的行动中，史强因为受到核辐射已经得了白血病，完成这次任务后，他将进行冬眠，等待未来科技进步，治疗手段的处向。罗辑被史强一路护送，首先来到了北京郊区的一个地下三防掩体，随后被直接带上飞机送往纽约联合国大会。
罗辑突遭变故，根本不知道是怎么一回事，看见自己被重重护卫不知道要押送到哪里，心中不安，难以入睡。史强就和罗辑进行了简单的交流，史强并不知道此次护送罗辑背后的隐情，但预感到罗辑以后需要成为一个用计谋欺骗别人的人，因此和他谈了一些审讯的技巧。
一行人来到纽约，在这里罗辑遇到了面壁计划的特派员坎特。在坎特的安排下罗辑进入会场参加会议。会议由联合国秘书长萨伊主持，在这次会议萨伊公布了面壁计划，同时指定了四个面壁者，美国国防部长泰勒，委内瑞拉总统雷迪亚兹，前欧盟主席，诺贝尔奖获得者希恩斯。还有出乎意料地，罗辑作为一个普通人被指定为面壁者。
二十九危机3年-罗辑线-面壁者的微笑
被选为面壁者的罗辑，惊诧莫名，他原本是一个失败主义者，只想开开心心地过完余生，这次却被安上了拯救人类的重任。罗辑觉得自己没有能力，也没有动力去做救世主，因此找到萨伊希望放弃面壁者的身份。
萨伊对罗辑露出了面壁者的微笑，然后竟然口头上他同意了。如释重负的罗辑走出会场却发现他依旧享受着面壁者的待遇被重重保护着。这时候刺杀事件再次发生，一个ETO的狙击手向罗辑开枪，好在史强事先要求罗辑穿上了防弹衣罗辑才幸免遇难。
苏醒后的罗辑，要求见刺客一面，在与刺客见面的同时，罗辑再次表示自己要放弃面壁者的身份，却再一次找到刺客不屑的冷笑。罗辑找到萨伊，再次试图放弃面壁者身份。在这次交谈中，罗辑得知了两个情报。首先，自己被选为面壁者是有原因的，这个原因联合国不打算告诉罗辑，而更深层的原因联合国自己都不知道。第二联合国选择罗辑有冒险的成分，因此对于他的限制也比较大，罗辑能调用的资源并不多。
这一次罗辑明白了，他已经陷入了面壁计划诡异的逻辑之中了。面壁计划的核心就在于，知道真实计划，以及面壁人心中所想的，只有面壁者自己。因此无论面壁者做出什么不合理的举动，都会被认为是计划的一部分。同时由于这个原因，世界上也没有人会真正相信面壁者，面壁者在某种程度上是极端孤独的。而罗辑放弃面壁者身份的行为也一样，没有人会当真。
于此同时，在虚拟的三体游戏中，残留的ETO组织成员，为了对抗面壁计划，也为除了罗辑之外的每一个面壁者指定了破壁人。
三十危机3年-罗辑线-伊甸园
罗辑在联合国的冥想室躺了良久，终于想通了。面壁者实际上有一个特权，那就是可以使用巨大的资源而不要做出任何解释。反正自己的目的只是无忧无虑过完这一生，为什么不用面壁者的权利，为自己谋求一个舒适的生活环境供自己享乐呢。
于是他找来了坎特，要求在一个风景如画的地方弄一套房子，让他居住。对于这个荒唐的要求，坎特与伽尔宁竟然没有拒绝，很快就按照他的要求办妥了。此后对于罗辑的各种无理要求，联合国竟然也一一满足。
罗辑在伊甸园里过着无忧无虑的生活，却感到有点空虚，因此他决定找一个妹子来陪自己。他找到了史强，对着史强描绘了自己的梦中情人。史强竟然根据他的描述列出了几个寻人标准，还给出了模拟画像。坎特对罗辑的行为非常不满，但史强却看出了罗辑的非凡之处，在拯救人类的重压下，还能这样死皮赖脸，罗辑在这一点上或许真的与众不同。
不久之后，史强把庄颜带到了罗辑身边，罗辑一看惊为天人，与自己心中的女人完美相符。虽然庄颜并不知道自己为什么被送到罗辑身边，开始时还略有拘束。但罗辑很快开启撩妹模式，他和庄颜一起欣赏美丽的自然风光，一起划船，一起在卢浮宫包场夜游。他们在蒙娜丽莎的画像前谈情说爱，很快就确立了恋人关系。
三十一危机3年-章北海线-信念
为了应对三体入侵，我国着手开始组建太空军，由常伟思将军担任司令。太空军成军之后就从各个部门调集骨干力量。由于形势变化“唐”号航母的建造项目下马，原本作为航母舰长和政委的吴岳和章北海被编入太空军。
在前往太空军报道前，章北海看望了病重的父亲。在危机爆发之后，老章将军的病床前聚集了许多专家，他们共同探讨了人类的未来，这些人被称为未来史学派。专家一致的结果表明，由于地球科技进步被锁定，人类面对三体几乎没有任何胜算。
病床前，章北海与父亲进行了最后的对话。他原本希望父亲给自己一些指导，但父亲只是回答了一句要多想。父亲沉默的教导也让章北海下定决心，他要为人类的生存竭尽全力，不择手段。
在已经停工的唐号航母前，章北海与吴岳谈起了胜利的前景。吴岳也是一个技术型军人，他也深知人类与三体的战争毫无胜算。但此时的章北海却表现的充满信心，他坚定地相信人类会最终取胜。吴岳对章北海观念的反差表示疑惑，章北海则说人类与三体的战争中并不需要普世的理论，只要有坚定的信心，一两次意外就能让人类获得转机。
此后的一次会议上，章北海当众指出了太空军内部的失败主义思潮，同时将矛头指向吴岳。吴岳坦诚自己是一个失败主义者，同时也自认为自己不适合在太空军工作，因此选择了退出了太空军。
三十二危机3年-章北海线-太空军
太空军虽然成立，但由于航天技术还没有发展，他们根本无法指挥军队，只能进行一些战役战术的理论研究。由于人类未来技术发展的高度很难预计，这个时期常伟思和上级决定分三个技术层面开展这项研究。低，中两个技术层次对应人类宇宙航行能力在海王星轨道内，柯伊伯带内，而高技术层次下人类有可能进行星际航行。
在分配人员进入三个技术研究室的时候，常伟思又举行了一次会议。会议前，常伟思首先谈了谈必胜信念的问题。问及在场军官谁认为人类在战争中有获胜的希望，只有章北海举了手。章北海认为虽然必胜的信念要建立在科学和理性至上，但我们对科学理性的认识依旧是有局限的，因此以我们有局限的思维认为我们必然失败也是片面的。
面对章北海的发言，常伟思实际上是有察觉的，他可以肯定章北海一定是在某种信念的驱动下行动的，但这种信念，恐怕不是人类必胜这么简单。最终大部分军官对人类技术的发展并不乐观选择了进入低，中两个技术层次研究室，只有章北海进入了高技术研究室。
三十三危机3年-泰勒线-球状闪电
泰勒当选面壁者后，对外宣称要利用人类目前最强大的新概念武器——球状闪电来对抗三体人。他计划组织一支专门使用球状闪电武器的突击队。为了达到这个目的他首先拜访了球状闪电的发现者——丁仪。
丁仪此时人在空军基地，刚下航天飞机。危机纪元开始后，丁仪一直试图摆脱智子对加速器的干扰，重新开展物理研究。他的思路就是在太空部署大量检测设备，利用宇宙射线，代替加速器进行撞击试验得到观测结果。这个计划实际上相当于建设了大量廉价的加速器与智子赛跑。结果所有的实验结果依旧是混乱的，丁仪推断一定是有更多的智子来到了太阳系，即使有上百台加速器也无法摆脱这种干扰。
泰勒希望丁仪能够协助他进行球状闪电武器的研究。丁仪对此并不看好，因为三体人基础理论比人类高深很多，对球状闪电也更加了解，使用球状闪电在三体人面前是班门弄斧。最后丁仪表示，球状闪电的使用技术已经相当成熟，没有他泰勒也能进行这方面的计划，因此拒绝了泰勒的邀请。
三十四危机3年-泰勒线-牺牲精神
按照泰勒的说法，球状闪电武器使用时需要抵近攻击，因此突击队必然伤亡很大。因此泰勒决定要建立一支有牺牲精神的部队。他首先来到日本自卫队进行考察，历史上日本人的神风特攻队令人印象深刻。他希望能够从这里开始组建突击队，在日本他见到了日本防卫厅长官井上宏一。井上宏一对泰勒的想法非常不满，因为他认为神风特攻队当年的行为并没有扭转战局，是无意义的白白牺牲，而且让士兵去做自杀攻击，违背了当今社会人类的价值观。
随后泰勒来到了我军考察，在这里他和章北海见了面。他想了解如何通过思想政治工作，让现代的军队重新恢复古代军队的精神，勇于进行自我牺牲。章北海则认为，古代军队的牺牲精神是时代的产物。除非人类文明回到落后的状态，否则这种精神回不来，人类始终是需要向前进的，不应该开历史的倒车，让人类社会退步。
最后走投无路的泰勒只能找到自己的老对手本拉登，基地组织也经常搞自杀活动，或许能够成为突击队员。本拉登表示，这个想法也是行不通的，基地组织之所以会发动自杀性质的袭击完全就是因为他们对美国人有强烈的憎恨。现在三体入侵了，美国人迟早要灭绝，那么基地组织憎恨美国人也就没有意义了。虽然三体入侵也会消灭阿拉伯人，但由于他们顺便把美国人灭了，他们也不会去憎恨三体人，因此基地组织没有思想基础去对三体人进行自杀袭击。
三十五危机3年-希恩斯线-进化
希恩斯是前欧盟主席，也曾经和妻子山杉惠子一样是一个脑科学家，他因为发现人类思维是在量子层面之上，因此获得诺贝尔奖。在成为面壁者后，希恩斯一度表现得压力很大，毫无头绪。终于在一天夜里，他向妻子透露了自己的计划，那就是通过脑科学技术激发人类大脑的潜力，让人类的智力和认知能力都得到提升。虽然现阶段他们没有有效面对三体人的战略，但是如果计划成功，未来的人类或许能够打破智子对人类科学的限制。另外一点，他们两个本来就是脑科学家，现在他们要做的只不过是利用面壁者的权力，将自己本来准备完成的事业进行下去罢了。
三十六危机3年-雷迪亚兹线-核弹
被选为面壁者的雷迪亚兹也开始了计划，他表现出对核弹强烈的兴趣。在危机纪元之前委内瑞拉曾经计划研究核弹，但受到联合国制裁，项目被迫中止。雷迪亚兹似乎不甘心地开始利用面壁者的权限，继续自己的核武梦。
雷迪亚兹首先考察了美国的核弹研究机构，同那里的实验室主任进行了交流。实验室主任名叫艾伦，他带领雷迪亚兹参观了他们的巨型计算机，这里可以进行核弹模拟实验。而雷迪亚兹此行的目的，就是希望艾伦他们能为他设计核弹，巨型核弹，这种核弹的当量要比现有武器当量大10倍以上。艾伦并不看好核武器在太空战争中的前景，受限于核弹的作用机理，核弹在太空中的杀伤力有限。但雷迪亚兹却强调，核弹是目前人类拥有的最强大武器，是他们唯一可以依靠的选择。
艾伦按照雷迪亚兹的要求开始设计核弹，但很快就遇到了困境，雷迪亚兹提出的核弹当量过于巨大，已经与现有核弹的模型完全不符。更接近与恒星燃烧，因此艾伦想雷迪亚兹要求，请一位研究恒星结构的科学家加入。交谈过程中，雷迪亚兹突然看到了升起的太阳，心中突然剧烈地恐惧起来，他开始呕吐，从此就只能呆在不见天日的地下掩体中。
三十七危机3年-逃亡主义
在人类应对三体危机的同时，人类内部出现了逃亡主义的苗头。一些人认为既然人类无法对抗三体入侵，那么唯一可行的方法就是离开太阳系，向外太空移民。以人类的科技水平根本无法做到全人类一起走，只能让一部分人离开。可是谁走谁留的问题就涉及到人类最基本的价值观，生存权的平等。三体人也曾经担心人类逃亡后后患无穷，但ETO组织却认为人类的逃亡是不可能实现的。
虽然逃亡主义注定不可能，但并不妨碍一些人坑蒙拐骗，史强的儿子史晓明就是其中之一。史晓明借着逃亡主义四处兜售逃亡基金敛财，在他的忽悠下，一心想要延续香火的普通退休职工张援朝被骗走了一生的继续。
很快联合国宣布逃亡主义是非法的，史晓明事情败露被捕入狱，在狱中他见到了前来探望的史强。此时的史强已经病重，执行完任务后即将冬眠前往未来。史强向史晓明表达了自己过去对儿子管教不周的忏悔，同时嘱托史晓明，保护好自己。父子这一别，就只有未来再见了。
三十八危机3年-程心线-战略情报局PIA
危机初年，曾经就读于航天系的程心毕业，她首先进入了新一代长征火箭的课题组。在工作中程心看到传统化学动力火箭的瓶颈，因此想要摆脱这个领域。此时行星防御理事会正在组建战略情报局（PIA），PIA的成员大概要有两部分组成，一类是航天方面的科学家，另一类则是间谍和特工。PIA成立后需要从各国抽调人才，程心也因此接受了组织委派，前往纽约工作。
在PIA程心先后遇到了技术规划中心主任瓦季姆和PIA的局长托马斯-维德。在所有成员到齐后维德没有丝毫拖泥带水地发布了第一个任务，他们希望向三体舰队发送一个探测器。维德之所以发布这个任务，主要是从政治上进行考虑，如果能第一个与三体舰队接触，那么PIA的政治地位就会提高。
而发射探测器却有不小的困难，首先就是速度。如果以我们现有的速度发射探测器，可能几万年都飞不出太阳系，而年后三体舰队就会到达地球，因此探测器的速度至少要到1%的光速，这才有意义。
就在众人认为1%的光速无法达到的时候，程心提出可以用核弹来推动探测器。探测器由探测器主体与光帆组成。在探测器飞行的轨道上预先布置好核弹，当探测器飞过核弹的时候核弹爆炸，利用爆炸的辐射驱动探测器的光帆，大力出奇迹，让探测器以1%光速运行。
三十九危机3年-程心线-只送大脑
探测器虽然能够以1%的光速飞行，但是探测器的重量却成了问题，由于探测器需要搭载仪器以及回传天线，按照一般估计至少要一吨左右。但后续的实验表明，要达到如此高的速度，探测器的重量估计要在kg以下。如此小的质量，几乎无法进行有效探测。联合国也否认了这个计划，主要是由于探测器速度非常快，而且无法减速，与三体舰队短时间擦肩而过，根本得不到什么情报。就在PIA的成员一筹莫展的时候，维德突然提议，我们可以送一个人类过去。
之所以有这样的考虑主要基于几点，我们都知道与外星人的接触一定有重大意义，对于三体人也一样。虽然他们有智子对人类社会了如指掌，但是他们对获取一个活人也是非常有兴趣的，三体人有可能主动搜索并截获这个人。另外，三体人不擅长谋略，如果送一个活人过去，尽管三体人知道这个人是间谍，但这个人依然可以用自己的智慧与他们斗争。
维德的建议让整个项目又有的转机，当时人体冬眠技术已经成熟，正好可以利用这项技术，让这个深入三体文明的间谍在睡梦中度过漫长的旅程。然而程心等人对于冬眠设备的考察再一次让项目陷入绝境。冬眠实际上实在零下50度的环境中进行的，太空温度接近绝对零度，因此需要在整个过程中进行加热，同时需要配置生命维持设备，这一套下来，重量得有个来吨。
这时候程心灵光一闪，我们没有必要送个活人过去。我们可以不要任何生命维持装置，就送个死人过去。如果三体的科学技术非常发达的话，他们收到尸体以后，就可以再把他复活，这样不就和送个活人一样的吗。
这个方案被再次提交联合国，在这个方案审议的同一天，联合国公布了面壁计划以及四个面壁者。由于面壁计划提交审议，天梯计划的相关人员在场外守候。就在这个时候，不幸的消息再次传来。NASA进行了几次太空核爆模拟实验得出结论，探测器的载荷依然过大，根本送不了一个活人，只能装半公斤的东西。
面对这样的打击程心失去了继续前进的动力，这时候维德如鬼魅般吐出了一句“只送大脑。”
维德之所以提出这样的建议，关键就在于，人类的思维活动都是在大脑中进行的，只要三体人的技术可以激活这个大脑，这个大脑就依然可以发挥间谍的功能。其次大脑细胞中包含这人体所有的遗传密码，因此造出一个躯体也是有可能的事情。
四十危机3年-程心线-安乐死法案
阶梯计划获得了联合国的通过，并开始施实。用于轨道推进的核弹被陆续发射到太空之中。但是阶梯计划的人选却成了问题。
首先，这个人要充当间谍，就要有一定的谋略和素质不说，科学知识和素养是不可缺少的。其次这个人必须要捐赠大脑，意味着按照地球的科学技术，把一个人的大脑切除，这个人肯定就死了，这个人首先要自愿牺牲。最后，三体人拿到大脑以后指不定会用来做什么惨无人道的实验，大脑上的痛觉中枢都在，受到的痛苦一点都不会少。因此，正常人一般都不会选择承担这个人物。
PIA于是就策划在各国通过安乐死法案，让即将死亡的病人成为潜在的志愿者。而我国在后来也通过了这个法案。
另一边维德却在策划谋杀瓦季姆，瓦季姆既有情报能力又是科研人员出生，实际上是非常优秀的人选。他自己也深知这一点，但瓦季姆毕竟是正常人，还有妻儿老小，因此并不愿意赴死，因此有时他也沉浸在自责当中。维德的手段是在瓦季姆周边偷偷放置放射性物质，让瓦季姆患上慢性白血病。瓦季姆由于患病在一次开车过程中眼底出血，发生了车祸，坠河身亡，然而由于脑子在水里泡了太久，最后不能用了。
程心与瓦季姆关系一直非常好，在PIA内瓦季姆是她亦师亦友一样的存在。在瓦季姆死后程心曾经私下调查他的死因，但是由于维德手法专业，程心并没有找到证据。
四十一危机4年-程心线-云天明
云天明是程心的同学，由于家庭原因，父母离异，自己变得非常不合群。在大学期间程心是中央空调一般的存在，和所有同学都能说上两句话。在为数不多的接触中，云天明对程心产生了仰慕之心。
大学毕业后，程心考研成功，云天明则开始工作。由于性格原因，云天明在工作中并不顺利，变得非常落魄，后来更是被确诊为肺癌晚期，命不久矣。得知自己患了绝症的云天明曾经想去找程心，但这时候程心已经进入PIA工作，出国了，所以云天明也就扑了个空。
云天明病重给家里造成了经济负担，恰好这时候安乐死法案通过。他的姐姐就授意云天明的主治医师，希望云天明接受安乐死，结束生命。就在这个时候，云天明的同学胡文找到他，还给了他一大笔钱。
原来在大学时候的一次郊游中，云天明把杂草揉进矿泉水瓶里，做成了一款另类饮料。胡文后来利用这个创意创业挣了一大笔钱，他就拿出一部分来回馈云天明。云天明拿到钱后首先咨询了肿瘤专家，却得知自己无药可救。由于姐姐对云天明的态度，云天明最终决定不把这笔钱留给家人。
这一时期联合国开展了群星计划，实际上就是一个官方坑钱的过程，目的也是为了割韭菜。群星计划的做法就是把一些距离太阳较近的恒星所有权拍卖给个人，换取经费。这个计划在当时没什么意义，首先，人类的宇航速度根本到不了这些恒星。其次，人类由于三体入侵灭亡在即，还考虑什么星辰大海呢？最后，即使人类的宇航能力可以飞向这些恒星，但这实际上等同于逃亡主义，自然是非法的。
但云天明不在乎，他是将死之人，钱什么都无所谓了，所以他就用这笔钱买了一颗星星DX送给程心。程心收到星星以后非常感动，但由于云天明是匿名赠送的，她并不知道究竟是谁准备了这个礼物。
云天明将星星送给程心，完成了心中的一件大事，也就接受了安乐死。
四十二危机4-5年-程心线-漫长的阶梯
程心在美国工作的时候见到了一个同学，他向程心提起了云天明的情况。程心觉得既然云天明已经患了绝症，不正好拿来当阶梯计划的候选人吗。程心向PIA推荐了云天明，很快获得了同意。程心原本准备回国劝说云天明加入计划，接受安乐死。结果到了现场才知道云天明早就自己做了决定，医院，在最后关头中止了操作。
等到程心向云天明说明来意，云天明歇斯底里地大笑起来，他立刻想到了参加计划的后果，但看到程心庄严的态度，云天明最终决定参加计划。
在最后的时光里云天明参与了阶梯计划的各种培训。这期间程心突然开窍了，她开始后悔推荐云天明，因为她感觉到这个行为可能将云天明推入地狱。程心找到维德希望他能够把云天明从候选名单中排除，却遭到拒绝。
随后所有的候选人参加了一场宣誓，在大多数候选人都表示效忠地球的时候。云天明却说他不一定会为地球尽力，他要看到三体文明之后再决定帮助哪一方。可以说这时候云天明已经表现出了他那种隔离于人类社会之外的性格。但尽管如此，考虑到云天明的表态可能是为了迷惑三体人，再加上云天明的其他素质也适合参加阶梯计划，最终云天明在所有候选人中脱颖而出。
后来云天明病情恶化，医院进行大脑切除手术。这时候维德终于告诉程心，那颗星星是云天明送的。程心知道后后悔不已，希望阻止手术，可当她赶到的时候，云天明的大脑已经被切除。主刀的医生安慰程心，或许三体人会再造他的身体。这番话给了程心希望，为了让恢复身体的云天明能够吃到地球的食物，程心最终争取到了机会给云天明带一点地球作物的种子。
阶梯计划正式执行，然而中途却发生意外，搭载云天明大脑的探测器最终偏离轨道消失在茫茫太空之中。阶梯计划需要一个联络员向未来的人类报告计划细节，熟悉云天明的程心成为不二人选。其实随着探测器偏离轨道，程心并没有必要冬眠，但是出于对云天明的愧疚和对自己的惩罚心态，程心还是接受了任务。
四十三危机4-5年-程心线-程心，云天明，维德的分析
这里我们总结一下，这条故事线中的三个主角。
程心属于那种傻白甜的感觉，参与到对抗三体的斗争中更多的是出于内心的正义感与价值观，至于胜败她也并没有考虑过。在这种思想下，她虽然知道脑子被送到三体可能会有非常恐怖的遭遇，但觉得这是一个立志为地球奉献的人应该做的，特别是这个人本身就没有生存的希望，有一个机会被三体捕获没准还是重生。同时她始终对人类都有很高的期待，认为人类都具有善良与奉献的美德，她认为云天明也应该是这样的人。因此程心对推荐云天明在一开始是没有任何心理负担的。但后来，随着瓦季姆的死，她开始认识到阶梯计划的残酷性，她开始后悔推荐云天明。当知道星星是云天明送的以后，她开始愧疚和自我惩罚，这也是她后来去未来以及参选执剑人都是抱着这种心态去的。要知道，冬眠去未来是也是非常残酷的，这预示着与父母亲人的分别，而且在三体世界入侵的背景下未来是如同末日一样的存在。总之程心后期所有的行动都是希望通过自我惩罚来减轻负罪感。
云天明的因为成长过程中的经历，性格缺爱而且敏感。这种敏感体现在程心对他摊牌之后，他立刻想到了事情的危险，同时认为程心可能在利用她。云天明看人首先看到的就是人的阴暗面。但正是因为云天明心理缺爱，当他看到程心庄重的态度时，他想起程心是曾经唯一给过他关爱的人，因此为了程心，也为了这份曾经的关爱，他又选择加入这个计划。如果概括云天明对人的态度，他对人类社会估计也是持有消极态度的，但是程心却是他的留恋，他不一定愿意守护人类，却甘心守护程心。云天明在三体世界的遭遇始终没有描述，比较可能的情况是后来三体的反攻有云天明在背后参与，这是他疏离人类社会的表现。后来他又透露情报实际上也并非是为了拯救人类，更多的可能是为了守护程心。
维德的性格实际上用瓦季姆的话就可以概括，是一个抖S，热衷于从精神上打压和折磨他人，喜欢在他人的痛苦中需求快乐。这也是他为什么故意迟迟不透露送星星给程心的人是谁。维德虽然性格比较强势和恶劣，心态也有点变态，但在整个计划中他就像斗士，不择手段的抗争与前进，这实际上是一个文明应该有的品德。
四十四危机3年（）-实锤
林格博士是哈勃二号项目的负责人，由于三体危机，原本用于天文观测的哈勃望远镜被军方征用。军方还派遣了一个天文学知识几乎为零的斐罗兹将军，作为特派员进入项目组。这些行为让一直立志将哈勃望远镜应用于天文学的林格博士非常不满。
哈勃二号望远镜升空后进行首次调试，斐罗兹将军坚持要求林格博士将首次的观测目标指向三体星系。林格博士却认为这没有任何意义，因为望远镜分辨率不足，根本看不到什么东西。而且随意转变望远镜方向会导致燃料损耗。
斐罗兹将军却抓住了林格博士的把柄，原来他和另外两个研究人员为了向女友炫耀，竟然用哈勃望远镜为他们拍写真。林格博士没有办法只有按照斐罗兹将军的意见处理。望远镜对准了三体星系。这一拍摄竟然拍到了0多根刷子一样的痕迹。
科学家立刻进行分析，实锤了这是三体舰队高速通过星际尘埃，产生的冲击痕迹，他们的速度已经达到了倍第三宇宙速度。这个发现实锤了三体星人入侵的现实，也浇灭了人类最后的幻想。
四十五危机8年（）-破壁者
在面壁计划开始已经5年了，这些年由于人类对面壁计划充满了期待，面壁者被当成救世主一般的存在。而就在这个时候，泰勒的破壁者出现了。
泰勒的破壁者很快就道出了泰勒计划的真正目的，那就是量子幽灵军队。我们之前提过，被球状闪电武器攻击之后，人类这种有自我意识，能够自我观测的生物会短暂地处于一个幽灵状态。这种状态理论上是不死的，泰勒希望利用这一点，组建一支突击队，在面对三体人的时候用球状闪电武器主动攻击这个突击队，把这一队人都变成量子幽灵以此来对抗三体人。
这个计划中最关键的就是突击队人员的选择。首先这个部队是一只自杀性的部队，要有牺牲精神。其次，由于计划要求保密，这一批队员会在毫不知情的情况下被杀，根本来不及给他们做思想政治工作。这种情况下还要要求这批人坚持完成任务，不背叛人类使命，其实是相当困难的。
泰勒之所以在全世界寻找具有牺牲精神的部队也正是因为这个原因。然而这一切计谋都被破壁者识破，并公开放在网络上被人讨论。由于这个计划本身违背了人类的价值观，因此在社会上产生了激烈的讨论。行星防御理事会立刻召开面壁计划会议对泰勒进行质询，泰勒也在会议中承认了计划的真实性。尽管泰勒的计划已经是明显的反人类行为，他本人也承认了这一点，但考虑到这些行为都有可能是在蒙蔽三体世界，泰勒的面壁者身份依旧没有被取消。
泰勒的计划被戳破，自己再也没有其他逆转局势的手段，而偏偏面壁者的身份根本无法放弃，此刻的他精神完全崩溃。他找到罗辑，说明情况，希望同是面壁者的罗辑能给他一些帮助和安慰。好巧不巧罗辑也对他露出了对面壁者的微笑，觉得他还是在从事面壁者的工作。这样一来泰勒最后的心理支柱倒塌，他选择了自杀。泰勒自杀的行为彻彻底底地实锤了他计划的真实性。
这里简单的评价一下泰勒的计划。泰勒在四个面壁者中就是一个凑数一般的存在，他的战略对未来没有任何影响。泰勒故事的本身实际上更像是在向读者展示面壁计划背后的残酷逻辑，这个逻辑可以活生生的把人逼死。
泰勒的计划在设定上也有问题，因为根本无法确认幽灵军团能够对现实社会存在多大干涉。从球状闪电的描述来看，这种干涉非常有限，顶多就是留一点信息下来。林云有主角光环才能留下点回忆杀。指望幽灵军队参战，大规模干涉我们的现实是基本不可能的。
四十六危机8年（）-僵局
泰勒的失败让面壁计划受到了巨大的压力，花费了如此巨大代价的计划非但毫无用处，还培育出了一个反人类的面壁者和战略方案，这对相当一部分人来说是不可接受的。
在泰勒失败的同时，另外两名面壁者也遇到了瓶颈。
希恩斯为提升人类智力，希望对人脑结构进行实时扫描和处理分析。雷迪亚兹的超大型氢弹模型也已经完成，需要计算机进行计算。然而这两件事情都遇到了算力的瓶颈，由于计算量过于巨大，当时的计算机无法完成这项任务。希恩斯和雷迪亚兹都选择冬眠，等到新技术出现。由于面壁计划受到了巨大压力，让两个面壁者进入冬眠，暂停计划进度也是一个对公众的交代。
四十七危机8年（）-千层饼
一天夜里，罗辑醒来，却发现庄颜和孩子不在自己身边。他四下寻找却发现庄颜在一副未完成的画上给他留言，她和孩子要冬眠前往年后，那是三体人到达地球的时间，也是末日之战的时间。
罗辑想要联系坎特让他帮忙寻找妻儿，却发现联合国秘书长萨伊来到了他的面前。罗辑质疑联合国是在绑架，但萨伊表示，让庄颜和孩子冬眠是为了让罗辑更好的工作。罗辑试图用面壁者的权限让妻儿回到自己身边。但这一次，萨伊拒绝了，罗辑的权力本来就是面壁计划赋予的，萨伊也自然有理由拒绝罗辑的要求。
罗辑见无法用面壁者的权限解决问题，就要求一起冬眠到达末日。这一次萨伊同意了，但她却表示，即使罗辑和妻儿在末日团聚，他们也将看到末日的战火与人类最终的毁灭。而自己曾经被选为救世主，却在那时候无法拯救自己的爱人，到时候罗辑将如何面对妻儿失望的眼神呢？
罗辑被萨伊逼得走投无路，最后请求萨伊告诉自己，为什么当初平凡的自己会被选中。萨伊此时终于对罗辑透露的这个秘密——罗辑是三体世界唯一要杀的地球人。萨伊希望罗辑找出自己被三体人畏惧的原因。
我们这里来复盘一下联合国的操作。首先很多人认为庄颜是特工，实际上只要看过罗辑和萨伊的对话就会知道，庄颜的经历都是真实的，她并没有欺骗罗辑。联合国的这一波操作非常简单，那就是知道罗辑对于三体是一个威胁，但不知道具体原因，于是把他选为面壁者。在这个基础上联合国做了3手准备：1，最好的结果罗辑完成使命，人类战胜三体人。2.罗辑没有完成使命，但联合国通过对罗辑的观察，发现三体世界畏惧他的原因，以此制定计划战胜三体人。3.罗辑和联合国都没有找到方案，联合国用适当的手段逼迫鞭策罗辑，让他好好工作。
庄颜的地位就是计划3中的一个工具人。当罗辑要找梦中情人的时候，列出了一系列条件。但联合国在搜寻人选的时候增加了一条，那就是要楚楚可怜，能够激发起罗辑的保护欲。所以我们分析庄颜的性格就可以看到，庄颜是朴素地希望能够人类能够生存下去的，但面对人类必将毁灭的未来，她也会感到哀伤。而正是这种情绪让罗辑忍不住地希望能够让她快乐生活。在关键时刻联合国就是以此作为要挟让罗辑好好工作。
可以说这一波操作，联合国成功引罗辑上钩，成为了面壁计划的转折点。
四十八危机8年（）-咒语
庄颜的离开，最终激发了罗辑的斗志。罗辑得到提示，他敏锐地发现这一切可能与叶文洁和他的谈话有关。他仔细回忆了和叶文洁的交流，在冰天雪地中独行思考，甚至走上了结了冰的湖面。在湖面坍塌的生死一瞬间，罗辑终于领悟到黑暗森林理论。这个理论最终会导致一个推论：那就是如果在宇宙中公布一个恒星系统的坐标，那么这个恒星系统就一定会被高级文明摧毁。
罗辑艰难地从冰湖中爬起，找来坎特，要求立即组织面壁计划听证会。听证会过程中要保证罗辑的绝对安全，他将以视频会议的形式参加。另一边，地球三体组织也接到了三体人的信息，要求他们不惜手段，立即杀死罗辑，为此三体人愿意向他们传送技术。
罗辑离开伊甸园，重新回到了北京郊外的地下三防掩体。史强的接班人张翔负责罗辑的安全保障工作。罗辑进入掩体后，立刻找来的天文学家林格博士。让他绘制一张包含一颗距离太阳50光年外恒星坐标的星图。在面壁计划的听证会上，罗辑要求利用太阳的功率放大功能向全宇宙广播这颗恒星的坐标。罗辑宣称这是一套咒语，会对目标星系产生毁灭性的打击。这次发射也只是实验，实验成功后将会进行真正的战略。
于此同时三体组织的暗杀也在进行，他们利用基因技术开发了一种特制的流感病毒。这种病毒对普通人杀伤力很弱，但对于罗辑个人非常致命。病毒在罗辑藏身处周围传播，并没有引起注意，后来由坎特传染给了罗辑。但计划终究晚了一步，当罗辑病发的时候，会议已经结束，咒语已经发出。罗辑由于染病多器官衰竭，只能立刻冬眠，到未来医治。
三体舰队探测到了咒语的发射，立即行动，向地球发射了10个探测器，这些探测器，将提前到达太阳系。
四十九危机8年（）-章北海线-增援未来
一次会议过后，章北海与常伟思二人在会议室内谈心。在刚刚的会议中，太空军发布了太阳系的地图。太阳系的广大震惊了所有人，同时也让他们感慨人类的渺小。章北海向常伟思提到了失败主义。由于近年来科技迟迟没有取得进展，太空军以及人类的失败主义开始蔓延。如果未来技术上依旧没有突破，这种思潮就会越来越严重，连合格的政工干部都会越来越少。为了克服这个困难，章北海向常伟思提出了增援未来计划：让一批思想过硬的政工干部冬眠，在未来人类面临心理危机的时候苏醒，起到力挽狂澜的作用。
常伟思对章北海的思考表示了认可，他让章北海准备了一个方案。可是这个方案因为种种原因并没有得到批准。
在危机开始后的几年中，人类投入全力发展技术，这些技术中可控核聚变以及太空电梯进展一直比较缓慢，但空天飞机的研究却取得了进展。章北海作为太空军的成员，也获得了一次前往太空体验生活的机会。
在这一次飞行中他遇到了丁仪。此时基础物理的研究因为智子的原因无法进行。丁仪开始转行攻关可控核聚变。丁仪这次上太空是去回收之前发射的宇宙粒子探测器的。
飞行期间，丁仪向章北海介绍了宇宙飞船发动机的研发状况。飞船发动机将以核聚变为能量来源，按照推进方式分为两个技术路线，一种是工质发动机，一种是无工质发动机。前者类似于化学火箭，需要利用核聚变的能量将工质从飞船中喷射出来，利用反作用力推动飞船前进。后者利用核聚变的辐射直接推动飞船。由于工质飞船需要携带工质，因此不适宜远距离航行，在日后的星际战争中是巨大的风险。然而现阶段，由于工质飞船技术路线与传统火箭类似，因此受到了传统航天界的推崇。
五十危机12年（）-探测器
时间又过了四年，正好是三体舰队通过第二片星际尘埃的时候。在斐罗兹将军和林格博士的指挥下，哈勃二号望远镜再次将观测方向对准了三体舰队。
在这次的观测中，除了以往的0根冲击轨迹外，又多出了10根轨迹。这说明三体舰队发射了10个探测器。这些探测器速度更快，将会提前-年左右来到太阳系。三体人的这个行为非常令人费解。如果是要对地球进行探测的话，智子完全可以胜任，另外发射探测器有多此一举的嫌疑。
斐罗兹将军却看出了端倪，三体舰队发射探测器的日子正好是罗辑发射咒语的那一天，罗辑或许真的有希望打败三体人。
三体人发射探测器的行为，用一句通俗的话就是：为了1%的希望付出%的努力。实际上探测器最快到达地球也要多年以后。此时的人类已经非常接近黑暗森林理论了，甚至罗辑也有可能中途被治好。年间什么都有可能发生，发射探测器可能根本没有意义，但为了生存，三体人依旧付出了所有的努力。
五十一危机12年（）-章北海线-进展
危机开始后，人类倾全力投入科技开发，普通人的生活开始艰难起来。食物又恢复了供给制，粮票再一次出现在人们的生活中。但人类的科技终于有了一些进步。太空电梯技术首先被攻克，汪淼研究的材料被大规模的发射到太空，一座座太空电梯陆续建成，人类进入太空的成本大大降低。
除了太空电梯，可控核聚变技术也取得了突破。丁仪领衔的课题组，攻克了其中的关键技术，对人类而言，能源再也不是稀缺的资源了。就在此时，章北海找到了丁仪，希望推迟发布可控核聚变的相关成果。因为可控核聚变一旦可行，下一步就是确定飞船发动机的技术路线了。而此时工质飞船与无工质非常的争议依旧再继续，两派几乎势均力敌，然而工质飞船的支持中有几个德高望重的老航天前辈。如果这时候确定发动机的技术路线，工质飞船很有可能被采纳。然而丁仪却表示，可控核聚变的研发进度一直受到媒体和大众的关心，都是公开的，根本无法隐瞒。面对这种情况，章北海最终决定铤而走险，暗杀那几个老航天专家。
五十二危机12年（）-章北海线-暗杀
章北海的增援未来计划最终得到了上级的批准。在进行冬眠之前，章北海向上级提议，让特遣队的所有成员在太空中进行为期一年的实习和工作。在进入太空之前，章北海找到了一位陨石收藏家，用重金买下了3块铁陨石。随后章北海偷偷利用单位的车床，将这三块铁陨石制作成了陨石子弹带上了太空。
在章北海在太空实习了三个月后，机会出现了。航天系统要开一次会议，为了弥补过去航天工作者没有机会进入太空的遗憾，这次会议在太空中进行。章北海知道会议地点后提前去5公里之外埋伏。会议结束以后，参与会议的人员要走出空间站，在太空中合影留念。就在与会人员摆位置准备拍照的过程中，章北海利用手枪向几个支持工质飞船的航天泰斗射击。在真空中子弹没有受到任何阻力就击杀了目标。由于章北海手枪的子弹是用陨石做成的，因此在场的人都认为是遭遇了陨石雨事故，并没有往蓄意谋杀方面去想。
几个老航天泰斗的死使得工质飞船方案失去了支持。ETO通过智子目击了这次袭击，他们也曾经考虑过揭发章北海，但由于之前ETO的离间行为过多，导致这种揭发未必有可信度。同时ETO成员都认为章北海是胜利主义者，并没有过于重视他。
暗杀行动后，章北海和第一批特遣队员与常伟思告别，冬眠前往未来。而直到与章北海分离，常伟思依旧没有看透他内心的想法。但是他隐约地发现章北海的目的没有那么简单。常伟思给未来的指挥官留下了一封信，委婉地提到章北海有问题，但并没有引起重视。
五十三危机16年（）-希恩斯线-人工大脑
希恩斯和雷迪亚兹在冬眠8年后被唤醒，因为他们期待的超级计算机已经出现了。希恩斯醒来后见到了自己的妻子山杉惠子，这才发现8年以来妻子都没有冬眠。山杉惠子向希恩斯报告了这些年来计算机技术发展的情况。由于智子封锁了人类科技的进步，包括量子计算机在内的新型计算机都没有研发成功。山杉惠子只有暴力出奇迹，用一个CPU模拟大脑的一个神经元，最后利用一千亿个CPU建造了一个模拟大脑。
这里说一说三体里的大脑观，希恩斯的研究表明，人脑在最底层是量子层面的，因此人的思维有不确定性，不可预测。人类特定的思维对应着一个神经回路，这个神经回路由一系列脑细胞组成对所有人都是一样的，我们可以把它称为脑回路。希恩斯的计划就是了解人类的每一个思维对应着哪一个脑回路，达到解析大脑的目的。
五十四危机16年（）-希恩斯线-意外
希恩斯的人脑解析计划其具体操作也非常容易理解，那就是利用类似核磁共振的设备配合高速摄像机对人类大脑进行扫描。扫描的过程中对被扫描者进行提问，被扫描者进行思考的时候，脑回路就会产生电流，这个电流会被记录下来。通过分析电流的路径就可以知道对应的脑回路是什么。在大脑扫描过程中，一个志愿者出了意外，在对大脑进行扫描后，他竟然患上了恐水症。希恩斯翻阅了实验记录，当志愿者在判断“水是有毒的”这句话的真伪的时候。实验设备进行了大功率扫描。
希恩斯认为，极有可能是这个大功率扫描影响到了人类的脑回路，最终导致人类认知改变。为了验证这个想法，希恩斯亲自进行实验，重复了当时的场景，结果发现自己也患上了恐水症，认为水是剧毒的。在经过了长时间的心理辅导后希恩斯才恢复了正常。通过这次意外事件，希恩斯发现了解析大脑研究的副产物。那就是可以通过对大脑特定的脑回路进行扫描，对这个脑回路进行修改，同时改变人类的认知。希恩斯把这项技术称为思想钢印。危机16年（）-希恩斯线-思想钢印
希恩斯找到了常伟思，向他介绍了思想钢印的研究成果，建议在军队中利用这项技术建立必胜的信念。常伟思对此并不看好，他认为必胜的信念应该建立在科学理性之上，通过机器改变人的思想是一个非常糟糕的科学创意。
果不其然，在面壁计划听证会上，希恩斯的想法受到了否决。以人类的价值观，思想自由和生命同样重要，人们难以接受自己的思想被机器支配。希恩斯几经争取，最后终于得到了思想钢印在小范围内使用的许可。这个使用范围非常严格，使用者必须是太空军军人，同时被允许修改的信念只有一个，那就是“在与三体的战争中，人类必胜。”使用思想钢印的人必须自愿且完全知道思想钢印修改的内容。
希恩斯在纽约组建了一个信念中心，为对胜利未来感到迷茫，同时又希望尽自己责任的太空军军人服务。最终一小批军人接受了思想钢印，希恩斯感到自己已经无法再为脑科学做点什么了，于是选择和妻子一起冬眠，直接前往末日之战。山杉惠子在进入冬眠的过程中突然发现了什么，她希望阻止这一切却最终没有成功。
五十五危机16-19年（-）-雷迪亚兹线-水星实验
由于超级计算机的出现，巨行氢弹的设计和制造进行的相当顺利，眼看就要进行实验了。由于巨行氢弹当量巨大，只能考虑在外太空进行试验。通常情况下可以考虑在月球上进行试验，而雷迪亚兹却另辟蹊径，要求在水星试验，而且进行的还是地下实验。
实际上对于验证核弹的威力，在水星试验和在月球试验差距不大，但成本却搞出许多。既然在外太空实验，那么进行地下试验也没有必要。在水星上挖掘超深井成本也非常高。雷迪亚兹的计划立刻受到了怀疑。雷迪亚兹为了推进水星试验计划，谎称在水星进行地下试验可以炸出一个巨大的洞穴，用于在内太阳系部署防御系统，这才让计划最终通过。
由于水星自然条件非常恶劣，整个施工用了整整3年，仍然无法挖到预定深度，但雷迪亚兹依旧继续推进实验。在这种情况下，进行实验会将水星的地表炸飞一小块，形成一个深坑，加上盖子以后依旧可以作为防御基地。水星试验结果也正如他预料，大量的岩石被炸飞，在水星边上形成了一个光环，一部分岩石甚至达到了水星的第二宇宙速度。
五十六危机19年（）-雷迪亚兹线-破壁者2
就在水星试验达到雷迪亚兹预期的时候，他也迎来了他的破壁者。这个破壁者见到雷迪亚兹后道出了他的计划。雷迪亚兹建造巨型核弹的真正目的，实际上是利用核弹的爆炸进行减速，将水星推进太阳。
雷迪亚兹在危机初年注意到了一个奇特的天文现象，当行星坠入恒星击穿恒星大气后，会导致恒星内部物质不断向外喷发。如果把水星那个推进太阳也会引起类似现象，而且这些喷发的物质会导致其他行星的减速，最终使得这些行星全部坠落进太阳。使得太阳系变成比三体星系更加恐怖的地狱。这实际上是一个同归于尽的计划，当巨型氢弹部署完成后，雷迪亚兹就会以此威胁三体人，要求进行谈判。
五十七危机19年（-）-雷迪亚兹线-摇篮
雷迪亚兹见自己的计划被戳穿，气急败坏地要杀死破壁者，却被保安拦下。由于雷迪亚兹的计划可能导致全人类的灭绝，有可能剥夺所有人类的生存权利。在之后的听证会上，英美代表就要求剥夺他的面壁者地位，并在之后对雷迪亚兹进行审判。
各国代表对雷迪亚兹群起而攻之，这时候雷迪亚兹向各国代表展示了手中的摇篮系统。这个系统无时无刻都在监控着雷迪亚兹的生理指标，并向外发射信号。一旦雷迪亚兹遭遇不测，这些信号就会停止发射。雷迪亚兹暗示有一颗巨型核弹就被部署在纽约，一旦信号停止发射，这颗核弹就会引爆。雷迪亚兹以此要挟联合国，放弃对他的审判，让他回到委内瑞拉。
联合国考虑到相关风险，最终同意了他的要求，伽尔宁送他回国。到达委内瑞拉后，伽尔宁才得知，雷迪亚兹的摇篮系统是骗人了，他不禁感慨面壁者的智慧最终却用在了诓骗自己人身上。
回国的雷迪亚兹也未能逃脱厄运。他可能灭绝人类的疯狂行动遭到了自己国民的反对，最后被愤怒的国民用石头砸死。
五十八危机19年（-）-雷迪亚兹线-复盘
我们再来复盘一下雷迪亚兹的计划，雷迪亚兹实际上利用了自己作为核弹狂热追求者的人设，把人的注意力往武器上引。他真正的计划实际上是用同归于尽作为谈判的筹码，因此水星试验才是他的阶段性目的。从思路上来说，这个策略已经接近后来的威慑了。这个计划环环相扣，展现了比较高的水平。
按照破壁者的说法，即使倾全力制造核弹，也无法达到让水星减速的目的。这也未必可信，因为ETO总是低估了人类技术的发展水平，从后期人类的太空舰队来看，制造大量核弹也是可能的。
当然这个计划不确定性很大，水星能不能真正减速，减速后能不能导致太阳物质喷发，实际上是无法进行试验的。由于这个不确定性，计划对三体人的威慑力就会大大下降。另外，从后来的剧情可以看到，人类作为一个整体无法是无法达成威慑的。
五十九时间洪流：危机19-危机年的时间线
随着雷迪亚兹被杀，面壁计划告一段落。不久之后，人类穷兵黩武的后遗症开始显现。人类疯狂地发展工业和军事科技，最后导致了环境的严重破坏，粮食大面积减产，整个社会经济开始崩溃。危机28年（）前后，世界开始进入大低谷，经济严重倒退，大量的普通人被饿死，世界人口减少了一半以上。大低估时代整整持续了50年。
大低估事情的惨痛经历让人类开始反思这场星际战争。毕竟三体入侵的结果大不了全人类灭绝，现在选择抵抗，结果三体人还没过来，自己先折腾死了一半。人们开始专注现实的生活，暂时停止抗击三体的计划。世界进入了20年左右的漫长恢复期，这期间各国都爆发了启蒙运动，人类的生活水平逐渐恢复。又过了30年左右，缓过劲来的人类又开始重新面对三体危机，这次人们开始有节制地发展军备。由于经历了思想启蒙运动，人类的技术发展非常顺利，过去的许多困难都相继被克服。
太空舰队也在这一时期开始独立，成为了类似国家一样的实体，形成舰队国际，其主要领土和活动范围都在太空中，并以国家名义参与联合国。而人类内部的ETO组织也在危机年左右被彻底剿灭。到了危机年，人类已经拥有了非常强大的太空军力量，太空舰队的速度已经可以达到光速的10%，舰队的武器可以轻易的摧毁一颗行星的表面。人类对于技术的运用也如火纯清，生活充满了科幻感。
主要角色中，常伟思，吴岳，坎特，林格，斐罗兹等相继去世。
萨伊在任期满后发起人类纪念工程，主要向外太空发射带有人类资料的无人飞行器，意图在人类灭绝后依旧能在宇宙中留下痕迹。然而这个行为会影响人类士气，最后被认为是逃亡主义，因此被官方叫停。
汪淼继续从事纳米材料的研究在90多岁时去世。
丁仪在可控核聚变取得突破后，继续进行基础物理的研究，依旧没有任何结果，他感到绝望，在70岁时选择了冬眠千万未来，见证三体人的超级技术。后来在危机年（年）前后，丁仪苏醒，继续在大学担任物理学教授。
史晓明危机19年出狱，随后成立高深公司，从事殡葬行业，最后发了大财。在看到大低估的苗头后史晓明进入冬眠，就是为了再见史强一面。
六十危机年（年），苏醒
由于人类力量的空前发展，人们发现两个世纪之前的面壁计划已经没有存在的必要了，因此太空舰队发起议案，要求终止面壁计划，剥夺面壁者权利。因此罗辑，希恩斯，山杉惠子相继被叫醒。
罗辑苏醒以后，看到了一个科幻感十足的世界，粮食可以合成，电力无穷无尽，人们生活在地下，利用一种单人飞行器出行。在周围人的介绍下罗辑很快了解了人类这些年的进步与发展。同时也知道了人类正在酝酿与三体人的和谈。而面壁计划，则成为一页历史的插曲被人淡忘。
罗辑见到了太空舰队的特派员乔纳森，在乔纳森的指导下，罗辑参加了最后一次面壁计划听证会。在视频会议期间，罗辑见到了希恩斯和山杉惠子，罗辑认为是希恩斯的计划取得了成功，希恩斯却表示，提神智力的研究也遇到了智子的壁垒，最后不了了之。会议上，太空舰队和联合国把所有面壁者都批判了一遍，随后宣布面壁计划彻底结束。
六十一危机年（年），钢印族
就在会议结束的之后，山杉惠子突然向众人表示，她是ETO成员，而且是希恩斯的破壁人。随后山杉惠子讲述了希恩斯的计划。希恩斯一直都是逃亡主义者，希恩斯本人早已经认识到人类与三体间距大的差距，正面对抗是根本不可能的。同时作为脑科学家，他清楚的知道，提神人类智力的过程涉及基本的量子层面会受到智子的干扰，根本不可能成功。
思想钢印就是希恩斯研究的目的，而并非是其副产品。希恩斯表面上为志愿者打上了人类必胜的信念，实际上暗中对思想钢印的程序做了调整，修改了其中的正负号，导致所有接受思想钢印的人都变成了彻彻底底地失败主义者与逃亡主义者。
希恩斯之所以能够调整思想钢印程序，避开智子，主要是因为思想钢印程序量过大，他偷偷该一两个符号根本看不出来。就像现在到处都是摄像机，但是发生命案以后，警方还是要一个个去看录像，一不小心就会错过一些细节。
根据山杉惠子的从智子手中得到的资料，希恩斯实际上秘密制造了4台思想钢印，并且都移交给了钢印族。如果交替使用的话，钢印族有可能一直延续下来，只要抓到时机，他们就会执行逃亡计划。
希恩斯承认了他的计划，同时他坦承他也给自己打上了思想钢印，强制自己认为在面壁计划中做的一切都是正确的。如今面对人类强大的力量，以及人类即将获胜的现实，他感到非常痛苦。山杉惠子则在完成了她最后的使命后自杀身亡，成为了最后的ETO成员。
六十二危机年（年）暗杀
罗辑终于变回了普通人，很快就到了他出院的日子，在这一天他竟然遇到了史强。史强在两个月前从冬眠中苏醒，他的病已经被治好，他原来的工作单位，已经转移到了太空舰队，理论上，他已经属于外国人了。
罗辑出院以后重新认识了这个时代，大部分人居住在地下，社会设施高度智能化，所有的平面都可以作为终端打开。在一个广告牌前，一个理财经理通过终端联系上了罗辑。由于人体内被植入了一个识别芯片，走到哪里都会被这些终端识别。通过对话，罗辑发现，他的资产在年间依旧在增值，他已经是有钱人了。同时这个时代虽然看上去发达，但人工智能水平并不高，很多复杂的工作依旧需要真人完成。看似无穷无尽的能源，只不过是通过微波将能源传播到各个设备上而已。
而从那开始，罗辑就开始遭受刺杀，先是被一辆无人驾驶飞车冲撞，然后地面下水口突然打开，害得罗辑差点从几百米高空坠落。坐下来吃饭却遭受到自动送餐机器人的袭击，好不容易到了史强家中，却差点被史强家里的沙发闷死。静下心来想买点安眠药好好睡一觉，结果送过来的却是毒药。好在一路上史强非常机警，几次将罗辑从死亡边缘解救出来。
六十三危机年（年）killer5.2
罗辑和史强面对这样匪夷所思的情况，几次报案和投诉。起初由于长时间都没有恶性案件，警方并没有重视起来。但接二连三的事故最终使得警方意识到问题，最终派人前来处理。处理这个事件的警察叫郭正明。郭正明是一个冬眠者，他首先表达了对史强的敬佩。同时也告知两人，这实际上是killer2.0病毒捣的鬼。未来世界高度自动化，所有的功能都通过机械进行，killer5.2这种病毒，就潜入到计算机系统中，操作这些机械，通过识别特定人员的身份识别芯片进行杀人。
而这次执行暗杀的病毒是ETO专门为罗辑设计，在系统内潜伏了年，直到罗辑苏醒后才被激活。而年前的病毒还能被激活这从一个侧面说明计算机技术早已停止发展。最后郭正明建议二人到地面上居住，那里有冬眠者的村落，由于没有这些自动化设备，病毒没有施展之地，就可以躲过这些暗杀。
正好史强也联系到了他的儿子，一行人来到地面，住进由冬眠者组成的新生活5村。来自各个时代在这里冬眠者幸福地生活在一起。
六十四危机年（年）执行舰长
在希恩斯的计划被点破后，太空舰队立刻紧张了起来。三体的一个探测器即将来到太阳系，舰队已经准备出手拦截。如果舰队内部真的存在钢印族的话，那么将是一个巨大的威胁。他们没有能力识别钢印族，任何人都可能成为被怀疑的对象。这种情况下只有一批人是可靠的，那就是增援未来特遣队。增援未来特遣队按照最早冬眠的队员最后苏醒的原则进行运作，在大低谷时代这些优秀的政工干部成功的控制住了局面，让太空军的力量得以发展和存续。当人类走出大低谷后，悲观局面不复存在，因此第一支增援未来特遣队，也就是章北海那支，并没有机会施展拳脚。本来舰队决定让他们直达末日之战，但面对这个局面，太空舰队决定让他们提前苏醒。由于他们冬眠的时候思想钢印技术并没有出现，再加上他们本身就因为忠诚与坚定被选中，这批人无疑是最可靠的。
这些队员被派往各个太空战舰，担任执行舰长职务，任何对飞船发布的重要指令都需要经过他们的审核，实际上他们拥有飞船的最高操作权限。
章北海被派往自然选择号飞船担任执行舰长，在这里他遇到了太空军的后辈们。自然选择号舰长东方延续当面将一只手枪交给了章北海，并表示，如果他发现了任何人的逃亡企图，都可以用这把手枪进行射击。
章北海在成为执行舰长之后在东方延续的指导下，学习太空战舰的各种操作口令与方法。在这一代太空战舰中，如果要全速进行飞行需要让飞船进入到前进四状态。但是这个状态加速度过于巨大会把人压扁，因此飞船成员需要提前进入深海状态。飞船和人体内都要被灌入一种液体，这种液体可以抵抗超高加速度，同时保证人类的呼吸。正常情况下，飞船进入前进四状态或首先检测内部是否进入深海状态，但是如果把飞船设定为遥控模式就可以绕过这种检测。
六十五危机年（年）追踪
对于即将到达太阳系的探测器，亚洲舰队曾经打算派出两架星际歼击机进行追踪。但是由于各个舰队都想争取首先与三体探测器接触，互相争夺拦截权。为了避免争端，恰好赶上钢印族的问题出现，舰队国际索性要求各方不得独自行动，所有飞船飞回驻地待命。
三体探测器进入太阳系后突然停止了推进，依靠惯性自由前进。原本人类通过望远镜观测探测器的尾焰对它进行跟踪，随着探测器的熄火，人们也就失去了它的踪迹。
林格-斐罗兹望远镜是负责观测探测器的团队之一，这个团队以两百年前哈勃二号的两位主管命名。同时也沿用了一个科学家加上一个军官的主官阵容。团队里军官是罗宾逊将军，科学家是肯博士。
面对一筹莫展的现状，肯博士提出可以利用雷迪亚兹留下的巨型氢弹。在太空中引爆从海王星上开采的油膜矿，将这些油膜状物质扩散开来，形成一片稀薄的人工太空尘埃云。三体探测器在这片尘埃云中通过的时候，就会留下轨迹，这样就可以利用望远镜进行观测了。就在人类执行这个计划的时候，三体探测器又突然启动，进行减速，人们再一次通过探测器尾焰捕捉到了它。
六十六危机年（年）自然选择，前进四
就在人们追踪三体探测器的时候，木星基地里，自然选择号的指挥权移交也在进行。章北海得到了操作飞船的口令和权限，独自在一间操作室内修改舰长口令。很快，东方延续和另外两名副舰长就发现章北海的操作时间明显比常规要长。
就在众人以为章北海在享受获得舰长权限的权利感时，章北海向他们展示了他的操作界面。他已经将飞船的目标设定为一颗遥远的恒星，同时将飞船设定为遥控状态。飞船随时可以进入前进四，这时候飞船会快速加速驶向目标，但巨大的过载会杀死飞船里的所有人。
章北海以此要挟东方延续，下令飞船全员进入深海状态。考虑到全飞船人员的安危，东方延续只能同意。深海液逐渐灌满驾驶舱，章北海最终喊出了那个他期待了年的口令“自然选择，前进四”。
自然选择号叛逃的事实震惊了太空舰队，太空舰队立刻派出了四艘飞船前往追击。完成飞船加速后，章北海从深海状态中苏醒过来，同时与舰队司令进行了通话。
原来星际逃亡一直就是章北海的目标，他提出增援未来，同时刺杀不利于星际飞船计划的老航天工作者，都是为了这个目的。他对舰队司令表示，当年未来史学派已经预测到了大低谷和大低谷之后的繁荣。但是这些表面上的繁荣依旧是低技术的，纸面力量人类太空军比三体人强大，但是由于基础科学的落后，一旦与三体人交手必然不堪一击没有胜算。章北海作为一个军人必须尽责任延续人类文明，因此他选择了逃亡。
此后，章北海将战舰的指挥权重新移交给东方延续，同时要求她保证，不要消耗燃料进行战舰的减速。章北海在年来的心路历程记录在他的笔记本上，然后因为疲惫睡去。
六十七危机年（年）乐极生悲
人类空前膨胀的军事力量，让所有人都认为与三体人不堪一击，三体人即将求和谈判。而这个三体探测器就是前来谈判的使者。同时林格-斐罗兹望远镜发现一艘三体飞船突然开始加速，更增加了人们这种预期，但实际上，这艘飞船是去捕获云天明的。
太空舰队决定集结所有力量去拦截这枚探测器，目的就是为了向三体人展示力量。同时为了解决谁来最先接触探测器的问题，他们想到了丁仪，丁仪是一个伟大的科学家，同时不属于三大舰队，由他进行最初的接触显然最为公平。
普通的地球人却开始彻夜狂欢，他们等待着拦截行动的直播，他们认为这将是最后的战斗，从此之后就是和平的日子。
一些人甚至开始酝酿接纳三体人移民到太阳系，方案从只接受三体舰队移民后来发展到把火星专门划分给三体世界并接纳后续的三体人移民。他们在世界各地不断宣传。甚至来到了罗辑生活的小区。但小区冬眠者居多，对三体人始终非常警戒，这次宣传活动最终演变成一段闹剧不了了之。
希恩斯倒是一直沉浸在痛苦中，由于思想钢印的作用，面对人类即将胜利的表象，他一直处于精神崩溃状态。为了对他进行治疗，不得不安排专人为他制作地球即将毁灭的假新闻。
罗辑和史强却没有去看新闻，史强甚至隐隐约约的感到，这后面有乐极生悲的可能。
六十八危机年（年）水滴
地球太空舰队派遣了所有的飞船前往拦截探测器。之前已经派出的监测飞船表明，整个探测器呈现水滴状，而且是全透明的，因此人们就件三体探测器命名为水滴。
丁仪也来到了量子号飞船上准备进行水滴的考察。在考察前，丁仪提议希望量子号进入深海状态以备不测。然而舰队的指挥官却表示，水滴自毁概率不高而且即使自毁，就算它是反物质爆炸，舰队也在安全距离之外。
面对舰队指挥官自信的态度，丁仪却表示，自己是两个世纪前的古人，竟然还能在大学教物理，可见在核心科技上，地球在年间几乎没有进步。丁仪的话触动了指挥官，最后量子号与相邻的青铜时代号战舰获准进入深海状态。
随后一艘叫螳螂号的科考飞船捕获了水滴，丁仪等人遂前往考察。丁仪触摸水滴后，发现这它的表面异常光滑。再利用高倍显微镜进行观察后发现，水滴表面无论放大多少倍都看不出表面粗糙度。甚至在用锤子撞击后，撞击点的表面依旧是光滑的。丁仪做出推测，要达到如此理想的表面，要求水滴表面的分子紧密排列在一起，这种情况下只有强相互作用力能办到。
理论上强相互作用力作用范围在原子核内，三体人将这种力的作用范围扩大到分子级别，几乎就像把弓箭射到月球上一样难。这背后体现了三体人强大的科学技术，同时水滴可能是太阳系内最坚硬的物质。
意识到了危险的丁仪用最后的声音高呼，“孩子们，快跑”。随行的军官也立刻醒悟，立即要求舰队疏散。然而这一切都晚了，水滴启动发动机产生的高温一瞬间将所有的探测队员汽化。他们的信息因为强干扰，根本无法传递出去。
六十九危机年（年）全军覆灭
地球舰队看到了螳螂号的爆炸，以为水滴发生了自毁，并没有对接下来发生的事情做好准备。
水滴混杂在螳螂号爆炸的残骸中，像太空舰队高速袭来，它采取的攻击方式就是直接撞击。由于计算机技术的落后，一开始太空舰队并没有从碎片中将水滴识别出来。
水滴开始接连对太空战舰进行撞击，每一次都精确的命中战舰的反应堆，引起巨大的爆炸。爆炸产生的碎片又对其他战舰进行撞击，整个舰队乱成一团。短短几分钟，太空舰队接近一半的战舰被摧毁。直到这个时候，人类才反应过来真正的威胁，实际上就是三体发生的一个小小的探测器。随后，舰队开始对水滴进行攻击，可面对这种有强相互作用力组成的材料，人类穷尽了所有了拦截手段，包括高能激光，定向能武器等，始终无法对水滴造成有效伤害。
水滴继续攻击太空战舰，舰队在满是碎片与残骸的太空中开始艰难疏散，甚至发生了战舰相撞的事故。还有两艘战舰见逃脱无望，竟然在没有进入深海状态下全功率加速，任由内部人员被加速过载压成肉饼，只求战舰能保留下来，为了给人类留下一点太空力量，但最后他们依旧无法逃脱水滴的追杀。
在所有的太空战舰中，只有量子号与青铜时代号由于提前进入深海状态，得以侥幸逃脱。半小时后，人类所有的太空战舰都被摧毁，死伤者高达百万。
七十危机年（年）大混乱
在人类太空军全军覆没之后，整个地球文明陷入了空前的混乱中。其中冬眠者因为经历过大风大浪，情绪更加稳定一些，现代人则是彻底崩溃了。政府官员要么辞职，要么在崩溃中无所作为。
地球人要么精神萎靡彻底绝望，要么陷入末日的狂欢之中，而政府却无力阻止。混乱中的人类开展了网上抽签活动，抽出了万人的逃亡名额。但这个结果很快就被没有抽中的人否决。
人们对逃亡主义也敏感了起来，人们纷纷开始围堵太空发射场和太空电梯。一些人谣传太空船中有逃亡飞船，引得大量的人用激光笔对太空城进行照射。
一些人则开始混水摸鱼开始冒充起了救世主。
史强则未雨绸缪，开始在居委会上讨论起了冬眠者小区未来的出路，他们准备搬迁到更远的地方。
希恩斯倒是恢复了正常，人类的窘境与他脑中人类必败的信念终于一致了。
七十一危机年（年）星舰地球
章北海从沉睡中醒来，他原本认为自己会被当作叛徒对待。可没想到但他来到战舰上最大的大厅时，竟然看到自然选择号以及其他四艘追击舰队的全体成员正在列队欢迎他。地球的太空军力量已经全军覆没了，章北海因为他的高瞻远瞩成功地为人类保留下了最后的太空力量。所有的士兵一致拥护他来领导。
章北海对所有的幸存者说道，他们虽然来自地球但再也回不去了，他们将成为一个全新的组织与文明，在东方延续的建议下，这些幸存者决定成立星舰地球。
第二天星舰地球就召开了全体代表大会，他们首先确定了自己的航向仍然维持不变，按照计划将在0年后抵达目标，同时他们向联合国发出声明，正式从人类文明中独立。随后的会议中参会者又开始讨论星舰地球的社会结构，章北海此时却开始表现地漫不经心起来，他觉得这或许要等到星舰地球进一步发展以后才能最终确定，现在考虑为时尚早。章北海还推辞出任星舰地球的最高指挥官，这一切都让东方延续产生了疑虑。章北海重新要回了自然选择号执行舰长的权利，他表示希望借这个机会在飞船上好好参观学习，近距离接触一下年前他不惜一切代价得到的飞船。
七十二危机年（年）黑暗战役
星舰地球向着目标航行，但很快就面临了资源问题。0年的航行过于漫长，现有资源完全无法满足需要。唯一的可能性就是牺牲或者消灭一部分星舰地球成员。战略眼光比较强的各个舰队指挥员很快就意识到了这一点。他们陷入艰难的抉择中，要么大家都死于资源不足，要么让其他人去死，自己得到资源。但是碍于地球长期的道德观与文明观，他们都还不愿意下手去杀害自己的同伴。
这就导致很多高级军官的心理似乎都出了问题。他们害怕承担杀害他人的责任，因此开始逃避，开始无所事事。因为怕杀人的想法被人知道，开始互相防范与猜疑。甚至有人因为认为同事偷听自己的梦话而发生冲突。这让飞船上的心理专家感到诡异，他们开始以为是面对远距离航行，离开地球引发的思乡病。但这种问题一般是从下级军官开始蔓延的。渐渐的，中下级军官个们也开始认识到了这个问题，整个星舰地球都笼罩在这种简单的抉择与猜疑之下。
此时的星舰地球甚至产生了类似猜疑链的东西。大家都知道要杀一部分人才能存活，都认为对方可能杀自己，都认为对方可能认为自己认为对方会杀自己。终于有人绷不住了，终极规律号的舰长忍受不了自杀了。这个舰长的自杀等于告诉了所有人，大家都悟到了当前情况，随时有可能对他人痛下杀手。
这时候，东方延续召集了其他三位副舰长谈话。他们分析了局势，认为情况非常危险，因此准备用武器锁定其他飞船，以对不测。就在他们准备进行操作的时候，他们却发现章北海已经走在了他们前面。他已经开始启动武器，准备攻击并杀死其他飞船上的所有人。
面对再一次独自背一切的章北海，东方延续和其他三位舰长，准备和他一起行动，共同承担杀人的罪恶。而就在这个时候终极规律号的临时舰长发动了袭击。
在最后的时刻章北海坦然地说了一句，“没关系，都一样。”因为从这次人类的互相攻击开始，无论谁取得了胜利，都将导致星舰文明新的价值观诞生，那就是为了生存与发展，不择手段。这种精神违背旧有的道德，但却能让人类在宇宙中生存下去。章北海虽然因为下手晚了，没有获胜，在这场战争最后的胜利者却能继承他的希望，让人类文明继续延续下去。
终极规律号的攻击杀死了除了蓝色空间号飞船上的所有人。蓝色空间号由于在舰长储言的提前准备下，抽空了飞船内的空气，因此没有受到次声波氢弹的损伤。他们展开反击，击毁终极规律号，成为了这场战役的最终胜利者。他们收集了所有飞船的配件和燃料，向着银河中心飞去。于此同时在太阳系的另一端，也发生了同样的事件，青铜时代号飞船击毁了量子号飞船。
七十三危机年黑暗森林
星舰地球之间的相互攻击的画面传回地球，舆论一片哗然。而罗辑却从这种攻击中确认了一点那就是猜疑链的存在，这意味着他的黑暗森林的猜想可能是正确的。罗辑于是就要求史强带他去见市长，结果地下城内一片混乱，罗辑一无所获。
罗辑认为水滴的下一个目标就是他，为了避免殃及无辜，罗辑让史强带着他尽量开车前往偏僻的地方。与此同时，水滴正在向地球高速袭来。两人来到一片沙漠，罗辑为了不连累史强，准备独自一个人迎接水滴。而史强却大大咧咧的表示，他们还有再见的机会，这事情没什么大不了的。最终水滴停留在太阳同步轨道上，同时不断地对太阳发出干扰信号。罗辑这才恍然大悟，水滴的目标不是自己，即使杀死罗辑地球上也可能有其他人悟出黑暗森林理论。但只要封锁太阳，让人类无法向宇宙中发布三体坐标，也就彻底免除了后患。
虚惊一场罗辑和史强回到了冬眠者的村庄，却发现那里已经被人们包围了。所有的人如同看待救世主一样看待罗辑。而这一切只有一个原因，那就是发现罗辑发射咒语诅咒的那颗星星已经被神秘力量摧毁了。这股神秘的力量将一个小型粒子加速到接近光速，使得它拥有巨大的质量直接撞毁了目标恒星，而罗辑极有可能是这个神秘力量的代言人。
来人中还有乔纳森，他向罗辑宣布面壁计划重新启动，而罗辑则是唯一的面壁者。罗辑让众人散去，因为太阳已经被封锁，他也无能为力了。
史强这一切却无法理解，罗辑带着史强来到沙漠中，向他讲述起了黑暗森林理论。
七十四危机年黑暗森林理论解析
黑暗森林理论认为，宇宙中存在着大量的文明，自然很多文明可以发展到非常高级，拥有轻易摧毁一颗恒星的力量。宇宙文明的扩张速度非常快，导致宇宙中资源稀缺，因此宇宙文明之间本质上是一种竞争状态。宇宙中两颗恒星间距离非常遥远，即使对于高等级文明也很难对观测到恒星系之间的细节。如果这个恒星系统有文明，也无法里利用观测来确定这个文明的具体形态，以及是否有敌意。我们不可能指着天上的一颗星星就说那上面的文明是善意的。
于此同时，防人之心不可无，为了生存，我们必须假设外星人都是有敌意的，就像我们现在的科幻作品，谈及外星人，必然是外星人入侵这样的话题。类似的，可能外星人也是这么看待地球人的，这就构成了猜疑链，这导致任何文明之间都是相互敌意的。最后，科技的发展是毫无规律而言的，随时可能出现爆发性的发展，即使弱小的文明，也有可能在一瞬间变得异常异常强大。强大的文明也有点错科技树的可能。
那么这样，对于拥有轻易摧毁恒星力量的文明，最恰当的方法就是一旦怀疑哪颗恒星系内有生命，直接用武器摧毁就行了。而一旦领悟这个法则，即使是技术能力非常差的文明也能在太空中发送假消息。他们只要发送信息说某个星球有文明，自然有高等级外星人去摧毁他们，无论这个信息是真是假。即使这个信息看上去非常不可信，但有成千上万个高等级外星文明中，只要有一个相信，目标星球就必然被摧毁。
而罗辑的计划就是利用这一点和三体星人谈判。只要地球向外太空发送三体星系的坐标，那么三体人就一定会被高等文明摧毁。但这一切却有一个问题，那就是三体星系距离地球是非常接近的。有些办事比较小心的外星文明在接到消息摧毁一个星系的时候，也会查询一下这个信息是谁发送的，发送者肯定也是一个有点水平的文明，因此就顺便把发送者也清理掉。
如果地球科技水平比较高，可以在远离地球的太空飞船上发送信息，这样地球本身就不会被定位。然而地球只能依靠太阳的功率放大作用，而且地球距离三体星系太近了，只要高等文明一追溯，很快就能发现信息来自于太阳系，那么太阳系也有可能被摧毁。
本质上这就是个同归于尽的战略类似与雷迪亚兹的计划，必然会遭到人类的反对，而全人类作为一个整体是不可能同意这个荒唐的计划的。罗辑能做的只有以同归于尽为筹码，独自与三体人进行谈判。
七十五现实中的黑暗森林
自从三体二发表以来，其中的黑暗深林理论变得广为人知。非常多的人把他作为费米悖论的唯一解。认为现实宇宙中也存在着黑暗深林理论。
当然黑暗深林理论之所以吸引人，还是在于它内部逻辑是非常严密的，人们很难进行证伪。这也是书中这个理论的魅力所在。
但是要说现实宇宙中也存在黑暗深林并且把它当作费米悖论的唯一解释，这就比较牵强了。
首先书中假设的宇宙的生命和文明普遍存在，在显示宇宙中恐怕不是如此，生命存在的条件应当是相当苛刻的，至少我们目前没有看到火星，金星，木卫2上发展出文明。而这几个地方的环境比起三体星系简直不要好太多。所以单纯从我们的观测上来看文明的产生就非常困难。估计在距离地球0光年以内，都不会有达到地球文明水平的星球。
第二是技术爆炸这个假说也很难站住脚，相反回顾我们地球的文明，很多文明发展到一定程度以后科技就停滞了，从玛雅文明，到我们中国文明，甚至到近几十年以来我们的全人类基本理论都没有更新。很多文明实际上遇到的应该是技术奇点而非技术爆炸。
所以黑暗深林理论机关逻辑自洽，但是未必是我们当今宇宙的真理，用一个科幻小说中的理论去解释现实宇宙，甚至排斥其他的理论是没有必要的，终究这只是小说设定而已。
七十六危机-年雪地计划
罗辑虽然恢复了面壁者的权限，但是面对已经被封锁的太阳，他实际上也无计可施。他希望能用面壁者的权限让妻儿苏醒，共同度过最后的时光。但和两个世纪前一样，联合国再次用孩子来要挟他们。这时联合国建议他可以来领导雪地计划。雪地计划的目的就是利用巨型氢弹引爆油膜矿，造出大量的人造星际尘埃。利用这个尘埃来追踪将要到来的三体舰队，这终究是没有意义的。实际上面对三体人的入侵，人类已经无能为力了。
但联合国依旧主导了这项计划，希望这项计划能给灭亡前的人类以最后的安慰。而罗辑身上的神话光环正好适合来领导这个计划。
雪地计划整整持续了3年，这期间罗辑全身心地投入到计划中，甚至对许多技术细节，比如说核弹的位置都小心地进行调整。而旁人看来，罗辑的神力消失了，人们渐渐发现不能发射咒语的他只不过是个普通人罢了。他不过把全身心投入在工作中，以此逃避现实，获得与妻女相会的机会而已。人们曾经对罗辑抱有多大希望如今就对他有多失望。罗辑也渐渐不受信任，失去了权利。
失望的民众不断来到罗辑居住的小区，对他进行骚扰和谩骂，最后导致小区居民不胜其烦，最终在一个雨夜，罗辑被驱逐出了小区。
七十七危机年终极对决
离开小区的罗辑在雨中独行，前往目标中的终点，那就是叶文洁与杨冬的墓前。一路上罗辑不断受到众人的嘲讽，想搭个车，却因为面壁者的身份被识破，被赶下了车。他在凄冷的雨夜中独行，终于来到了目的地。两个世纪的时光过去那片墓地已经面目全非。但罗辑还是找到了杨冬和叶文洁的墓碑。在墓碑旁，罗辑开始给他自己也挖好墓穴。由于体力透支加上淋浴感冒，罗辑的身体状况非常差，几次昏睡过去，在临近清晨的时候，罗辑完成了工作，同时开始了和三体世界最终的对决。
罗辑用一支手枪指着自己的心脏，向三体世界发出威胁。他身上有一套摇篮系统，只要他自杀的话，这个摇篮系统就会像部署在太阳系中的几百颗巨星氢弹发送信息。巨型氢弹被引爆后将会制造星际尘埃。这些氢弹的位置和时机已经被罗辑仔细调整过，它们产生的尘埃会对太阳光进行有规律的遮挡。外界在观测太阳系时会发现太阳在可见光波段闪烁，这种闪烁会将三体系星系的坐标发射到宇宙中。最后让地球与三体星系被高级文明毁灭。
三体人费尽心机终于棋差一招，在罗辑的威胁下，智子不得不出现与罗辑进行对话。罗辑提出要求让水滴停止对太阳的干扰，让后续的水滴和三体舰队偏转离开太阳系。由于黑暗森林状态成立，三体人不得不放弃入侵地球的计划。至此地球人终于获得了活下去的机会。罗辑希望自己能摆脱救世主的命运，不再参与后续的谈判，静静地回到家中与妻儿团聚。
从此人类进入威慑纪元。
三体二完结
七十八威慑纪元事件总结——执剑人罗辑
由于作者在写完三体二后并没有准备写第三部，因此三体二结尾的一些内容与三体三的设定存在一些矛盾的地方。尽管作者借程心的回忆录圆了一些设定。但两本书间始终存在着一定的违和感。三体二的末尾实际上算是一个大团圆结局，在一些地方和三体三的基调矛盾。考虑到三体三的剧情，在对威慑纪元事件的解读中，会尽量以三体三的世界观为主，抛弃一些三体二中的设定。
罗辑在完成威慑后将摇篮系统转移给联合国。但联合国很快就发现，以人类为一个整体根本就无法完成对三体世界的威慑。首先，以人类为整体决策与三体人同归于尽，一定会有一个漫长的表决和扯皮的过程。这期间，三体人就可以摧毁人类的坐标发射系统。另外一个人的行为不太好预测，但是一个社会的整体行为是可以大概预测出来的。按照人类社会的价值观，根本不会和三体人同归于尽。
意识到这一点的联合国迅速将威慑权还给罗辑，而三体人由于谋略不发达并没有抓住这个宝贵的反击机会。
地球人同时开始与三体人进行谈判。主要结果就是三体人帮助人类建立以引力波为主的威慑系统，可以随时向宇宙外发射三体的坐标。然后三体人开始向地球人传送先进的科学技术。
由于三体人的技术传递人类很快掌握了引力波发射技术，开始建立威慑系统。原计划威慑系统要建立30个。威慑五年（年）第一个引力波天线在罗辑家附近建成。但危机6年出现了极端分子攻击引力波天线，企图向宇宙广播地球三体坐标的事件。为了减少防卫压力，最后人们将引力波天线缩减到4个，其中一个由万有引力号太空战舰搭载。
在这期间罗辑一直和妻儿生活在一起，同时掌管威慑系统，担任执剑人的角色。在引力波天线完成后，罗辑带着家人前去参观。在那里智子要求与罗辑通话，原来三体号监听员从脱水中恢复。他希望和罗辑对话，对话中他们都希望两个文明能够最终相互理解，一起生存下去。
就在和三体号监听员对话后不久，罗辑意识到自己如果继续和妻儿生活的话，就会萌生作为普通人人性的一面。他会因为不希望妻儿死去而选择在三体人入侵时放弃威慑。甚至即使罗辑依然有着与三体人同归于尽的决心。但只要三体人认为罗辑心软了就依然有可能动手，反而增大了发动威慑的概率。为了守护地球，罗辑即使是在表面上也要做出随时与三体人同归于尽的打算。因此罗辑让妻儿离开，自己却独自住进不见天日的地下掩体中，手持威慑系统，开始了与三体人漫长的周旋。
七十九威慑纪元事件总结——诱降
黑暗森林理论被全世界知道。人类一度惊恐地关闭了无线电通讯设备，害怕这些电磁波被高级文明捕捉引发黑暗森林打击。同时对于末日战役中逃亡的飞船，人类也开始戒备了起来。人们开始担心这些远航的飞船泄露人类文明的坐标。人类开始诱降这两首飞船
威慑13年（），归乡心切的青铜时代号飞船被成功诱降回到太阳系。飞船的船员原本期待着受到英雄般的欢迎，并且可以在地球上度过余生。但最终等待他们的确是冷酷的审判。
在审判过程中，青铜时代号为了生存攻击同伴，甚至将量子号船员的遗体作为食品补充的行为，深刻地冲击着地球人。人们意识到一旦进入太空，人类的思想就会变化，现有的价值观就不再存在。
青铜时代的大部分人都受到了重判。在进行服刑前，还要有部分人员配合完成战舰的交接。在这个过程中，一名军官史耐德乘人不备，启动了青铜时代的通讯系统。在被乱枪打死之前，他用最后的力气向太阳系另一端的蓝色空间号呼喊道
“不要返航，这里不是家。”
蓝色空间号也收到了诱降信息，但舰长储岩更加警觉，并没有立即返航，在收到来自施耐德的警告后他们立刻加速离开太阳系。
地球随即派出唯一具有远航能力的万有引力号进行追击，由于万有引力号上加装有引力波天线。地球和三体文明都担心它在未被批准下发送三体坐标，因此三体人决定派两个水滴进行伴随飞行。
八十威慑纪元事件总结——三体技术爆炸
由于三体人的技术输入，人类的生活水平进一步提高。同时由于三体人的威胁不在存在，人类并没有维持强大的太空力量。只是准备建造几艘太空战舰，战舰上也不再搭载武器，而是装置着引力波天线，作为发动威慑的平台。人类社会思想再次发生变化，在威慑的摇篮中坐着美梦不愿醒来。
三体人依旧在恶劣的环境中艰难求生，为了生存下去，它们开始策划对地球的反攻。在威慑纪元10-30（-）年间的某个时间点，三体舰队的一艘加速飞行的战舰截获了云天明的大脑。后来云天明身体被克隆出来。云天明在三体舰队的遭遇无人可知（除了他自己透露给三体人写过小说之外）。但后来的剧情可以看到，云天明在三体世界有非常高的地位。他有自己的自留地，可以调用智子，甚至后来能够获得飞船和小宇宙。按照三体人的不养闲人的作风，云天明一定为三体人做出了贡献。一般的观点认为，对云天明可能导致了三体的技术爆炸或者直接策动了后续三体人的反攻。
在威慑纪元期间，三体人出现了技术爆炸，他们的技术层次更上一层楼，获得了光速飞行的能力。三体人出现技术爆炸的原因不明，可能与研究了云天明的大脑并且与人类社会交往，接触到人类的部分文化有关。或者是在严酷的形势下激发了自身的潜力。
八十一威慑61年（年）——DX
罗辑从危机五年之后就进入地下掩体，终日拿着引力波坐标发射系统一言不发的与三体人对峙。在他的庇佑下人类文明接收三体技术，快速发展着。星际航行技术的成熟也让殖民与开发遥远的恒星成为了可能。
当人们把开发的目光投向太阳系周边光年以内的恒星的时候，竟然发现DX是有主人的。它早已在多年前的群星计划中被买下送给了程心。随后一个叫艾AA的天文学博士发现这颗恒星周围竟然有类地行星，更加增加了这颗恒星的价值。而程心作为这颗恒星的主人也被唤醒处理产权问题。
程心苏醒以后了解到阶梯计划再也没有消息，云天明的大脑迷失在太空中，觉得自己坑了云天明。因此并不愿意用云天明留给自己的星星谋利，把星星卖掉。她希望无偿捐赠星星，却受到了联合国傲娇的拒绝。最后双方取了个折中，程心卖掉了恒星系统中的行星，但仍然获得了巨大财富。为了打理这笔财富，程心在艾AA的建议下成立了星环公司，并由艾AA协助公司的运行。
苏醒以后的程心发现，这个社会已经女性化了，男女之间的差异也已经分不清了。而三个世纪前的男人，在艾AA等人的眼光中已经变成了粗鲁的象征。艾AA还立下了flag说根本看不上古代男人。
八十二威慑61年（年）——执剑人
经过了60多年的和平生活，人们对罗辑的态度也发生了变化。罗辑本是人类文明的守护者，但他一人执掌着地球和三体两个文明的生死，某种意义上是两个星球上权利最大的人。人们渐渐对罗辑表现出了独裁者的恐惧。这种恐惧催生了人们对他的批判，他发射坐标摧毁一颗恒星的事情又被翻了出来，人们认为那颗恒星上有生命，而罗辑残忍地杀死了他们。
在这种情况下加上罗辑年事已高，联合国开始决定撤换执剑人。而程心此时由于低价卖出了两颗行星，被人们奉为道德典范，人们对她都非常感激，因此有可能被推举为执剑人。艾AA也感觉到了这一点，问程心会不会用一个按钮让两个文明同归于尽，程心倒是立下flag自己根本不会碰到那种情况。
另一方面执剑人的竞选也即将开始，参选的人大部分都是公元纪年的出生者。而维德也在参选者之列。维德也意识到以现在的社会风气，程心必定当选，而程心这个人是根本没有威慑力的。他认为只有自己是执剑人的合适人选。因此维德决定暗杀程心，他伪造艾AA的邮件，邀约程心，在程心赴约的时候用手枪射击她。结果因为枪法不好没有造成致命伤。另外一个执剑人候选者毕云峰察觉到异常提前报警。警方发现维德伪造艾AA邮件后立刻赶到现场，在维德补枪的关键时刻打断了维德的手从而救出了程心。
八十三威慑61年（年）——智子
程心受伤后进一步得到了社会的同情，在康复过程中她开始了解新时代的文化。艾AA带她看了这个时代的文艺作品，并告诉她很多作品的作者实际上是三体人，两个文明间的文化交流已经变得非常频繁起来。
此时三体人利用智子操作着一个机器人作为与人类沟通的大使。这个机器人的外貌是一个传统的日本女性。在得知程心出院以后，智子通过艾AA传话要求见程心。在会见过程中智子用茶道招待了程心，同时暗示她有可能成为执剑人，希望在那以后她能够守护两个世界。
在与智子见面的第二天，另外六个执剑人候选者见到程心，劝她放弃选举。他们也和维德一样预料到了程心的当选，以及她当选后的隐患。
在与执剑人会面后，程心前往纽约，参加联合国的移交仪式，正式将两颗行星进行移交。同时他们也竭力劝说程心参选执剑人。在走出广场的时侯，程心看到了一个可爱的婴儿，并忍不住抱起了他。此时的程心经过维德的刺杀，看到这些公元人如此积极的参选，误以为这一切都是执剑人巨大的权利带来的诱惑。自己不应该让如此巨大的权利落入这些野心家的手中。回想往事她希望能用爱来守护两个世界，守护无数像这样普通的婴儿。同时她也看到了罗辑成为执剑人后痛苦的生活，她也希望经历这样的痛苦，来减轻对云天明的愧疚，最后程心不顾劝阻毅然参加了选举。
八十四威慑62年（年）——万有引力号
于此同时，在距离太阳1.5光年外，万有引力号与水滴对蓝色空间号长达半个世纪的追击即将结束。在过去的50年中，两艘太空战舰进行了复杂的博弈，由于万有引力号燃料充裕，同时又智子的情报，他们对蓝色空间号的燃料状况一清二楚。蓝色空间号由于要考虑未来到达目标恒星的减速过程，一直不敢过多的使用燃料进行加速。就这样万有引力号始终保持着比蓝色空间号高的速度，二者距离越来越近。追击进行了25年后，由于燃料缺乏，蓝色空间号放弃加速，但依旧在高速向太阳系外逃离。
万有引力号一直在发信息要求蓝色空间号投降，但后者并未理会，到了1年前也就是年。万有引力号进入智子盲区，智子的通讯被截断，他们再也无法获得蓝色空间号的信息。此时蓝色空间号发回消息，希望将部分有谋杀嫌疑的船员移交回地球，另一部分则继续进入太空。而这也受到了万有引力号的拒绝，蓝色空间号随之开始减速，两艘战舰的距离快速缩小。万有引力号随机全员从冬眠中苏醒，进入战斗状态。
八十五威慑62年（年）——异象
而就在这时候万有引力号上开始出现了异象。首先是有些船员似乎发现蓝色空间号的陆战队员出现在战舰中。随后，在层层保护的飞船内部竟然发现有管道受到微陨石撞击，但是飞船外壳却并没有发出泄露警报。还有军官在偷窥的时候发现，飞船上的女兵似乎被整整齐齐地切成两半，更有甚者发现飞船的后半部分短暂的整体消失了。随船的心理医生却把这一切都归咎于幻觉，没有认真对待。
万有引力号上的心理医生韦斯特发现在舰尾工作的随军科学家关一帆的精神状态也出了问题。作为专家的他就前往探视，几句简单的交谈，韦斯特认为关一帆实际上患上了幽闭恐惧症。起初他以为关一帆是在狭小的空间里待太久了，希望他能走出球形仓去大厅里走走。但即使这样关一帆的情况也没有改善，他自述曾经在梦中走进过一个非常广阔的空间，回来后就发现自己所在的空间非常狭窄，无论走到哪里都无法缓解。
关一帆还说起了三与三十万综合征，宇宙如此广大竟然只有三个维度，最大速度也仅仅是30万千米每秒。就像一个高位截瘫的病人。
八十六威慑62年（年）——袭击
程心成功当选了执剑人，她来到地下掩体和罗辑进行交接。得知自己的使命结束，罗辑站起身对着面前的白墙鞠躬致意，随后离开现场。然而人类并不感谢罗辑，在交出执剑人权利后，他也受到了国际法庭的审判通知。
程心接过了引力波信号发射器，但从潜意识里，她没有明白威慑的意义，她认为自己的任务只不过是在这个地下掩体里度过余生罢了。她根本没有想到三体人会借机发动攻击。而另一边三体人为了这次反击酝酿已久，长期以来对地球的文化渗透，终于让地球人选出了一个毫无威慑度的执剑人。程心成为执剑人后三体人的攻击立刻发动，伪装成太空垃圾的水滴，迅速向地球冲来。另一方面借口保卫万有引力号的水滴也开始了猎杀计划。从水滴发动攻击，到水滴摧毁所有的发射系统，有不到10分钟的反应时间。在这期间，程心因为无法承担毁灭两个世界的责任，最后放弃了威慑操作。三体人摧毁了所有地面上的引力波发射系统，
八十七威慑62年（年）——魔法战舰
在水滴对地球进行袭击的同时，伴飞万有引力号战舰的水滴也开始了攻击。万有引力飞船上所有的成员，自知无法在水滴的攻击中幸存，全都放弃了抵抗。隐藏在飞船上的反执剑人亨特却如释重负。亨特在上飞船的时候接收到了一个秘密任务，那就是时刻监视引力波发射系统，当有人试图非法启动引力波天线的时候，负责摧毁天线。为了时刻保持监视，亨特伪装生病不能冬眠，在此后的时光中一直苏醒着。周围的同事因为冬眠还是年轻时的模样，而自己却只能孤独的慢慢老去。就在袭击发生时，亨特反而如释重负，他的任务结束了。
然而想象中的毁灭没有到来，万有引力号的成员发现，水滴突然失去了动力，然后被蓝色空间号的成员捕获。蓝色空间号竟然能俘获强大的水滴，这彻底超脱了所有人的预料。舰长莫多维奇立刻意识到情况不妙，蓝色空间号能够俘获水滴，那么也有可能控制天线。他试图摧毁天线，但是自毁系统没有任何反应。莫多维奇立刻带人向引力波天线奔去，而老亨特由于身负特殊任务，更加敏感已经先他们一步去查看。结果在引力波天线附近，他遇到了蓝色空间号的陆战队军官朴义君，两人开始交手，就在亨特连续击中朴义君取得优势的时候。莫多维奇带人赶到，此时他们看到了诡异的景象，亨特的心脏竟然从体内被拉出，而他的身体表面上竟然没有任何伤口。
随后来自蓝色空间号的突击队突然出现在万有引力号飞船上，控制了整个战舰，万有引力号的所有成员目瞪口呆，蓝色空间号成为了一艘有魔法力量的战舰。
八十八威慑62年（年）——同归于尽
蓝色空间号控制局势后，将两艘舰队的所有人聚集在一起。蓝色空间号的舰长储岩向众人展示几天前观测到情况，在太阳系和三体星系之间的尘埃带中，大量的战舰在其中通过，产生了一片片冲击轨迹，而从这些轨迹判断，三体又开始派舰队对地球进行入侵，而且三体舰队的速度已经达到光速。
再结合之前水滴攻击万有引力号，储岩推测三体的反攻已经开始，地球也受到了攻击了。他们在万有引力号飞船的通讯信息中发现了程心参选执剑人的信息。判断出地球由于社会形态变化，可能把程心这个没有威慑能力的人选为了执剑人。那么威慑就无法发动，三体人已经取得了先机，甚至已经开始了对人类的灭绝。
储岩原本计划夺回万有引力号，重建威慑。但此时储岩得知，万有引力号上的引力波装置将在1个月后失效，重建威慑已经不可能了。此时唯一的选择就是发布引力波广播，让三体与地球同归于尽。在这个过程中，三体占领地球就没有意义，地球人可以免除被屠杀的命运，同时还有几十年在黑暗森林打击到来之前进行星际逃亡。
储岩最后决定用投票来决定是否启动引力波广播，最后大部分船员统同意启动广播，就这样地球和三体星系的坐标被发送到宇宙中。由于此时两艘战舰依旧处于智子盲区，因此三体人并不知道他们的计划再一次功亏一篑。
八十九威慑62年（年）——四维碎片
在发射引力波广播后，储岩向万有引力号成员解释了他们魔法般力量的来源。那就是他们发现了四维时空碎片。在这片宇宙空间中，存在着大量的四维时空碎片。当这些碎片与三维空间接触的时候就会出现翘曲点。三维空间的人就可以从翘曲点进入四维空间。而在四维空间内，任何三维空间的封闭区域实际上都是开放的。因此他们从四维空间中可以轻易的进入水滴内部，破坏水滴。同时他们也可以偷偷潜入万有引力号。
实际上万有引力号也遭遇了四维空间碎片，那些异象就是四维空间碎片的产物。但由于万有引力号上人不多，因此并没有引起注意。
莫多维奇和关一帆进入了四维空间，被四维空间的无线细节和广阔深深震撼。同时也感到诧异，三维空间中为什么会有四维空间碎片呢。随着万有引力号的加入，他们有了更多的科研仪器可以对其进行研究。通过望远镜他们发现四维空间中竟然有物体，从种种细节发现，这肯定是智慧生物的产物。
关一帆试图请缨派遣太空艇对这两个物体进行考察，但这个计划太危险了，四维空间中距离难以确定，而且容易受到微陨石的袭击，通讯信号也很难传递。两艘战舰在四维空间中已经几次受到撞击，考虑到这个危险，储岩决定退出四维空间碎片。关一帆距离力争最终获得了考察机会。
九十威慑62年（年）——次元对话
关一帆与卓文，韦斯特组成调查队借由太空艇向四维空间内的物体出发，由于在四维空间内难以把握距离，他们小心翼翼地航行，最后甚至差点撞上目标。来到目标附近后，一行人向目标发送信息，在初步沟通后，他们又将飞船的语言翻译系统发送给了对方。对方接收翻译系统后很快就我完成了解译，双方开始进行沟通。
在沟通中，对方表示他是四维空间中的墓地，就像干涸水塘里的鱼，水一消失就会死去。而他们的世界原本是海，但现在海被一部分鱼弄干了，弄干海的鱼提前上了入地，从一片黑暗森林，进入了另一片黑暗森林。
关一帆惊讶于不同次元的文明都有黑暗森林这个词汇，而且意思还一样。临别他们送了一个生态球作为纪念，随后返程离开四维空间。这片四维空间碎片不断在缩小，内部的物质也不断地变成三维物质，四维结构也逐渐消失变成了3维时空的基本粒子。几周后这片空间完全消失殆尽。与他们对话的高次元文明也在这个过程中灰飞烟灭。
两艘飞船重新起航，他们将愿意回到地球的人放入冬眠仓发送回太阳系。而剩下的人则向宇宙深处航行。
九十一威慑62-63年（年）——失落的世界
回到地球这边，程心放弃了威慑，同时由于智子盲区的存在，三体人并不知道，万有引力号已经发射了坐标。因此三体人认为已经完全控制了地球的局势。程心和艾AA来到了被水滴摧毁的发射天线旁，在那里他们遇到了智子，智子告诉二人三体的计划，同时指出程心根本没有威慑度，如果是维德当选的话那么三体人的计划将无法实现。
威慑结束后，人们虽然悲观，但三体第一舰队已经无法返回太阳系了，三体第二舰队就算来到地球也要几百年时间，人类还可以在灭绝前度过平静的生活。可就在威慑后38天，三体舰队的航迹被观测到了，随后通过三体舰队经过尘埃云的时间计算。舰队的速度已经达到光速。同时人们发现在这个过程中，三体第二舰队似乎刻意在远离地球和三体星系的地方进入和脱离光速。这么做的具体原因未知，只能理解成进入和脱离光速至少会产生恒星级的大影响。
人类的幻想彻底破灭，同时三体人表示，这次不会灭绝全地球人，而是会让地球人居住在澳大利亚。但是为了限制人类文明，移居澳大利亚的地球人不能携带任何现代装备。起初并没有人响应，但后来水滴袭击了几个城市造成了数十万人的伤亡，同时三体人欺骗人类，如果人类配合移民澳大利亚，日后开发火星之后会允许人类继续移民到火星，人类这才开始移民。
在这种情况下地球人分化为3种势力，普通地球人接受移民建议，开始像澳大利亚移民。同时三体人为了对地球进行控制，开始招募伪军，也就是地球治安军。地球治安军可以获得优异的生活条件，因此超过10亿人报名，最终万人入选。而那些落选者反过来又开始批判者些入选者。于此同时另一批地球人开始组织地球抵抗组织，这个组织以罗辑为精神领袖，曾经的6个执剑人候选者作为指挥官。由于存在水滴和智子的存在，地球抵抗组织损失惨重。指挥官中只有曹彬和毕云峰生存了下来。
九十二威慑63年（年）——澳大利亚
程心和艾AA也随着移民来到了澳大利亚，随着人口越来越越多，澳大利亚的生活环境也越来越艰苦。食物和资源采用严格的配给制，只能保证基本生活。程心和艾AA和另外六个人挤在一个房间里。由于程心放弃威慑，其他人就把气撒在了她身上，不断地骚扰欺负程心。还有很多人得知程心的居住地以后也前来骚扰破坏。此时和程心站在一起的只有艾AA，她为了保护程心不断地和这些人冲突。
后来又一个叫弗雷斯的土著老人邀请程心和艾AA和他一起居住。弗雷斯是个公元人，曾经致力于保护澳大利亚土著文化，他的乐观和豁达给了程心很大鼓励。从后续内容来看，弗雷斯给予程心与艾AA庇护可能受到了三体人的暗示和默许，这一切应当与云天明有关。
程心还抽空去看了维德，维德被判了30年，也来到了澳大利亚劳改。程心看着他艰难地用一只手钉钉子，十分愧疚。而维德却暗示程心离开澳大利亚，他已经预感到了不好的事情即将发生。
九十三威慑63年（年）——堪培拉惨案
移民过程越来越难也越来越艰苦，人们在痛苦中等待三体舰队的到来。因为智子承诺，三体舰队到来后会协助人类建立大澳大利亚共荣圈。终于在期限到来时40亿人类挤进了澳大利亚。
而这时候，地球治安军却开始对澳大利亚的电力系统和运输系统开始轰炸。澳大利亚本来就挤进了那么多人，这些人都依靠这些设施生存，如果这些设施被摧毁，现有的资源根本无法满足这些人的生存。
程心发现维德的预测是正确的，三体人即将开始对人类进行灭绝。她希望能够至少救出艾AA和弗雷斯，抱着这个希望她去了市政厅，见到了市长，希望能够凭着前执剑人的面子能够见到智子。此时市政厅也一片混乱，市长根本没有这个权限。虽然看程心不爽，但市长还是好心提醒她不要乱跑，现在外面非常危险什么事情都可能发生。
就在此时，智子发表了演讲，她表示破坏电力系统和运输系统都是安排好的。由于基础设施破坏，人类将没有足够的食物，无法养活40亿人。这些人中的大多数都会在即将到来的仓残酷竞争中死去，只有几千万人能存活下来。粮食少没关系，在竞争中失败死去的人就会成为粮食。
智子发表演讲后周围一片骚动，程心因为无法承受这个结果心理受到刺激，因此双目失明。在慌乱的人群中一个地球治安军军官找到程心，他们是受三体人（也有可能是云天明）的命令来保护程心的。程心请求与智子通话，希望她能安排艾AA和弗雷德离开。智子建议程心也一起走，否则她只会成为其他人的食物。程心则因为对人类的愧疚，决定独自留在澳大利亚等待最后的结局。
九十四威慑63年-广播7年（-年）——广播纪元
就在程心决定赴死的时候，万有引力号发动威慑的信号传到地球。随着威慑的发动，三体人占领地球已经毫无意义，因此他们的第二舰队也开始转向离开太阳系。痛苦的大移民终于结束了，人们终于可以离开澳大利亚，在地球被高级文明摧毁前过一段平静的生活。人类从此进入广播纪元。
程心和艾AA离开澳大利亚，程心由于失明加上心理压力过大，因此进入冬眠等待治疗手段的出现。艾AA开始为程心打理资产，她成立的星环公司进行太空开发，混得风生水起。于此同时蓝色空间号和自然选择号，以及地球抵抗组织都被人奉为英雄。而地球治安军则受到批判和惩罚，大量成员被处决。人们也开始反思执剑人的问题，当并没有对程心过度批判。毕竟她是全球人民选出来的，而且在移民澳大利亚的时候也有苦难的遭遇。
广播3年（）年，三体星系被摧毁，但是智子并没有第一时间将这个消息通知给地球。由于黑暗森林打击发生在广播发动4年后，在考虑到发生地点距离地球1光年。万有引力号的位置距离三体星系大概也就是4光年（原文3光年，这是一个bug）。两点之间线段最短，因此打击的发动地点应该在万有引力号与三体星系之间，而且打击者接到消息以后立刻就发动了打击。
广播7年人类观测到三体星系被摧毁的影像。打击者再一次使用光粒摧毁了三体星系的一颗恒星。恒星喷发的物质立刻摧毁了三体星球，残留的星际物质在另外两颗恒星的作用下形成强烈的辐射区，三体星系彻底毁灭。只有一小部分飞船因为在另外两颗恒星背后，躲过了打击。
九十五广播7年（年）——茶道会谈
在人类观测到三体星系的毁灭后，智子短暂地发表了一个声明。随后邀请程心与罗辑去她家喝茶。在会谈中，智子向罗辑和程心介绍了三体星系毁灭的情况。她同时表示，如果地球和三体年前的通讯记录被查询，那么地球也会被打击，肯定会有谨慎的文明查询这个问题，打击也一定会到来。这个时间大概有几十年到几百年。三体人被快速打击，主要就是因为三体星系从宇宙尺度上看起来更加危险。
程心想进一步了了解打击的细节。智子透露打击可以来自宇宙任何方向，虽然方式目前看到的只有一种，但不排除有其他方式。而且人类绝对无法防御打击，唯一的手段只有星际逃亡，哪怕逃出部分人也是好的。程心却认为以地球人的价值观这种逃亡是做不到的。
程心还想进一步提问，智子却表示无可奉告。这时候罗辑发话了，他也希望问几个问题。智子出于对罗辑的尊重表示，他还可以问一个问题，三体世界绝对会据实回答，但是答案只有是，不是或者不知道三者之一。罗辑思考片刻，他提出的问题是，如果从宇宙尺度上来看三体非常危险，那么有没有另一种可能就是从宇宙尺度上来看，一个恒星系是绝对安全没有任何威胁的。如果存在这种可能，地球就可以向全宇宙发表安全声明躲避黑暗森林打击。智子表示这个可能性是存在的，但是却不再透露安全申明的发送方法。
九十六广播7年（年）——漫长的阶梯
在知道存在安全申明的可能性后，人类似乎抓住了最后一颗稻草。各路人马纷纷作出各种奇思妙想来发送安全生命。有建立引力波天线广播的，有进行自我技术阉割的。但这些方法都不能达到一个目的，那就是让一个外星文明看一眼太阳系就知道这个星系是安全的。
人们对于三体人的态度也开始改变。由于三体人掌握了发送安全声明的方法，一部分人类对它们产生了宗教热情，希望他们能像神一样把这种方法传递给地球人。而三体人由于母星被毁似乎也成为了这一系列事件的受害者。而发送引力波广播的两艘飞船再一次受到了批判。
程心再一次沉浸在痛苦中，她曾经想过自杀，但是弗雷德和艾AA又给了她鼓励，最终她还是不忍心抛下这两个朋友。
智子再次邀请罗辑和程心去喝茶，这次她一眼不发，但是在茶会的最后，智子突然表示云天明要见她。在传达了这最后的信息之后，智子烧毁了自己的房屋，从此消失在地球之上。
在会谈的最后，智子向程心透露，云天明想要见她。
九十七广播7年（年）——天梯会谈
程心和云天明的会谈在地日拉格朗日点的一个太空舱进行。会谈由智子建立实时通讯进行，会谈严禁录像和录音。云天明不得对程心透露任何重要情报，对话的内容需要进行严格审核，否则太空舱直接爆炸，程心会被炸死。
程心与云天明进行会谈，她惊讶的发现云天明重新获得了身体，在三体舰队里还有一片自留地，可以种田为生。两人的会谈中，程心几次想要套出情报，当都受到了三体文明的严厉警告。最后云天明不得不换另一种方式谈话，他说他在三体舰队这些年，就靠写小说生活。他也把少年时和程心一同写的故事在三体舰队发表了。他们就用剩下的时间来说说这几个故事，以此来回忆童年。实际上云天明小时候和程心并不认识，他们也没有写过童话。这些童话都是云天明写作的，在其中也隐藏了大量的情报。他把这些作品以自己和程心的名义发表，因此并没有引起三体人的怀疑。
云天明说完这三个童话后，会谈结束，临别时程心和云天明约定在他们的星星上再次相会。，程心平安归来，很快就被带入人工智子盲区，在那里她将云天明的三个童话复述了出来。由于这三个童话显然隐藏了重要情报，因此人类专门成立了一个组织来对着三个通话进行解读。
九十八广播7年（年）——三个童话
云天明童话的剧情发生在无故事王国，这个王国在一个孤岛上，周围被海水包围，海水中有饕餮鱼，会吞噬一切导致没有船可以出海。
无故事王国皇家有一个公主（露珠公主）两个王子（深海王子与冰沙王子）。深海王子小时候被困在海上的一个孤岛中。露珠公主是王位的继承人，而冰沙王子对此不满开始密谋篡位。他找到邪恶的针眼画师，针眼画师的能力就是把见到过的人画下来，那个人就消失被封进画里。
针眼画师的师傅是空灵画师，针眼画师在学会绘画以后，第一步就把空灵画师画进了话里。好在空灵大师早有防备，他用一把只有不断摇动才会打开的伞把自己遮蔽起来免疫了诅咒。随后针眼画师开始作画，国王和大臣一个个消失。空灵画师找到公主，告诉了它们针眼画师的阴谋，他要求公主的奶妈宽姨帮他撑伞，这样他就能腾出手来抢先画出针眼画师让他消失。画师要将画画在雪浪纸上才能发挥作用，然而雪浪纸是天然弯曲的，不借助一种黑曜石根本压不平。众人一阵折腾好不容易压平雪浪纸却发现时间已经来不及了，针眼画师即将画到公主。
空灵大师决定牺牲自己，把伞给了露珠公主，并嘱托他们去寻找深海王子，随后就消失了。
公主和宽姨还有卫队长启程去找深海王子。三人历经艰难来到海边，却发现海里都是饕餮鱼，什么东西只要一下水，就会被吞噬殆尽。天亮以后他们远远就看见了深海王子，即使从远处看王子也和正常人一样大小，估计就是一个巨人。
就在三人对如何登上孤岛见到深海王子一筹莫展的时候，上涨的潮水非常巧合地将公主用的肥皂卷进了海里。公主的肥皂是一种魔法肥皂，产于赫尔辛根莫肯斯的一种泡泡树上。泡泡树成熟的时候，会产生许多没有重量的泡泡，泡泡可以轻易被风吹走，只有骑着快马才能捕捉到。
肥皂进入海中后产生大量的泡泡，饕餮鱼一碰到泡泡就变得异常温顺没有危险性了。于是众人找到一艘船向孤岛划去，同时将肥皂小心地浸到水里，以此产生泡沫，摆脱饕餮鱼的袭击。在前往孤岛的过程中众人惊奇地发现，深海王子大小竟然不随距离变化而变化，他们来到他身边的时候他已经是正常人大小了。
三人将王国中的一切说给了深海王子，王子随同他们一起回去复仇。冰沙王子故技重施，让针眼画师画出深海王子，结果由于深海王子不符合透视规律根本画不出来。最后深海王子杀死冰沙王子，针眼画师仓皇之间将自己画进画里。卫队长找到公主的画像将画像烧掉，公主从此就不必要再打着伞了。
深海王子加冕位国外，卫队长和公主则用最后一块肥皂乘船离开了无故事王国奔向了新的世界。
九十九广播7年（年）——僵局
显然云天明在童话中隐藏了重要情报，考虑到云天明的安全国际社会将这个情报严格保密同时人类因此专门成立了一个情报解读委员会来对情报进行解读。程心与艾AA以及另外两个执剑刃的候选者毕云峰与曹彬也参与了这个过程。
在第一次会议中程心表达了对维德的感谢，但维德在当时是公元人野蛮与黑暗的象征，这种感谢并没有引起人们的共鸣。
情报的解读工作开始展开，但人们很快发现，这项工作几乎无法进行。有价值的情报必然要通过童话中的隐喻来传达，可是对于一个隐喻实际上有着无数种解释方式，而且解读情报的人会根据自己的立场做出有利于自己的解读，因此根本无法确定云天明要表达的原本含义。
情报委员会对这些暗喻做出了各种稀奇古怪的解释，看似都有道理但没有方法实锤哪个解释是正确的。
不过至少有一点大家都达成了一致，那就是童话中反复出现了一个地名，赫尔辛根莫斯肯肯定有特殊的含义。但有一点是值得注意的那就是云天明和程心约定了在宇宙中的其他地点见面，这就说明他认为人类只有星际逃亡一个选择。
一百广播7年（年）——掩体计划
情报的解读很快就陷入的僵局，人们不得不考虑在现有的技术下如何使得地球避免受到打击。而这也就导致了掩体计划的最终出现。在观测三体世界毁灭的过程中人们发现，三体人的一些宇宙飞船因为躲在了另外两颗恒星背面而从打击中幸存了下来。
于此类似太阳系里也有木星这样的大型星体，也有掩体的作用，只要在木星背面建立太空城，然后把全人类移居过去，这样一来。即使太阳受到打击地球被摧毁人类也可以在木星上生存下来。人类掌握了可控核聚变技术，太阳被摧毁产生的尘埃云以及木星上的氢足够人类的能源需求完全可以让人类生存到宇宙毁灭。木星各个卫星上也有丰富的水资源，人们依旧可以在太空城中过上安稳的天堂般的生活。
星际逃亡计划由于人类无法掌握光速飞船技术难以实施，只能让部分人离开这就颠覆了所有人的价值观。而发布宇宙安全申明的计划仅仅存在于概念之中，实现也遥遥无期。渐渐的云天明的情报被人淡忘，人们开始把更多的精力投入到掩体计划之上。在这期间艾AA也负责起了星环集团的运营，渐渐退出了情报解读。
一零一广播7年（年）——曲率引擎
就在云天明的情报被人们束之高阁的时候，艾AA突然少女心爆发想要程心送给他一块童话中的肥皂。由于未来世界肥皂早就被淘汰了，成为了古董，二人好不容易才从博物馆里弄来了一块文物级别的肥皂。
艾AA拿到肥皂后进入浴室，放好了水然后拉着程心一起进去。她想要重复童话里的情节，做一个肥皂船的实验。这个实验的原理在中小学科技制作中非常常见，在小船的后方放上肥皂，肥皂溶解后会降低小船后面的水的表面张力，然后小船就会被前方的水拉过去。
作为专业人员，程心和艾AA立刻踩中了电门，原来云天明在童话中暗示了空间曲率驱动的存在。在三体的宇宙观中，宇宙不是平坦的时空中存在曲率，如果将飞船后方的的曲率减小的话，那么飞船就会在空间的拉扯下向前方运动。而三体人的飞船就是依靠空间曲率驱动达到光速的。
由于担心被智子监控，程心和艾AA把小船扔到一旁。两人假装聊了些其他内容随后就立即向情报委员会报告了这个发现。
一零二广播7年（年）——双层隐喻与多维隐喻
情报委员会认可了程心等人关于空间曲率驱动隐喻的解读。同时也发现了云天明传递情报的方式。首先是双层隐喻，那就是云天明故事中的情节和事物会隐喻一个现实生活中常见的东西，公主的小船和魔法肥皂实际上隐喻的都是现实生活中的肥皂和纸船。人们要通过现实生活中的肥皂和纸船再解读出空间曲率驱动的情报。
此外还有多位隐喻，也就是在童话中用多种事物隐喻一个概念，这样一来就能避免一种隐喻被任意解读的问题。比如说空间曲率驱动的概念实际上还可以从天然弯曲的雪浪纸和能把雪浪纸压平的熨斗引申出来。
顺着这个思路人们开始陆续发现云天明情报中的隐喻
首先是童话里那把莫名其妙的伞，这把伞没有伞骨，只能不断的旋转把它撑开实际上隐喻了一种古代的机械自动控制装置在没有自动化系统的情况下它可以用来控制蒸汽机的转速维持恒定，如以此做第二层隐喻就是恒定的速度。
其次就是深水王子，由于他的身高无论从哪里看都是不变的，因此他也隐喻了一个恒定的物理量。这个物理量可能是光速，因为以地球人的观点光速是恒定的。
此外还有肥皂泡，童话中的肥皂泡没有重量，而光就是无质量的，因此这个隐喻就被固定下来了。
一零三广播7年（年）——赫尔辛根和莫肯斯
于此同时另一个情报解读赫尔辛根莫肯斯也有了突破。小组内的一个语言学家由于经常在思考这个词汇，日有所思夜有所梦，竟然在梦话中说出了这个词。他的女友是一个北欧人，她发现这个词实际上就是挪威附近的两个地名赫尔辛根和莫肯斯，而且这两个地方挨得非常近。
几天后程心等人就来到了那里，他们发现在那附近的海域里竟然有一个大漩涡。为了更进一步接近事情的真相，众人就租一个当地人的船，向漩涡进发考察。很快船就被吸进了漩涡，在漩涡中不断下降，周围的水墙也越来越高。就在船快要被漩涡吞噬的时候，早已经等候在一旁的直升飞机将众人救走。身临其境的冒险让众人都明白了赫尔辛根莫肯斯的含义，那就是一个只进不出的空间，也就是黑洞。
在结合之前光速的隐喻程心等人终于明白的宇宙安全生命的含义，那就是把太阳系内的光速降低到太阳系的逃逸速度以下也就是每秒十六点七千米。在这个速度下，人类就永远无法大规模飞出太阳系，也就不会对其他任何星球构成威胁。而太阳系也就会变成了一片黑域。
随着云天明的情报被解读，人类未来的出路就有了三个路线：光速飞船逃亡路线，黑域安全声明路线，掩体计划路线。按照人类的计划，掩体计划最容易实现因此人类把更多的资源和经历投入到这上面。同时曲率飞船和黑域的研究都需要基础科学的参与，看上去遥遥无期。还面临着政治上的问题，光速飞船逃亡因为只能保留少部分地球人，这导致了生存权的不平等违背了人类的基本价值观。黑域安全声明会让人类从此被禁锢于太阳系而且低光速下人类的生存质量极低。因此人类对这两个计划的投入的资源也有限。
程心与艾AA继续经营星环集团，程心希望做一些对人类有意义的事情，能够利用星环集团的资源进行光速飞船的研究。而艾AA更加务实一些，她计划通过利用星环集团参与掩体工程的建设，获取大量的财富，然后利用这些财富进行光速飞船的研发。
一零四广播8年（年）——航迹
就在人类同时向三个方向开展研究的时候，人们也开始建立黑暗森林打击预警系统。黑暗森林打击到来的时候，太阳可能受到光粒的袭击，光粒的速度非常接近光速，但由于有质量不可能达到光速。而光粒辐射是达到光速的，因此这二者有一个时间差，这就留给了人类几小时到几天的预警时间。
观测站依旧沿用了一个军方人士和一个科学家的领导组合。负责观测的天文学家威纳尔在项目完工后立即接到军方的命令利用观测系统对三体星系进行观测。在观测过程中威纳尔发现了三体星系与奥尔特云附近的两处空间曲率异常。这显然是三体舰队进入与脱离光速产生的航迹。这种航迹有很大尺度可以被外星文明观测到。一旦被观测到就说明附近有光速飞船出现，也就证明了附近的文明有光速航行能力非常危险。如果周围有恒心的坐标被标记，就会立刻被进行打击。这也就是智子曾经说过，三体星系从远处看来更加危险的原因。
威尔逊知道人类可能正在进行光速飞船的研究，这项研究的进度根本没人知道很。有可能现在人类已经取得了突破，很有可能这种微小的突突破会产生微小的航迹被高等文明探测到，立刻引发打击。
威尔逊决定立即以紧急呼叫的形式通知地球这个消息。
一零五广播8年（年）——黑暗森林打击误报
由于不在正常的通讯时间，威尔逊的这个呼叫信息被人误认为是黑暗森林打击的警报，从而引起了一系列的慌乱。此前由于畏惧黑暗森林打击的到来，一些有钱人已经在月球背面秘密准备的逃生飞船。这些飞船具有完善的生态循环系统，一旦发生打击他们可以利用仅有的时间飞到木星背面躲过打击，然后利用生态循环系统生存下来。
黑暗森林打击警报的到来立刻引起了地球上的一恐慌。有条件的人们都冲向太空穿梭机的发射基地，排队等待逃离地球的机会，尽管对于大部分人来说这都是徒劳的，没有恒星级飞船他们也就是多活一段时间而已。但求生欲还是驱使着他们不断涌向发射场。然而发射场的发射能力有限，大部分人注定无法逃离。
程心和艾AA也来到了发射场准备前往月球。在这里他们遇到了一个无助的教师，教师希望她们能带着孩子离开，但是艾AA考虑到飞船的运载能力，最后只能用脑筋急转弯的形式选择了三个聪明的孩子带上了飞船。
此时发射港已经被人群急忙，为了逃生一些太空穿梭机竟然在等待区强行进行发射，由于周围人群密集，很多人被发射的火焰活活烧死。
艾AA见状也决定发射，但程心处于良心阻止了她，她宁可自己被毁灭也不愿意加害别人。艾AA别无他法，只能用步枪攻击了周围的太空穿梭机。受到步枪攻击后，太空穿梭机会受到损害，系统自动判定无法起飞。
所幸最后证实一切虚惊一场，但全球各地都出现了在人群中强行发射的惨剧造成了一万人以上的伤亡。
一零六广播8年（年）——禁止光速飞船法案
黑暗森林打击误报的结果最终导致了禁止光速飞船法案。这其中有两个原因，首先光速飞船等同于逃亡主义。这次骚乱某种程度上就是这种逃亡的预演，人们也看到了为了争取生存的机会，人类自相残杀的丑态，加剧了人类作为一个整体对星际逃亡的厌恶。同时一些富豪在秘密建造逃亡飞船的消息被爆出，更刺激了人类对于生存权平等的追求。
更加重要的是这次误报让人们发现了一个事实那就是光速飞船的航迹会被高等级文明探测到，加速打击的到来，一旦进行光速飞船的开发就会暴露人类的位置，这对人类是非常不利的。因此很快光速飞船的研发就受到了国际社会的严厉禁止，研究光速飞船被认定为严重的犯罪几乎与反人类罪相当。
艾AA原本也为程心建造了一艘恒星级飞船，位于木星轨道。她建议程心去木星办公，一旦打击发生，利用这艘飞船，程心进可以向远方航行，退可以利用飞船的生态循环系统安度余生。但程心拒绝了艾AA建议，出于对人类和云天明的愧疚，程心决定留在地球上与人类共患难。
黑暗胜利打击警报的发出者纳尔逊和瓦西里受到了严厉惩处，当两个人看得很开，因为他们认为自己的行为最终是有意义的，后人会证明一切。
一零七广播11年（年）——掩体实验
由于黑域研究一筹莫展，光速飞船方案被一票否决，人类将大量的精力投入到掩体计划中。星环集团在艾AA的运营下也渐渐发展壮大。程心一直没有放弃光速飞船的方案私下里也在做些努力，但由于严格的限制条件，这种努力收效不大。
这一年世界政府为了增强人类对于掩体计划的信心。决定进行一项实验，那就是在太空中设置一个巨大的石块来模拟木星，同时在远处引爆一颗氢弹。为了让实验更有噱头，世界政府召集了一批志愿者驾驶飞船躲在这块巨石后，验证掩体计划的可能性。
出于宣传星环集团的目的，艾AA也让程心参加了实验。在实验过程中程心再一次遇到了维德。维德在监狱中已经服刑了11年，他出狱以后在他的周围依旧聚集了一些认同他价值观的人。维德找到程心，他也明白程心希望研究光速飞船，但程心为人过于优柔寡断根本无法完成这个任务。他提出要求希望程心将星环集团的资源移交给他，由他来领导光速飞船的秘密开发。同时为了不对维德的计划造成干扰，程心必须冬眠。如果光速飞船开发成功所有荣誉归于程心，如果一切失败，维德等人也承担一切责任。
程心知道维德的为人，她一开始是拒绝的，但维德提醒她不要再犯第二次错误。程心曾经因为自己的优柔寡断放弃威慑，导致了严重的后果。如果再次因为自己断送了光速飞船，断送了人类，对于程心来说这是难以接受的，因此程心最终答应了维德的要求。
一零八广播11年（年）——承诺
程心最终选择答应了维德，但也提出了一个要求，那就是如果维德的行为有可能危害到人类，她将再一次被唤醒，那时候她有权利剥夺维德的一切权利。维德认为从事这种见不得光的研究难免在必要时刻做出非常举动。但在程心的一再坚持之下，维德最终妥协了。实际上以为维德的手段，他即使不遵守承诺，程心并没有反抗手段。程心和维德都知道这一点，但后续剧情中维德最终还是遵守了他的承诺。
艾AA得知这一切后，决定和程心一起冬眠，她还立下了flag维德一定会信守承诺，程心一定会有剥夺维德权利的那一天，那时候她还会和程心在一起，只不过这种结果对于程心可能比死更可怕。
关于维德后来为什么会遵守承诺，小说中没有提，个人有以下几个理解
首先，从几百年的历史变迁中维德明白，为了在这个宇宙中生存下去，一个文明必须不择手段，而人类却被很多生存之外的东西困住了手脚。人类多次化险为夷都是因为英雄的存在。但英雄能保护人类一时，但如果人类没有不择手段也要生存下去的决心，那终究是要灭亡的。只是时间早晚的问题。如果维德因为光速飞船与人类发生冲突，那就证明人类还没有这种决心，即使他能用手段闯过这一关，在他老死以后人类也会因为其他原因灭亡。在这里他给人类留下了一个选择的机会。
其次，维德的性格非常恶劣，属于严重抖M属性，他早就明白只要自己让程心遵守承诺，光速飞船的研究就会失败，人类也会灭亡，这个结果会让程心陷入比死亡更痛苦的状态。维德希望欣赏别人的痛苦，他也热衷于看到程心与人类在放弃生存以后受到的惩罚。
最后，从套娃的角度来说，如果维德遵守了承诺，自己也没有做到为了生存不择手段，这意味着自己也是宇宙中不合格的生命，也应该承担壮志未酬的一切痛苦。
所以总体来说维德后期遵守承诺很大程度上与他极端且扭曲的性格有一定关系。
一零九广播11年——掩体11年（-年）——时间洪流
维德接手星环集团以后立即开始招募人员，曹彬和毕云峰都加入了他的队伍。同时星环集团的规模急剧扩大在几年间扩大了10倍。维德则把星环集团的大部分利润都投入到光速飞船技术的开发。当然为了掩人耳目，维德的相关研发都是以研究低光速区域为借口进行的。二者在基础技术背景上还是有不少相似之处的，加上星环集团的行为并不出格因此世界政府虽有察觉，依旧是睁一只眼闭一只眼。
星环集团的发展初期，启动了两个巨大工程。首先是开始建立环日加速器，进行基础物理的研究，整个工程持续了17年，在广播28年也就是年完成。另一个就是星环城的建设，星环城位于木星，是一个专门为科学研究设立的太空城。
然而对于降低真空光速，一切研究依旧一筹莫展，最后走投无路的人们决定通过研究黑洞寻找可能的手段，掩体元年年开始，这项研究进行了11年，人们利用环日加速器生成黑洞然后将它注入到木卫13中，形成一个稳定的较大黑洞，夜以继日的研究，依旧没有成果。一个叫高way的研究人员，出于对黑洞的痴迷进入自己跳进了黑洞里，这项研究也最终被废弃。
到了广播62年（年），掩体计划基本完工人类开始向掩体世界移居，只有不到五百万人继续留守，掩体纪元正式开始。在这期间由于掩体中的生活设施并不完善，生活也变得非常艰辛，人类文明发生一次倒退，社会形态与人类整体性格退回到公元时代。
到了掩体5年，年，曲率引擎的研发出现了突破，如果要进行进一步的研发就不可能再遮掩下去。这时候掩体已经建成，维德认为人类应该不再对于黑暗森林打击过于敏感和惧怕，向世界政府公开了这个计划希望得到支持。但毫无疑问，这一切都受到了全人类的反对，维德又提出后续的实验可以在远离太阳系外层的太空中进行，但依旧遭遇到了反对。政府与星环集团的矛盾开始升级，政府也开始决定镇压和接管星环集团。
掩体11年，星环集团宣布独立，世界政府决定对其进行封锁和镇压。维德对此早有准备，从掩体7年开始，维德就利用环日加速器开始制作反物质，并将这些反物质制作成子弹。同时组建城市自卫队，意图与世界政府进行军事对抗。同时他还派遣一批自杀性袭击者潜入各个太空城中。随时准备利用反物质武器摧毁太空城，以此来威胁世界政府，并争取谈判的机会。
由于这些行动有可能造成大量的人员伤亡，根据与程心的约定，维德决定唤醒程心。
一一零掩体11年（年）——维德之死
程心在冬眠62年以后再一次被唤醒，迎接他的是曹彬，曹彬带一路上带着程心参观了掩体世界的各个太空城，让她了解了掩体世界的现状。曹彬同时也向程心说明了星环集团与人类政府对峙的现状。最后将她带到了星环城，在星环城内，维德接待了程心。在这六十多年中维德一直没有冬眠，生理年龄已经达到了岁。维德将程心领到一台装置前，剪下了程心的一根头发。然后将头发放到了装置上，在空间曲率的作用下，程心的头发向上移动了2cm。
这微小的2cm确实曲率引擎的一大步，从这开始维德预计能在50年内造出光速飞船。
之后维德向程心吐露了自己的计划他希望和联邦政府谈判，虽然星环城被人类太空舰队重重包围，但维德依旧可以依靠反物质武器殊死一搏，而为了获得谈判的筹码自杀袭击者已经潜入各太空城。只要程心同意维德的计划，他们立刻就会与人类社会谈判。
实际上如果维德能够震慑人类社会，那么这场谈判并不会造成任何伤亡。但程心明白，有一定的概率人类不会买维德的账本，一旦谈判破裂维德绝对会痛下杀手，这也会导致大量无辜生命的伤亡。为了杜绝这中可能，程心勒令维德投降。
尽管维德希望她在考虑一下，毕云峰也在一旁苦苦相劝，城市自卫队的士兵发出了坚毅的宣言，宣言中他们把浩瀚的宇宙与自由当作人类最伟大的梦想。但程心依旧把普通人的生命放在第一位，要求维德投降。
饱经风霜的维德最后选择了妥协，他解除了武装，对程心说道“失去人性失去很多，失去兽性失去一切。”
星环成叛乱后引起人类一片哗然，特别是缴获的反物质武器更加让普通人捏了把冷汗。维德等人的反人类行为受到了一致声讨。星环集团被没收充公，但部分财产被返还给了程心。维德被判处死刑。在临刑前，程心带着雪茄去看望他，维德只是默默的拿走了三根，他就要被处死，多余的他已经用不上了。
“谢谢你的雪茄”这是维德留给程心最后的话。
程心拿着剩下的雪茄，心中百感交集，她点燃了一根雪茄抽了起来，想到了云天明和自己的人生也想到了那个亦敌亦友的维德，在雪茄燃烧的烟雾中留下了泪水。
一一二掩体11年-掩体66年（-年）——曲率飞船
在星环城事件之后，曲率飞船的研究受到重大打击，维德被杀，曹彬与毕云峰相继被捕。但人类之中依旧有一部分人偷偷聚集起来进一步进行光速飞船的研究，而罗辑就成了这一批人的领导者。曹彬与毕云峰也在不久后出狱，加入了研究团队。
由于研究力量受到空前打击，在此后的35年内曲率飞船的研究飞船缓慢。直到掩体46年，年曲率飞船的研究才在水星基地大规模恢复。就在这个过程中，研究人员发现，实际上在曲率驱动的轨迹之中真空的光速竟然降低了。这是因为曲率驱动本身改变了空间结构。这样一来研究曲率驱动实际上和研究黑域是一回事。有了这个发现，人类政府开始与曲率飞船研发项目合作，因为这项研究给了人类更多的选择机会，向往自由的人类可以利用曲率引擎向太空中进发，而那些保守者也可以利用这些曲率引擎产生的轨迹永远和平的生活在太阳系中。
人类政府开始大力支持曲率引擎项目，当然受到逃亡主义的影响，这种支持依旧是秘密的。
到了掩体65年（年）人类终于制造出了三台曲率引擎。其中一台进行了短距离试航，回收以后被安装在了星环号飞船上。另外两艘试航时间较长要6年以后才能回收。
于此同时掩体61年（年）人类突然受到了两艘逃亡飞船上人类的引力波通讯，虽然没有告知他们的具体位置，从银河人类重新制造出引力波通讯设备来看，他们已经找到了新的家园重新恢复了科技。
一一三掩体66年（年）——歌者
歌者文明是宇宙中的一个高级文明，这个文明有着大量的清理飞船，在宇宙中利用超级武器攻击者可能具有文明的信息。在掩体66年，其中一首飞船来到了距太阳系约1光年处。在这里歌者发现了威慑62年（年）万有引力号发射的三体星系坐标。歌者顺着这个坐标进行观测发现三体星系已经被摧毁了。随后他看到了三体第二舰队飞船产生的轨迹，这才知道为何清理来的如此之快。
歌者文明是一个谨慎的文明，他立即开始搜索攻击三体星系光粒的来源，但一无所获，这说明这个光粒也是从一艘未知飞船上发射出来的。歌者也无法通过光粒的轨迹定位发射源。随后按照流程歌者开始分析三体信息与其他文明的通讯记录，就这样他发现在几个世纪前，叶文洁通过太阳反射增益与三体世界的通讯往来。正是这此检索暴露了地球的位置，歌者继续翻阅地球的通讯信息，又发现了罗辑发射的咒语。歌者感到非常奇怪，在叶文洁与三体人的通话中，叶文洁回复了三体人的信息暴露了地球的位置，显然地球人并不知道位置暴露的危害。但是后来罗辑又通过发射咒语让高等文明摧毁了一颗恒星，这证明地球文明是知道黑暗森林法则的。
歌者觉得地球文明很有意思，因此决定启动大眼睛进程查看一下。但很快被飞船的长老阻止，对目标恒星的详细观测非常耗费资源还不如直接进行打击。歌者觉得地球文明非常危险，因此决定进行攻击。起初他决定用光粒进行攻击，但是在看了一眼太阳系的结构以后发现由于太阳系内有一些巨行星可以构成掩体和死角，单纯摧毁太阳无法灭绝太阳系内的文明。因此他向长老申请用二向箔。二向箔是二维打击武器，但是一旦使用就无法停止，长期下去会导致宇宙二维化，但长老很轻易地就批准了申请。这让歌者有一种不好的预感，自己的文明在与其他文明的战争中处于劣势，很有可能要准备二维化了。
二维化世界一定是艰难的，然而为了生存一切代价都可以付出。就这样歌者向太阳系发射了二相箔。
一一四掩体67年（年）——二相箔
在歌者发射二向箔后一年，人类的监控系统捕捉到了歌者飞船的痕迹，也检测到了这艘飞船向太阳系发射了什么东西。由于二向箔发射速度接近光速，因此此时它已经到达太阳系了，二相箔到达太阳系后迅速减速，这样人类就可以派遣飞船对其进行捕获和考察。
人类发现二相箔质量非常小，而且飞行方向偏离太阳，心中稍微松了口气。但是又因为高等文明发射的并非是光粒，而是一个位置物质，人类不免又有一些担忧。就这样两艘可靠飞船启示号和阿拉斯加号前往进行捕捉和考察。
考察队的指挥官是瓦西里将军，他曾经在多年前参与了黑暗森林打击的误报。随船的科学家名叫白ic，生于危机纪元后期，是丁仪苏醒以后带的物理系学生。白ic与危机纪元末冬眠，直到掩体45年才苏醒。他曾经见证了丁仪考察水滴，并且隐隐约约地感觉到这一次他将和他的老师一样去面对前所未有的力量。
任何光学和无线电设备都无法观测到二向箔，考察队只能通过二向箔的引力波进行观测。在精确定位之后又派出了一艘小型飞船进行近距离的捕获。这个过程中人们发现，二向箔非常薄和轻巧但却能够发射引力波，这一般都是大质量物体才能做到的。另外它就像幽灵一样不与任何物质发生作用。
随后的几天，二向箔的引力波逐渐减小，最后消失。就当众人以为二向箔自我蒸发的时候，参加考察的小型飞船却发生了意外，两名考察队员连带飞船都被二维化了。白ice这才意识到，二向箔实际上是一片二维空间，之前观测到的引力波实际上是它的封装力场，如今力场消失了，周围的三维空间正迅速地向二维空间跌落。
得知这个情况后，考察队立即启动飞船逃离，可是却发现无论飞船如何加速都无法逃脱二维话区域。白ICE经过计算发现二维化的逃逸速度需要达到光速，而人类根本没有制造出光速飞船。
这时候白ice和瓦西里突然想到了云天明的故事，里面针眼画师的画实际上是一个非常明显的暗示。云天明没有加入任何伪装，为的就是把这个最重要的情报传递出来。然而一切都晚了，人类自作聪明以为能依靠掩体逃避打击，殊不知高等文明对于太阳系的结构了如指掌，他们选择了最有效的打击手段。
在最后的时刻，考察队向人类社会报告了二维化打击的消息，随后放弃加速，首先坠入二维空间中。
一一五掩体67年（年）——二维化
在得知降维打击的消息后，人类社会一片悲观，由于没有光速飞船人类根本没有逃离的手段。而之前掩体计划所做的种种准备也就变成了一场空。在绝望中国际社会终于不再将逃亡主义认定为非法，有条件的人本着最后的求生欲驾驶飞船飞向太空，然而最终也就是多活几天而已。
然而他们不知道的是人类还有最后一艘逃亡飞船，曹彬唤醒程心和艾AA希望她们利用最后的逃亡飞船去冥王星接罗辑然后一起离开。但是这个过程要全程保密，否则光速飞船一定会引来无数人争夺。他谎称让程心和艾AA去冥王星找罗辑，利用最后的时光留下人类在宇宙中存在过的印记。
程心与艾AA驾驶飞船来到了冥王星，罗辑在这里领导建设地球文明博物馆，而此时博物馆的工作人员早就逃离了，整个博物馆就剩下罗辑一个人。罗辑带着程心和艾AA参观了博物馆内的文物。人们一直在研究如何将文明的印迹以亿万年为单位保存下去，然而人类所有的先进记录手段都无法做到。最后只能将字刻在石头上，当然这样所能存储的信息量是非常有限的。
在最后时刻罗辑倒是恢复了原来的性格变得轻佻起来。他让程心和艾AA把有价值的艺术品都搬到了星环号上。在这个过程中他看到了那副蒙娜丽莎，几个世纪前他曾经和庄颜在这幅画像前眉目传情，幸福的回忆让这个两百岁的老人不禁痛哭流涕。
太阳系的二维化依旧在继续，太阳，木星，土星还有人类曾经的家园通通灰飞烟灭。程心与艾AA登上飞船，准备将这些艺术品扔到漫漫太空中，就在这时候罗辑突然告诉她们，她们乘坐的星环号是人类唯一的光速飞船。她们可以带着这些艺术品逃离太阳系。
在程心的惊讶与艾AA怎么不带两个男人的吐槽中。罗辑诉说了人类发展光速飞船的历史。程心再一次意识到，真是因为自己阻止了维德让光速飞船研究推后了宝贵的35年才导致太阳系人类的灭绝。她陷入深深的痛苦与自责中，她想死，可是她死后艾AA又该怎么办呢。艾AA也明白她再次遇到了比死更可怕的事情，面对绝望的程心她想到了云天明的约定。程心和云天明曾经约定过再次见面的地点——DX，他们的星星。随着程心的口令，星环号以光速向着那颗连接着三个人命运的星星出发。
在众多逃离太阳系的飞船中，有人观察到了星环号异常的速度，他们明白这就是传说中的光速飞船。他们试图夺取星环号，但一切的努力终究是徒劳，随着一声绝望的嚎叫，太阳系人类就只剩下了程心和艾AA。
一一六银河元年（年）-银河年（年）——银河人类
这里补充一下银河人类的历史，在这一段的记录中实际上存在着几个重大bug，这个bug的产生主要是作者在写作的过程中没有考虑光速旅行导致的时间效应，以及在宇宙尺度上时间和空间是有关联的。这导致如果将银河人类的历史和他们在宇宙中的位置结合起来分析会得出非常多荒谬的结果。
另外由于第三部中回避了危机元年为7年的设定，因此导致具体年表与第三部目录年表略有差别，最后按照计算程心到达DX的时候实际上应当为银河年。
银河元年目前确定为年，这时候蓝色空间号已经在太空中航行了65年，65年间他们航行的距离为1.3光年左右。
此后蓝色空间号与万有引力号开始向新世界航行。在掩体61年（）地球收到了两艘飞船发射的引力波。按照飞船的最大飞行速度，此时他们距离太阳18光年左右。
根据关一帆描述两艘飞船到达第一世界的时候应当在银河（）年，第一世界初步改造以后具备可呼吸大气需要到银河（）年前后。如果两艘飞船保持原有速度飞行，第一世界距离太阳32光年左右。
因此就有了第一个bug那就是两艘飞船在飞行过程中就获得了发射引力波的能力。而按照设定他们在到达新世界之前都没有能力发展科技。
大约在银河（）年前后银河人类造出了光速飞船。
这里又出现了第二个bug，在银河年他们最多只能在太空中继续飞行光年，而DX距离太阳光年，就算银河人类的殖民地在DX与太阳之间的连线上，关一帆也根本无法到达DX。甚至就算他们到达第一世界以后立即搞出光速飞船，最多也就能飞到距离地球光年的位置。
截至关一帆到达DX时，银河人类已经在太空中拥有了4个殖民地，另外两个依旧太拓荒中。
其中第三世界由于坐标意外暴露，最后变成了黑域从时间来看，第三世界距离DX应当在光年以内。
关一帆在银河（）年苏醒，如果他苏醒的时候在第四世界的话，那么第四世界距离DX不到5光年。
银河人类的科技有了长足的进步，发也窥视到了宇宙的部分真相。他们还派出了末日飞船，为的就是见证宇宙的终结。
关于银河人类的众多bug导致银河人类的历史进程非常混乱，很多细节难以自圆其说，如果一定要圆只能说银河人类钻了虫洞或者能够传送了。
一一七银河年（年）-我们的星星
程心和艾AA坐着飞船终于来到了DX，由于在旅途中飞船一直发射引力波，正在DX上考察的关一帆收到了信息，决定留下来等待她们。艾AA也终于看到了她在几个世纪前发现的两颗行星，这两颗行星中一颗为蓝色有生命，另一颗为灰色没有生命迹象。
在关一帆的引导下，星环号成功在蓝星降落。关一帆向程心介绍了银河人类的发展状况，以及他们在这两颗行星的考察任务，那就是安装探测器，监视经过的外星飞船。关一帆感叹这颗行星环境非常好，却因为有大量外星人在附近根本无法定居。程心则和关一帆讲述了太阳系已经毁灭的现实。关一帆表示二维化的太阳系已经不可见了，只会在那个地方留下一个神秘的引力源头。
程心想到了云天明，问起了三体第一舰队的情况。关一帆却说，三体第一舰队不知所终，而第二舰队和第一舰队可能根本就没有汇合。60年前第二舰队和其他外星文明遭遇血战一场，最后也不知道战斗的结果如何。
一一八银河年（年）-死线
关一帆准备稍微休息一下就带她们回到银河人类的定居点开始新的生活。就在他们要启程的前一天夜里，关一帆布置的探测器突然传来警报，这表明灰星上有外星人的飞船经过。关一帆立刻决定前去察看。程心则认为可能是云天明来找她了因此也执意一同前往，最后只留下了艾AA一个人留守。
关一帆和程心乘坐着亨特号飞船一同前往灰星考察，在旅途中关一帆又和程心说起了超级文明的战争以及宇宙中三与三十万综合征的真相。宇宙中的生命为了生存可以将物理规律和数学规律做成武器，甚至不惜将自己改造成低纬生物。程心被如此残酷的现实深深震撼。
二人来到灰星上，发现了几道光速引擎产生的航迹。产生航迹的光速引擎异常强大，航迹内的光速被降低到了0，这被称为死线。关一帆判断，这是宇宙中的归零者的杰作。这些外星文明希望通过将宇宙中的光速降低到0达到重启宇宙重新恢复宇宙田园时代的目的。
死线异常危险，一旦受到扰动就会迅速扩大，把整个恒星系都变成低光速黑域。因此关一帆决定立即和程心撤离。就在他们撤离回到飞船上的时候，飞船里突然传来了艾AA的呼叫。原来是云天明到了，他也收到了程心的引力波通讯并且立刻赶了过来，还给程心带来了礼物。这也证实了关一帆的一个猜测，那就是三体第一舰队很可能就在附近找到了殖民地。
然而云天明并不知道这个星系内存在死线，他乘坐的光速飞船在减速是产生的航迹对死线产生了扰动，导致了死线的扩散，最终将整个星系变成了黑域。
一一九银河年（年）-错过
在DX星系变成黑域的过程中，程心正和关一帆驾驶着太空穿梭机准备降落到蓝星。就在这时候整个星系都变成了低光速黑域。在低光速下物理规律有很大不同，太空穿梭机的一切控制，计算，动力设备都无法使用。程心也因此陷入了慌乱中，好在银河人类在研发光速飞船的时候为了应对这种突发情况做了充分的研究。
关一帆立刻启动了手动设备，引导程心穿上了传统的电加热宇航服，然后利用氧气钢瓶回复了驾驶舱内的压力。由于量子计算机和常规计算机都无法使用，关一帆启动了备用的神经元计算机，等到穿梭机的功能恢复以后就可以利用反物质引擎降落到恒星表面。计算机的启动需要12天的时间，因此二人只能进入短暂的冬眠状态。
然而在进入黑域的时候他们乘坐的太空穿梭机正在以非常高的速度运行，这个速度已经接近黑域内的光速了。由于相对论效应，尽管他们在飞船内只待了12天时间，但对于云天明和艾AA的参考系来说，可能已经过去了千万年。程心与云天明终究是错过了。
一二零黑域年（年）-我们的星星
程心和关一帆终于降落到了蓝星，此时沧海桑田，蓝星上的生态环境已经明显发生了改变，没有云天明和艾AA甚至没有任何智慧文明活动的痕迹。关一帆对蓝星上的样品进行采样，通过检测同位素衰变，才知道时间已经过去了万年。任何与云天明和艾AA相关的东西都不可能留存下来。
突然程心想到了艾AA曾经和自己在冥王星上与罗辑的对话。如果要把信息保留尽可能久一些，唯一的手段就是把字刻在石头上。但是艾AA也在场，如果她们希望留下什么信息给程心一定会用这种方法。
程心让关一帆对蓝星的地层进行扫描，终于找到了艾AA与云天明留下的信息：他们度过了幸福的一生，同时给程心和关一帆留下了一个小宇宙，希望他们能够在小宇宙中躲过宇宙坍缩的命运，迎接新宇宙的田园时代。
关一帆和程心试图想象云天明的生活会是怎样，他可能与艾AA繁衍出了一个文明，但即使那个文明延续了一千万年,后面的八百九十万年也足以抹去它的一切痕迹
就在他们感动于两个人十八万个世纪前的幸福时，云天明留给程心的小礼物检测到了程心的到来，它缓缓地浮上了地面，向程心打开了通往另一个世界的大门。
一二一时间之外-我们的宇宙
程心与关一帆进入这个空间之后，才发现这个空间在时空上是封闭的，实际上就是一个小型宇宙。这个宇宙的尺度在0米左右，里面按照公元纪年的农庄进行布置。在检测到程心之后，小宇宙内的智子苏醒了，智子只存储了在地球时候的记忆。程心向她打听云天明的情况，她表示云天明虽然有操作小宇宙的权限但始终没有再进来过。
三体和银河人类的研究都表明，宇宙最后会开始收缩然后重新大爆炸。宇宙实际上是超膜上的一个空泡，大宇宙相当于一个巨大的空泡，小宇宙则是人工在超膜上建立的小空泡，然后再从打宇宙中搬入各种生活设施形成的。在小宇宙中生活的同时打宇宙的时间正在飞速流逝。程心和关一帆只要在小宇宙里苟十年就能等到大宇宙重获新生。智子会检测大宇宙的状态，一旦发生这种情况她就会引导程心和关一帆回归大宇宙在宇宙的田园时代中开始新的生活。
从后程心和关一帆在小宇宙内生活了下来，他们在智子的帮助下过着农业生活，同时也在学习三体人的科学文化知识。程心也开始撰写她的回忆录。
一二二时间之外-超膜广播
就在二人畅想未来的美好生活时，关一帆随着对三体知识的深入学习。发现了一个隐患，那就是宇宙可能是完美的，大宇宙的物质产生的引力可能只能刚好让大宇宙进入坍缩状态。如今各个文明都在搞小宇宙，不断把大宇宙的物资搬运进来，可能最后就会导致大宇宙无法坍缩，最后在热寂中结束生命。智子则表示不用担心，三体人做过研究，大宇宙的质量是足够的。
终于在某一天智子慌张的来到二人面前，原来他们的小宇宙收到了大宇宙的超模广播。这种广播需要消耗极大能量，是神级文明才能做到的。广播的信息非常短，但是却是用宇宙内不同文明的语言发布的。
终于在这个包含一百五十七万语言的信息中，程心看到了地球和三体的文字。宇宙中曾经出现过大量的文明，但这些文明大部分都没有生存延续下来，而是消失于茫茫太空之中，一点痕迹都没有留下，甚至没有人知道他们存在过。然而在这个广播中看到地球和三体的文字，这就证明地球与三体虽然已经毁灭，但依旧在宇宙中留下了自己的印迹，对宇宙有着重大的影响，值得被神级文明重视与铭记。看到这一幕程心，关一帆和智子拥抱在了一起。在银河系猎户旋臂的漫漫长夜中,有两颗文明的流星划过,宇宙记住了它们的光芒。
通讯的信息非常简短，那就是随着小宇宙的制造，大量的大宇宙物质被搬运到小宇宙中，大宇宙质量流失将无法坍缩。这个信息就是要求所有小宇宙的居民返还质量回归大宇宙。
一二三时间之外-死神永生
此时大宇宙内的时间已经飞速流逝了，DX甚至都已经熄灭了，宇宙空间很可能都不在是三维的了。此时回归大宇宙将是异常凶险和艰难的行为。智子建议二人依旧留在小宇宙中，至少可以安度余生。但程心想到如果所有小宇宙的人都这么想，都只考虑自己的利益，那么大宇宙一定会毁灭。所以程心坚持着要回归大宇宙，智子见无法说服她，就操纵小宇宙的出口让其在超膜进行空间跳跃，终于在三个月后找到了一个适宜生存的环境。
随后智子拆除了小宇宙内的全部设施和程心以及关一帆驾着飞船回归大宇宙。在临别之时，程心制作了一个5公斤的生态球还留下了一个记录地球和三体文明历史的存储器。因为在回归大宇宙后关于地球与人类的一切记忆都会在宇宙坍缩中被摧毁。而程心希望这个小小的生态球和存储器能在小宇宙中存在下去，在未来新生的宇宙中证明人类曾经的存在。关一帆虽然有些担忧，因为宇宙可能非常精密，甚至会因为缺少一个原子而无法坍缩，但还是默许了程心的行为。
小宇宙中还有成千上万的文明，他们也像程心一样重视了一些生存之外的东西，比如文明的记忆和对过往的思念等等。他们也把自己的记忆和纪念品留在了小宇宙中。然而宇宙是残酷的，只有把自己全部的力量都投入到生存之中，不择手段的前进才能生存下来，才能成为宇宙中合格的文明。而正因为宇宙之中有着大量的文明看中生存之外的事情，这也将最终导致宇宙的灭亡。
完结撒花
